128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0417 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0417  transport-associated  100 
 
 
216 aa  419  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.421605  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2606  transport-associated  98.15 
 
 
216 aa  413  9.999999999999999e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0213477  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2881  transport-associated  78.7 
 
 
216 aa  310  1e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2622  transport-associated  52.36 
 
 
215 aa  226  3e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3808  transport-associated  53.02 
 
 
216 aa  225  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2264  transport-associated  54.46 
 
 
216 aa  223  2e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2613  transport-associated  52.83 
 
 
214 aa  223  2e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.574258  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0431  transport-associated  54.25 
 
 
215 aa  221  7e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.390186  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0425  transport-associated  51.89 
 
 
214 aa  216  2e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.379914  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1909  transport-associated  54.46 
 
 
215 aa  214  7e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.966808  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2456  transport-associated  53.05 
 
 
215 aa  203  1e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.262468  normal  0.570841 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3859  transport-associated protein  50.23 
 
 
216 aa  201  7e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.790334 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4234  transport-associated  49.06 
 
 
215 aa  198  6e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.855371  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1491  transport-associated  50.23 
 
 
216 aa  197  7.999999999999999e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1664  hypothetical protein  48.36 
 
 
215 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0800901  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3886  transport-associated  50 
 
 
214 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.121  normal  0.085803 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3604  hypothetical protein  46.23 
 
 
215 aa  196  3e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.984998  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1868  transport-associated  48.37 
 
 
216 aa  194  7e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.882392  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7765  Smc22-1 ( osmotically inducible sensory protein)  46.7 
 
 
217 aa  185  4e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.705157  normal  0.17558 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0139  transport-associated protein  48.82 
 
 
223 aa  181  8.000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2300  transport-associated  45.02 
 
 
217 aa  177  1e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.53534  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7783  putative osmotically-inducible protein Y (precursor)  45.54 
 
 
220 aa  174  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.379132  normal  0.155349 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1226  transport-associated protein  44.29 
 
 
217 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.528686  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1220  transport-associated protein  48.8 
 
 
214 aa  171  6.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4562  transport-associated  47.39 
 
 
215 aa  170  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.266043 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4429  transport-associated  47.39 
 
 
215 aa  170  2e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0189  hypothetical protein  45.97 
 
 
215 aa  166  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.193269 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0390  transport-associated  41.23 
 
 
217 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5932  transport-associated protein  45.02 
 
 
216 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0204  hypothetical protein  41.98 
 
 
219 aa  162  3e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6133  transport-associated  54.79 
 
 
178 aa  160  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3634  transport-associated  42.52 
 
 
228 aa  159  3e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000681524 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5578  transport-associated  42.65 
 
 
217 aa  159  4e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00026661  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6897  transport-associated  42.18 
 
 
217 aa  157  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.35821  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1108  transport-associated  43.87 
 
 
216 aa  154  7e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1200  transport-associated  42.65 
 
 
217 aa  152  2.9999999999999998e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.649848  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3328  transport-associated  39.91 
 
 
217 aa  152  4e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.686073  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6189  transport-associated  41.51 
 
 
216 aa  151  8e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.551844  normal  0.435123 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5912  transport-associated protein  41.98 
 
 
216 aa  150  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.203256  normal  0.355197 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1870  periplasmic phospholipid binding protein  43.6 
 
 
216 aa  148  5e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.388852  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7784  putative osmotically inducible protein Y precursor  45.24 
 
 
217 aa  144  9e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0602659  normal  0.220051 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1111  transport-associated  41.23 
 
 
226 aa  144  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177622  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1892  putative phophoslipid binding protein  40.57 
 
 
216 aa  142  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.953866 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1101  transport-associated  38.68 
 
 
216 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0353  phospholipid binding protein  42.11 
 
 
216 aa  136  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4565  transport-associated  38.39 
 
 
217 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.192769 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4432  transport-associated  38.39 
 
 
217 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4061  transport-associated  43.33 
 
 
213 aa  133  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.221026  normal  0.208315 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5544  transport-associated  38.61 
 
 
216 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.078197  normal  0.764141 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0155  OsmY domain-containing protein  43.4 
 
 
216 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1324  OsmY domain-containing protein  43.4 
 
 
216 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2759  putative phospholipid-binding protein  43.4 
 
 
216 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2616  putative phospholipid-binding protein  43.4 
 
 
216 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0180  OsmY domain-containing protein  43.4 
 
 
216 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0186  hypothetical protein  36.49 
 
 
217 aa  122  5e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.117611 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5562  transport-associated  39.34 
 
 
216 aa  121  9e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.221455  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1063  OsmY domain-containing protein  41.04 
 
 
215 aa  115  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2660  putative phospholipid-binding protein  41.04 
 
 
237 aa  115  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0116  OsmY domain-containing protein  41.04 
 
 
215 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.567152  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1280  OsmY domain-containing protein  41.04 
 
 
215 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.84893  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2802  putative phospholipid-binding protein  41.04 
 
 
215 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0414  OsmY domain-containing protein  41.04 
 
 
215 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0140  putative phospholipid-binding protein  41.04 
 
 
237 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6209  transport-associated  38.86 
 
 
215 aa  112  5e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.716513 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5879  transport-associated protein  39.34 
 
 
215 aa  112  6e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0453  OsmY domain-containing protein  44.33 
 
 
197 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584382  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1899  periplasmic phospholipid binding protein  38.54 
 
 
233 aa  108  6e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.60597 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1025  OsmY domain-containing protein  43.3 
 
 
197 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1151  transport-associated protein  41.55 
 
 
141 aa  94  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6056  transport-associated  32.84 
 
 
226 aa  87  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.822447  hitchhiker  0.00012166 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7774  hypothetical protein  27.98 
 
 
203 aa  85.9  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.194796  normal  0.37862 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3809  transport-associated  53.85 
 
 
108 aa  76.3  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.810583  normal  0.967769 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3502  transport-associated  52.56 
 
 
108 aa  75.9  0.0000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.260556  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6692  transport-associated  31.63 
 
 
543 aa  72  0.000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0826  transport-associated  30.73 
 
 
245 aa  64.7  0.0000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0362569 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3008  transport-associated  43.55 
 
 
106 aa  58.9  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.845377  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0454  periplasmic protein  32.26 
 
 
202 aa  58.5  0.00000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.390695  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0552  periplasmic protein  32.68 
 
 
202 aa  57  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.783524  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5094  transport-associated  29.06 
 
 
273 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0983587  normal  0.219919 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3585  periplasmic protein  31.37 
 
 
218 aa  53.9  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0535  periplasmic protein  32.33 
 
 
205 aa  53.5  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.388761  hitchhiker  0.00819185 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3503  periplasmic protein  29.14 
 
 
204 aa  53.5  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0836  periplasmic protein  29.14 
 
 
204 aa  53.5  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3632  periplasmic protein  29.14 
 
 
204 aa  53.5  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0653  periplasmic protein  30 
 
 
204 aa  53.1  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2956  transport-associated protein  28.28 
 
 
295 aa  52.8  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0727  transport-associated protein  31.58 
 
 
240 aa  52.8  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2966  periplasmic or secreted lipoprotein OsmY  25.38 
 
 
219 aa  52.4  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000230813  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3033  putative phophoslipid binding protein  32.67 
 
 
249 aa  52.4  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.435467  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0149  transport-associated  28 
 
 
273 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.798997 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1047  hypothetical protein  32.81 
 
 
184 aa  51.2  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.202465  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2077  transport-associated  25.23 
 
 
307 aa  51.2  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.735501  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04251  periplasmic protein  32.06 
 
 
201 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.368391  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3623  transport-associated  32.06 
 
 
201 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04217  hypothetical protein  32.06 
 
 
201 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.310729  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4610  periplasmic protein  32.06 
 
 
201 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0762495  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3681  periplasmic protein  32.06 
 
 
201 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.261916  hitchhiker  0.00179473 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4923  periplasmic protein  31.54 
 
 
201 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.497608  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4919  periplasmic protein  32.06 
 
 
201 aa  50.1  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.618733  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0151  transport-associated  27.35 
 
 
273 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>