162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_2939 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_2939  transport-associated  100 
 
 
184 aa  347  7e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.537293  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1415  transport-associated  99.46 
 
 
184 aa  345  2e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1441  transport-associated  98.91 
 
 
184 aa  343  1e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1405  transport-associated protein  97.01 
 
 
184 aa  287  6e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1317  transport-associated  87.64 
 
 
181 aa  277  8e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2744  transport-associated  86.83 
 
 
182 aa  242  3e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2676  transport-associated  85.63 
 
 
182 aa  237  5.999999999999999e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2851  transport-associated  85.63 
 
 
182 aa  237  5.999999999999999e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.884447 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3707  transport-associated  74.3 
 
 
181 aa  225  3e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.101636  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3995  transport-associated  71.67 
 
 
182 aa  220  9.999999999999999e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000543546  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4133  transport-associated  60.54 
 
 
188 aa  201  6e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01237  putative hyperosmotically inducible periplasmic protein  60 
 
 
175 aa  179  2e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.315155  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001941  putative hyperosmotically inducible periplasmic protein  55.19 
 
 
183 aa  177  9e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0264  transport-associated  50 
 
 
187 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.47721  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0258  histidine kinase  38.04 
 
 
222 aa  93.6  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.469068 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0177  transport-associated  37.5 
 
 
276 aa  91.7  5e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5094  transport-associated  33.9 
 
 
273 aa  82.4  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0983587  normal  0.219919 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0149  transport-associated  34.1 
 
 
273 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.798997 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0262  transport-associated protein  35.21 
 
 
279 aa  79  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2185  transport-associated  38.93 
 
 
255 aa  79.3  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0333  hypothetical protein  34.78 
 
 
279 aa  78.6  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0134  transport-associated protein  34.23 
 
 
273 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.892998  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2261  transport-associated  34.97 
 
 
282 aa  73.9  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0151  transport-associated  34.46 
 
 
273 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1784  transport-associated  28.74 
 
 
275 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0010501  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1195  transport-associated protein  34.67 
 
 
192 aa  64.3  0.0000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2300  transport-associated  32.67 
 
 
217 aa  62  0.000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.53534  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0826  transport-associated  29.41 
 
 
245 aa  61.2  0.000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0362569 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4919  periplasmic protein  32.19 
 
 
201 aa  58.9  0.00000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.618733  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4882  periplasmic protein  31.97 
 
 
205 aa  58.5  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0715597  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4976  periplasmic protein  31.97 
 
 
205 aa  58.5  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.163142  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4815  periplasmic protein  31.97 
 
 
205 aa  58.5  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4969  periplasmic protein  31.97 
 
 
205 aa  58.5  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4917  periplasmic protein  31.97 
 
 
205 aa  58.5  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.292031  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3587  transport-associated  32.03 
 
 
191 aa  58.5  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04251  periplasmic protein  32.19 
 
 
201 aa  58.2  0.00000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.368391  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3623  transport-associated  32.19 
 
 
201 aa  58.2  0.00000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3681  periplasmic protein  32.19 
 
 
201 aa  58.2  0.00000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.261916  hitchhiker  0.00179473 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04217  hypothetical protein  32.19 
 
 
201 aa  58.2  0.00000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.310729  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4610  periplasmic protein  32.19 
 
 
201 aa  58.2  0.00000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0762495  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2553  hypothetical protein  32.33 
 
 
278 aa  57.8  0.00000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1193  transport-associated protein  31.33 
 
 
199 aa  57.8  0.00000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4973  periplasmic protein  32.19 
 
 
201 aa  57.8  0.00000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00297721  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0836  periplasmic protein  31.69 
 
 
204 aa  56.2  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0055  putative osmotically inducible protein  30.16 
 
 
219 aa  57  0.0000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5888  periplasmic protein  32.19 
 
 
201 aa  57  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.223121  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0653  periplasmic protein  30.82 
 
 
204 aa  57  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3632  periplasmic protein  31.69 
 
 
204 aa  56.2  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0552  periplasmic protein  33.1 
 
 
202 aa  55.8  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.783524  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4923  periplasmic protein  32.19 
 
 
201 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.497608  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3503  periplasmic protein  31.69 
 
 
204 aa  56.2  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1025  OsmY domain-containing protein  28.78 
 
 
197 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0454  periplasmic protein  33.1 
 
 
202 aa  55.5  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.390695  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0453  OsmY domain-containing protein  29.5 
 
 
197 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584382  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0155  OsmY domain-containing protein  28.78 
 
 
216 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1324  OsmY domain-containing protein  28.78 
 
 
216 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2759  putative phospholipid-binding protein  28.78 
 
 
216 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2616  putative phospholipid-binding protein  28.78 
 
 
216 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0180  OsmY domain-containing protein  28.78 
 
 
216 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0106  hypothetical protein  36.97 
 
 
190 aa  54.3  0.0000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.277757  normal  0.0163837 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5932  transport-associated protein  27.86 
 
 
216 aa  53.9  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2077  transport-associated  29.87 
 
 
307 aa  53.5  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.735501  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6056  transport-associated  28.97 
 
 
226 aa  53.5  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.822447  hitchhiker  0.00012166 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2956  transport-associated protein  29.58 
 
 
295 aa  52  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6209  transport-associated  31.54 
 
 
215 aa  51.6  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.716513 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0414  OsmY domain-containing protein  30.43 
 
 
215 aa  51.2  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1108  transport-associated  30.77 
 
 
216 aa  51.2  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0116  OsmY domain-containing protein  31.88 
 
 
215 aa  50.4  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.567152  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1280  OsmY domain-containing protein  31.88 
 
 
215 aa  50.4  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.84893  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2802  putative phospholipid-binding protein  31.88 
 
 
215 aa  50.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0140  putative phospholipid-binding protein  31.88 
 
 
237 aa  50.4  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43670  Transport-associated protein  36.99 
 
 
120 aa  50.8  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.226738  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5879  transport-associated protein  30 
 
 
215 aa  49.7  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1063  OsmY domain-containing protein  31.88 
 
 
215 aa  49.7  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3297  transport-associated  29.05 
 
 
201 aa  50.4  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.173268  normal  0.854509 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2660  putative phospholipid-binding protein  31.88 
 
 
237 aa  49.7  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0535  periplasmic protein  30.82 
 
 
205 aa  50.4  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.388761  hitchhiker  0.00819185 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1220  transport-associated protein  32.23 
 
 
214 aa  49.3  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4565  transport-associated  26.95 
 
 
217 aa  49.3  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.192769 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4432  transport-associated  26.95 
 
 
217 aa  49.3  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3575  transport-associated protein  29.17 
 
 
220 aa  48.9  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.913691  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3328  transport-associated  30.77 
 
 
217 aa  48.9  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.686073  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4429  transport-associated  28.26 
 
 
215 aa  48.5  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2206  transport-associated protein  34.21 
 
 
195 aa  48.5  0.00005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4562  transport-associated  28.26 
 
 
215 aa  48.5  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.266043 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1151  transport-associated protein  29.32 
 
 
141 aa  48.1  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04303  putative phospholipid-binding domain family  45.16 
 
 
120 aa  48.1  0.00008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0224  transport-associated  34.51 
 
 
189 aa  47.8  0.00008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.130883  normal  0.197651 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7783  putative osmotically-inducible protein Y (precursor)  34.68 
 
 
220 aa  48.1  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.379132  normal  0.155349 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3436  transport-associated  43.55 
 
 
127 aa  47.8  0.00009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.865751  normal  0.0604848 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3691  transport-associated protein  29.13 
 
 
211 aa  47.4  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.310052  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4234  transport-associated  25 
 
 
215 aa  47.4  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.855371  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4254  transport-associated  33.87 
 
 
189 aa  47.4  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000113499 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0189  hypothetical protein  27.46 
 
 
215 aa  47  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.193269 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0204  hypothetical protein  31.4 
 
 
219 aa  47  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1642  putative periplasmic protein  39.71 
 
 
144 aa  47  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0830703  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1892  putative phophoslipid binding protein  26.99 
 
 
216 aa  46.2  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.953866 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7765  Smc22-1 ( osmotically inducible sensory protein)  32.03 
 
 
217 aa  47  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.705157  normal  0.17558 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3585  periplasmic protein  27.21 
 
 
218 aa  45.8  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2966  periplasmic or secreted lipoprotein OsmY  31.58 
 
 
219 aa  46.2  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000230813  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>