153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0189 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0189  hypothetical protein  100 
 
 		 215 aa  425  1e-118  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.193269 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4429  transport-associated  88.37 
 
 		 215 aa  363  2e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4562  transport-associated  88.37 
 
 		 215 aa  363  2e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.266043 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1220  transport-associated protein  56.07 
 
 		 214 aa  236  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1870  periplasmic phospholipid binding protein  53.95 
 
 		 216 aa  207  7e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.388852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2300  transport-associated  50.23 
 
 		 217 aa  206  2e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.53534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5932  transport-associated protein  50.93 
 
 		 216 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5912  transport-associated protein  49.77 
 
 		 216 aa  197  9e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.203256  normal  0.355197 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1226  transport-associated protein  48.37 
 
 		 217 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.528686  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6189  transport-associated  48.36 
 
 		 216 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.551844  normal  0.435123 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1108  transport-associated  50.7 
 
 		 216 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2622  transport-associated  49.3 
 
 		 215 aa  189  2e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0390  transport-associated  44.19 
 
 		 217 aa  184  6e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7765  Smc22-1 ( osmotically inducible sensory protein)  45.62 
 
 		 217 aa  185  6e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.705157  normal  0.17558 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1111  transport-associated  48.84 
 
 		 226 aa  184  7e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5562  transport-associated  53.49 
 
 		 216 aa  184  8e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.221455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3604  hypothetical protein  46.7 
 
 		 215 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.984998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0353  phospholipid binding protein  49.3 
 
 		 216 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2264  transport-associated  45.79 
 
 		 216 aa  181  1e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0431  transport-associated  49.06 
 
 		 215 aa  180  1e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.390186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4234  transport-associated  45.45 
 
 		 215 aa  178  4.999999999999999e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.855371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7783  putative osmotically-inducible protein Y (precursor)  43.46 
 
 		 220 aa  176  3e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.379132  normal  0.155349 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1892  putative phophoslipid binding protein  48.83 
 
 		 216 aa  175  4e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.953866 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1200  transport-associated  46.98 
 
 		 217 aa  175  6e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.649848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5544  transport-associated  47.32 
 
 		 216 aa  171  9e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.078197  normal  0.764141 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0186  hypothetical protein  45.07 
 
 		 217 aa  170  1e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.117611 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0204  hypothetical protein  43.19 
 
 		 219 aa  171  1e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5578  transport-associated  43.66 
 
 		 217 aa  171  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00026661  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4565  transport-associated  44.6 
 
 		 217 aa  169  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.192769 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4432  transport-associated  44.6 
 
 		 217 aa  169  2e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1909  transport-associated  47.2 
 
 		 215 aa  168  6e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.966808  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3808  transport-associated  44.19 
 
 		 216 aa  167  8e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2456  transport-associated  43.93 
 
 		 215 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.262468  normal  0.570841 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0155  OsmY domain-containing protein  51.64 
 
 		 216 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1324  OsmY domain-containing protein  51.64 
 
 		 216 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2759  putative phospholipid-binding protein  51.64 
 
 		 216 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2616  putative phospholipid-binding protein  51.64 
 
 		 216 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0180  OsmY domain-containing protein  51.64 
 
 		 216 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3328  transport-associated  44.29 
 
 		 217 aa  166  4e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.686073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1101  transport-associated  44.6 
 
 		 216 aa  165  5e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0139  transport-associated protein  46.76 
 
 		 223 aa  165  5.9999999999999996e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2613  transport-associated  46.26 
 
 		 214 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.574258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0425  transport-associated  46.26 
 
 		 214 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.379914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1063  OsmY domain-containing protein  46.76 
 
 		 215 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2660  putative phospholipid-binding protein  46.76 
 
 		 237 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0116  OsmY domain-containing protein  46.76 
 
 		 215 aa  161  7e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.567152  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1280  OsmY domain-containing protein  46.76 
 
 		 215 aa  161  7e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.84893  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2802  putative phospholipid-binding protein  46.76 
 
 		 215 aa  161  7e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0140  putative phospholipid-binding protein  46.76 
 
 		 237 aa  161  7e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1664  hypothetical protein  41.71 
 
 		 215 aa  160  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0800901  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0414  OsmY domain-containing protein  46.3 
 
 		 215 aa  158  5e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2881  transport-associated  47.39 
 
 		 216 aa  158  7e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1899  periplasmic phospholipid binding protein  44.79 
 
 		 233 aa  154  7e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.60597 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3886  transport-associated  45.79 
 
 		 214 aa  154  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.121  normal  0.085803 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3859  transport-associated protein  41.59 
 
 		 216 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.790334 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7784  putative osmotically inducible protein Y precursor  44.5 
 
 		 217 aa  153  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0602659  normal  0.220051 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1491  transport-associated  41.59 
 
 		 216 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1868  transport-associated  41.12 
 
 		 216 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.882392  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6897  transport-associated  38.14 
 
 		 217 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.35821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6209  transport-associated  42.33 
 
 		 215 aa  146  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.716513 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1025  OsmY domain-containing protein  51.3 
 
 		 197 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2606  transport-associated  46.45 
 
 		 216 aa  144  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0213477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5879  transport-associated protein  42.33 
 
 		 215 aa  144  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0417  transport-associated  45.97 
 
 		 216 aa  143  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.421605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0453  OsmY domain-containing protein  51.3 
 
 		 197 aa  142  4e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584382  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3634  transport-associated  42.2 
 
 		 228 aa  142  5e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000681524 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6133  transport-associated  46.75 
 
 		 178 aa  136  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1151  transport-associated protein  48.57 
 
 		 141 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4061  transport-associated  42.18 
 
 		 213 aa  115  3.9999999999999997e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.221026  normal  0.208315 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6056  transport-associated  36.22 
 
 		 226 aa  99  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.822447  hitchhiker  0.00012166 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7774  hypothetical protein  35.09 
 
 		 203 aa  98.6  6e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.194796  normal  0.37862 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6692  transport-associated  32.04 
 
 		 543 aa  73.6  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1784  transport-associated  26.48 
 
 		 275 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0010501  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2185  transport-associated  25.55 
 
 		 255 aa  67  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0454  periplasmic protein  31.97 
 
 		 202 aa  64.7  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.390695  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3503  periplasmic protein  33.33 
 
 		 204 aa  64.7  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3809  transport-associated  49.35 
 
 		 108 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.810583  normal  0.967769 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0836  periplasmic protein  33.33 
 
 		 204 aa  64.7  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3632  periplasmic protein  33.33 
 
 		 204 aa  64.7  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3502  transport-associated  52.17 
 
 		 108 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.260556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0552  periplasmic protein  29.93 
 
 		 202 aa  62  0.000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.783524  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2966  periplasmic or secreted lipoprotein OsmY  28.09 
 
 		 219 aa  58.9  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000230813  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1333  transport-associated  47.14 
 
 		 303 aa  57.8  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.286279 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2676  hypothetical protein  45.21 
 
 		 303 aa  57  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.462534  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1214  transport-associated  48.57 
 
 		 315 aa  57  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0393886  normal  0.108337 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2077  transport-associated  29.37 
 
 		 307 aa  56.6  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.735501  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2553  hypothetical protein  25.68 
 
 		 278 aa  55.5  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0653  periplasmic protein  30.99 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3008  transport-associated  42.86 
 
 		 106 aa  55.5  0.0000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.845377  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4133  transport-associated  31.91 
 
 		 188 aa  55.1  0.0000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0421  transport-associated protein  25.94 
 
 		 241 aa  54.7  0.0000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3600  transport-associated  29.71 
 
 		 175 aa  55.1  0.0000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0177  transport-associated  27.67 
 
 		 276 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0141  transport-associated  45.83 
 
 		 309 aa  52.4  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2437  CBS domain containing protein  31.97 
 
 		 628 aa  52  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000875184  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0826  transport-associated  27.67 
 
 		 245 aa  52  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0362569 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0333  hypothetical protein  24.24 
 
 		 279 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3707  transport-associated  31.01 
 
 		 181 aa  50.4  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.101636  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0262  transport-associated protein  24.24 
 
 		 279 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2956  transport-associated protein  22.9 
 
 		 295 aa  50.1  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>