212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3995 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_3995  transport-associated  100 
 
 		 182 aa  349  1e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000543546  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1415  transport-associated  72.22 
 
 		 184 aa  222  2e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3707  transport-associated  67.58 
 
 		 181 aa  212  1.9999999999999998e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.101636  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1317  transport-associated  70.45 
 
 		 181 aa  211  3.9999999999999995e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1405  transport-associated protein  73.81 
 
 		 184 aa  210  7.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1441  transport-associated  72.62 
 
 		 184 aa  207  5e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2939  transport-associated  72.02 
 
 		 184 aa  205  3e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.537293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4133  transport-associated  56.59 
 
 		 188 aa  197  6e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2676  transport-associated  70.83 
 
 		 182 aa  196  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2851  transport-associated  70.83 
 
 		 182 aa  196  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.884447 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2744  transport-associated  69.64 
 
 		 182 aa  193  1e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001941  putative hyperosmotically inducible periplasmic protein  55.49 
 
 		 183 aa  179  2.9999999999999997e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01237  putative hyperosmotically inducible periplasmic protein  60.37 
 
 		 175 aa  176  2e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.315155  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0264  transport-associated  45.3 
 
 		 187 aa  149  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.47721  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0258  histidine kinase  38.24 
 
 		 222 aa  104  7e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.469068 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5094  transport-associated  32.76 
 
 		 273 aa  91.3  6e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0983587  normal  0.219919 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0177  transport-associated  35.66 
 
 		 276 aa  88.6  4e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0149  transport-associated  32.43 
 
 		 273 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.798997 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0134  transport-associated protein  32.43 
 
 		 273 aa  85.5  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.892998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0151  transport-associated  33.11 
 
 		 273 aa  84.7  7e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2261  transport-associated  29.35 
 
 		 282 aa  84.3  8e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2185  transport-associated  34.44 
 
 		 255 aa  80.9  0.000000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0333  hypothetical protein  31.64 
 
 		 279 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0262  transport-associated protein  36.48 
 
 		 279 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1784  transport-associated  28.65 
 
 		 275 aa  74.7  0.0000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0010501  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0826  transport-associated  29.49 
 
 		 245 aa  68.9  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0362569 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3503  periplasmic protein  33.78 
 
 		 204 aa  68.6  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0836  periplasmic protein  33.78 
 
 		 204 aa  68.9  0.00000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3632  periplasmic protein  33.78 
 
 		 204 aa  68.6  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0552  periplasmic protein  30.43 
 
 		 202 aa  67  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.783524  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2300  transport-associated  34.46 
 
 		 217 aa  66.2  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.53534  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0454  periplasmic protein  32.5 
 
 		 202 aa  65.1  0.0000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.390695  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3587  transport-associated  32.54 
 
 		 191 aa  65.1  0.0000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3297  transport-associated  30.87 
 
 		 201 aa  63.5  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.173268  normal  0.854509 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1193  transport-associated protein  30.46 
 
 		 199 aa  62.8  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5932  transport-associated protein  31.21 
 
 		 216 aa  62  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0055  putative osmotically inducible protein  32.81 
 
 		 219 aa  60.8  0.00000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2553  hypothetical protein  28.77 
 
 		 278 aa  59.3  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6056  transport-associated  32.19 
 
 		 226 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.822447  hitchhiker  0.00012166 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4882  periplasmic protein  31.08 
 
 		 205 aa  58.2  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0715597  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4917  periplasmic protein  31.08 
 
 		 205 aa  58.2  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.292031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4969  periplasmic protein  31.08 
 
 		 205 aa  58.2  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4976  periplasmic protein  31.08 
 
 		 205 aa  58.2  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.163142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4815  periplasmic protein  31.08 
 
 		 205 aa  58.2  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4973  periplasmic protein  29.44 
 
 		 201 aa  57  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00297721  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4923  periplasmic protein  29.95 
 
 		 201 aa  57  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.497608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0653  periplasmic protein  30.41 
 
 		 204 aa  57  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4919  periplasmic protein  29.9 
 
 		 201 aa  57  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.618733  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04251  periplasmic protein  29.44 
 
 		 201 aa  57  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.368391  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3623  transport-associated  29.44 
 
 		 201 aa  57  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4610  periplasmic protein  29.44 
 
 		 201 aa  57  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0762495  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04217  hypothetical protein  29.44 
 
 		 201 aa  57  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.310729  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2077  transport-associated  31.61 
 
 		 307 aa  57  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.735501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0535  periplasmic protein  31.97 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.388761  hitchhiker  0.00819185 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3681  periplasmic protein  29.44 
 
 		 201 aa  57  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.261916  hitchhiker  0.00179473 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4234  transport-associated  28.28 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.855371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5456  hypothetical protein  46.88 
 
 		 114 aa  55.1  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.469146  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62690  hypothetical protein  46.88 
 
 		 114 aa  55.1  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3436  transport-associated  45.71 
 
 		 127 aa  55.1  0.0000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.865751  normal  0.0604848 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1195  transport-associated protein  29.8 
 
 		 192 aa  54.7  0.0000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3603  transport-associated  42.19 
 
 		 116 aa  54.7  0.0000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.335448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5888  periplasmic protein  28.93 
 
 		 201 aa  54.7  0.0000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.223121  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43670  Transport-associated protein  45.31 
 
 		 120 aa  54.3  0.0000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.226738  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0414  OsmY domain-containing protein  30.71 
 
 		 215 aa  53.9  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3585  periplasmic protein  31.58 
 
 		 218 aa  54.3  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2206  transport-associated protein  32.48 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0335  putative osmotically inducible protein  25.86 
 
 		 202 aa  52.8  0.000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.161455  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3465  periplasmic protein  27.59 
 
 		 202 aa  52.4  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1025  OsmY domain-containing protein  29.71 
 
 		 197 aa  52.8  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0116  OsmY domain-containing protein  31.43 
 
 		 215 aa  52.4  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.567152  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0155  OsmY domain-containing protein  28.26 
 
 		 216 aa  52.4  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0140  putative phospholipid-binding protein  31.43 
 
 		 237 aa  52.4  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0180  OsmY domain-containing protein  28.26 
 
 		 216 aa  52.4  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04303  putative phospholipid-binding domain family  43.75 
 
 		 120 aa  52.4  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1280  OsmY domain-containing protein  31.43 
 
 		 215 aa  52.4  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.84893  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1324  OsmY domain-containing protein  28.26 
 
 		 216 aa  52.4  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2759  putative phospholipid-binding protein  28.26 
 
 		 216 aa  52.4  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2802  putative phospholipid-binding protein  31.43 
 
 		 215 aa  52.4  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2616  putative phospholipid-binding protein  28.26 
 
 		 216 aa  52.4  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4565  transport-associated  28.26 
 
 		 217 aa  52  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.192769 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1063  OsmY domain-containing protein  31.43 
 
 		 215 aa  51.6  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4432  transport-associated  28.26 
 
 		 217 aa  52  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0632  transport-associated  28.57 
 
 		 218 aa  52  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2660  putative phospholipid-binding protein  31.43 
 
 		 237 aa  51.6  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3575  transport-associated protein  29.23 
 
 		 220 aa  51.2  0.000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.913691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6209  transport-associated  30.53 
 
 		 215 aa  51.2  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.716513 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0453  OsmY domain-containing protein  29.71 
 
 		 197 aa  51.2  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584382  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2836  transport-associated  34.23 
 
 		 240 aa  51.2  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0106  hypothetical protein  34.4 
 
 		 190 aa  50.4  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.277757  normal  0.0163837 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1108  transport-associated  29.84 
 
 		 216 aa  50.4  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3328  transport-associated  33.33 
 
 		 217 aa  50.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.686073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5879  transport-associated protein  30.3 
 
 		 215 aa  49.7  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1220  transport-associated protein  28.99 
 
 		 214 aa  48.9  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1226  transport-associated protein  33.63 
 
 		 217 aa  48.9  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.528686  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0589  phospholipid-binding domain-containing protein  26.17 
 
 		 183 aa  48.9  0.00004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1200  transport-associated  28.38 
 
 		 217 aa  48.9  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.649848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3875  transport-associated  25.14 
 
 		 214 aa  48.5  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.835805  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0421  transport-associated protein  28.86 
 
 		 241 aa  48.5  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2264  transport-associated  30.65 
 
 		 216 aa  48.1  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0036  transport-associated  28.97 
 
 		 216 aa  48.1  0.00007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0240953  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>