105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1899 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1899  periplasmic phospholipid binding protein  100 
 
 
233 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.60597 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0140  putative phospholipid-binding protein  60.42 
 
 
237 aa  193  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0116  OsmY domain-containing protein  60.42 
 
 
215 aa  192  3e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.567152  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1280  OsmY domain-containing protein  60.42 
 
 
215 aa  192  3e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.84893  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2802  putative phospholipid-binding protein  60.42 
 
 
215 aa  192  3e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5879  transport-associated protein  55.96 
 
 
215 aa  191  8e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1063  OsmY domain-containing protein  59.9 
 
 
215 aa  190  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2660  putative phospholipid-binding protein  59.9 
 
 
237 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0414  OsmY domain-containing protein  59.38 
 
 
215 aa  189  4e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6209  transport-associated  51.96 
 
 
215 aa  188  7e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.716513 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1870  periplasmic phospholipid binding protein  48.82 
 
 
216 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.388852  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5932  transport-associated protein  47.4 
 
 
216 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1220  transport-associated protein  47.09 
 
 
214 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1111  transport-associated  49.48 
 
 
226 aa  161  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177622  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5562  transport-associated  47.92 
 
 
216 aa  156  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.221455  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6189  transport-associated  43.75 
 
 
216 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.551844  normal  0.435123 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5912  transport-associated protein  43.23 
 
 
216 aa  155  6e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.203256  normal  0.355197 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1108  transport-associated  46.88 
 
 
216 aa  155  6e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0189  hypothetical protein  44.79 
 
 
215 aa  154  8e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.193269 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0186  hypothetical protein  45.95 
 
 
217 aa  154  1e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.117611 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4432  transport-associated  44.79 
 
 
217 aa  152  4e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4565  transport-associated  44.79 
 
 
217 aa  152  4e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.192769 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4429  transport-associated  45.95 
 
 
215 aa  144  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4562  transport-associated  45.95 
 
 
215 aa  144  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.266043 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1226  transport-associated protein  41.08 
 
 
217 aa  141  7e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.528686  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5578  transport-associated  40.62 
 
 
217 aa  140  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00026661  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0390  transport-associated  37.62 
 
 
217 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1101  transport-associated  40.38 
 
 
216 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5544  transport-associated  40.69 
 
 
216 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.078197  normal  0.764141 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2300  transport-associated  39.58 
 
 
217 aa  137  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.53534  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1892  putative phophoslipid binding protein  41.18 
 
 
216 aa  135  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.953866 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0204  hypothetical protein  37.2 
 
 
219 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0353  phospholipid binding protein  42.65 
 
 
216 aa  131  9e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4234  transport-associated  39.15 
 
 
215 aa  127  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.855371  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1200  transport-associated  36.98 
 
 
217 aa  126  3e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.649848  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7765  Smc22-1 ( osmotically inducible sensory protein)  38.02 
 
 
217 aa  125  7e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.705157  normal  0.17558 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2264  transport-associated  37.5 
 
 
216 aa  123  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2622  transport-associated  38.62 
 
 
215 aa  118  7.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2456  transport-associated  36.07 
 
 
215 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.262468  normal  0.570841 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7784  putative osmotically inducible protein Y precursor  37.04 
 
 
217 aa  115  7.999999999999999e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0602659  normal  0.220051 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0155  OsmY domain-containing protein  46.35 
 
 
216 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1324  OsmY domain-containing protein  46.35 
 
 
216 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2759  putative phospholipid-binding protein  46.35 
 
 
216 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2616  putative phospholipid-binding protein  46.35 
 
 
216 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0180  OsmY domain-containing protein  46.35 
 
 
216 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2881  transport-associated  38.38 
 
 
216 aa  112  5e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3328  transport-associated  36.84 
 
 
217 aa  112  6e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.686073  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4061  transport-associated  39.47 
 
 
213 aa  110  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.221026  normal  0.208315 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1664  hypothetical protein  35.52 
 
 
215 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0800901  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0431  transport-associated  40.11 
 
 
215 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.390186  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3604  hypothetical protein  33.82 
 
 
215 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.984998  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6133  transport-associated  38.69 
 
 
178 aa  101  9e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3634  transport-associated  37.11 
 
 
228 aa  101  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000681524 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0139  transport-associated protein  35.94 
 
 
223 aa  99.8  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3808  transport-associated  35.94 
 
 
216 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7783  putative osmotically-inducible protein Y (precursor)  33.01 
 
 
220 aa  98.2  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.379132  normal  0.155349 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0453  OsmY domain-containing protein  46.51 
 
 
197 aa  96.7  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584382  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0417  transport-associated  39.46 
 
 
216 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.421605  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2606  transport-associated  40 
 
 
216 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0213477  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1025  OsmY domain-containing protein  46.51 
 
 
197 aa  95.9  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1909  transport-associated  33.33 
 
 
215 aa  95.1  7e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.966808  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6897  transport-associated  30.27 
 
 
217 aa  94  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.35821  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2613  transport-associated  35.52 
 
 
214 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.574258  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6056  transport-associated  32.97 
 
 
226 aa  89.7  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.822447  hitchhiker  0.00012166 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3886  transport-associated  36.76 
 
 
214 aa  90.1  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.121  normal  0.085803 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1491  transport-associated  33.68 
 
 
216 aa  87.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0425  transport-associated  33.87 
 
 
214 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.379914  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1868  transport-associated  33.68 
 
 
216 aa  86.7  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.882392  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3859  transport-associated protein  33.16 
 
 
216 aa  86.3  4e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.790334 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7774  hypothetical protein  29.81 
 
 
203 aa  78.2  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.194796  normal  0.37862 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1151  transport-associated protein  38.52 
 
 
141 aa  73.9  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3063  hypothetical protein  26.27 
 
 
190 aa  53.1  0.000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2920  hypothetical protein  26.27 
 
 
190 aa  52.8  0.000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2261  transport-associated  29.38 
 
 
282 aa  50.4  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6692  transport-associated  29.38 
 
 
543 aa  50.8  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2185  transport-associated  30.08 
 
 
255 aa  49.3  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1784  transport-associated  24.62 
 
 
275 aa  49.3  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0010501  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5271  transport-associated  38.57 
 
 
86 aa  48.1  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.833634 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0141  transport-associated  35.53 
 
 
309 aa  46.2  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0826  transport-associated  34.11 
 
 
245 aa  46.2  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0362569 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01237  putative hyperosmotically inducible periplasmic protein  29.09 
 
 
175 aa  45.8  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.315155  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3809  transport-associated  36.84 
 
 
108 aa  45.4  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.810583  normal  0.967769 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4816  transport-associated  34.02 
 
 
258 aa  45.4  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3428  transport-associated  31.9 
 
 
284 aa  45.4  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.179471  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3502  transport-associated  35.53 
 
 
108 aa  45.4  0.0008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.260556  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3315  transport-associated  36 
 
 
301 aa  44.7  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3707  transport-associated  36.36 
 
 
181 aa  43.9  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.101636  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2956  transport-associated protein  28.17 
 
 
295 aa  43.9  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2827  transport-associated  37.5 
 
 
76 aa  43.9  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0761193  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3585  periplasmic protein  26.17 
 
 
218 aa  43.5  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2799  transporter, putative  33.62 
 
 
266 aa  43.1  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00116321  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0039  phospholipid-binding domain-containing protein  33.62 
 
 
266 aa  43.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0022  putative phospholipid-binding protein  33.62 
 
 
266 aa  43.1  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0386174  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1744  putative phospholipid-binding protein  33.62 
 
 
256 aa  43.1  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3817  putative phospholipid-binding protein  33.62 
 
 
266 aa  43.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.262069  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3898  putative phospholipid-binding protein  33.62 
 
 
266 aa  43.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3178  putative phospholipid-binding protein  33.62 
 
 
256 aa  43.1  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0262  transport-associated protein  30.3 
 
 
279 aa  42.7  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0552  periplasmic protein  25.85 
 
 
202 aa  42.7  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.783524  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0177  transport-associated  27.43 
 
 
276 aa  42.4  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>