154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7784 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_7784  putative osmotically inducible protein Y precursor  100 
 
 
217 aa  423  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0602659  normal  0.220051 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7765  Smc22-1 ( osmotically inducible sensory protein)  61.11 
 
 
217 aa  277  9e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.705157  normal  0.17558 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7783  putative osmotically-inducible protein Y (precursor)  58.53 
 
 
220 aa  247  1e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.379132  normal  0.155349 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6897  transport-associated  56.02 
 
 
217 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.35821  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0139  transport-associated protein  55.81 
 
 
223 aa  222  4e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3328  transport-associated  47.22 
 
 
217 aa  185  6e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.686073  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1226  transport-associated protein  46.33 
 
 
217 aa  184  9e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.528686  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5578  transport-associated  45.12 
 
 
217 aa  176  3e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00026661  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0189  hypothetical protein  44.5 
 
 
215 aa  170  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.193269 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4429  transport-associated  46.05 
 
 
215 aa  168  7e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4562  transport-associated  46.05 
 
 
215 aa  168  7e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.266043 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4565  transport-associated  42.86 
 
 
217 aa  167  1e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.192769 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4432  transport-associated  42.86 
 
 
217 aa  167  1e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2264  transport-associated  44.44 
 
 
216 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2881  transport-associated  48.1 
 
 
216 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0390  transport-associated  43.26 
 
 
217 aa  164  8e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2622  transport-associated  42.72 
 
 
215 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0204  hypothetical protein  41.2 
 
 
219 aa  161  6e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2300  transport-associated  43.06 
 
 
217 aa  161  7e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.53534  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1108  transport-associated  44.95 
 
 
216 aa  157  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4234  transport-associated  40.93 
 
 
215 aa  156  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.855371  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0186  hypothetical protein  41.75 
 
 
217 aa  155  3e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.117611 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2613  transport-associated  45 
 
 
214 aa  156  3e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.574258  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3604  hypothetical protein  41.59 
 
 
215 aa  156  3e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.984998  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7774  hypothetical protein  39.38 
 
 
203 aa  156  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.194796  normal  0.37862 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1870  periplasmic phospholipid binding protein  44.91 
 
 
216 aa  155  6e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.388852  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1909  transport-associated  40.64 
 
 
215 aa  154  7e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.966808  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0425  transport-associated  44.8 
 
 
214 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.379914  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3634  transport-associated  42.34 
 
 
228 aa  152  2.9999999999999998e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000681524 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1220  transport-associated protein  43.52 
 
 
214 aa  150  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1664  hypothetical protein  39.44 
 
 
215 aa  148  5e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0800901  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2456  transport-associated  40.65 
 
 
215 aa  148  5e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.262468  normal  0.570841 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0431  transport-associated  40.85 
 
 
215 aa  148  5e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.390186  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2606  transport-associated  46.19 
 
 
216 aa  148  6e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0213477  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0417  transport-associated  45.24 
 
 
216 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.421605  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1111  transport-associated  39.53 
 
 
226 aa  142  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177622  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5562  transport-associated  44.19 
 
 
216 aa  142  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.221455  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3886  transport-associated  45 
 
 
214 aa  142  5e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.121  normal  0.085803 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6189  transport-associated  37.67 
 
 
216 aa  141  6e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.551844  normal  0.435123 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3808  transport-associated  37.04 
 
 
216 aa  141  7e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5912  transport-associated protein  36.74 
 
 
216 aa  137  8.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.203256  normal  0.355197 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3859  transport-associated protein  37.04 
 
 
216 aa  137  1e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.790334 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0353  phospholipid binding protein  42.59 
 
 
216 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1200  transport-associated  39.18 
 
 
217 aa  133  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.649848  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4061  transport-associated  41.78 
 
 
213 aa  131  6e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.221026  normal  0.208315 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2660  putative phospholipid-binding protein  41.2 
 
 
237 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1063  OsmY domain-containing protein  41.2 
 
 
215 aa  131  9e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0140  putative phospholipid-binding protein  41.2 
 
 
237 aa  131  9e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0116  OsmY domain-containing protein  41.2 
 
 
215 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.567152  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1280  OsmY domain-containing protein  41.2 
 
 
215 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.84893  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2802  putative phospholipid-binding protein  41.2 
 
 
215 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5932  transport-associated protein  37.5 
 
 
216 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1491  transport-associated  35.51 
 
 
216 aa  129  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0414  OsmY domain-containing protein  40.28 
 
 
215 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1868  transport-associated  33.8 
 
 
216 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.882392  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5544  transport-associated  38.35 
 
 
216 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.078197  normal  0.764141 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1892  putative phophoslipid binding protein  37.33 
 
 
216 aa  123  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.953866 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1101  transport-associated  36.41 
 
 
216 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1899  periplasmic phospholipid binding protein  36.98 
 
 
233 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.60597 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0155  OsmY domain-containing protein  43.52 
 
 
216 aa  116  3e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1324  OsmY domain-containing protein  43.52 
 
 
216 aa  116  3e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2759  putative phospholipid-binding protein  43.52 
 
 
216 aa  116  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2616  putative phospholipid-binding protein  43.52 
 
 
216 aa  116  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0180  OsmY domain-containing protein  43.52 
 
 
216 aa  116  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6133  transport-associated  40 
 
 
178 aa  103  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6209  transport-associated  36.11 
 
 
215 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.716513 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5879  transport-associated protein  34.72 
 
 
215 aa  99.4  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1025  OsmY domain-containing protein  42.86 
 
 
197 aa  93.2  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0453  OsmY domain-containing protein  42.78 
 
 
197 aa  92  5e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584382  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1151  transport-associated protein  40.54 
 
 
141 aa  85.5  5e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6056  transport-associated  33.17 
 
 
226 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.822447  hitchhiker  0.00012166 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6692  transport-associated  30.84 
 
 
543 aa  75.9  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2437  CBS domain containing protein  34.03 
 
 
628 aa  62.8  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000875184  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3585  periplasmic protein  29.14 
 
 
218 aa  59.3  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0826  transport-associated  28.64 
 
 
245 aa  58.2  0.00000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0362569 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2966  periplasmic or secreted lipoprotein OsmY  27.56 
 
 
219 aa  57  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000230813  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2185  transport-associated  25.33 
 
 
255 aa  57.4  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3033  putative phophoslipid binding protein  26.82 
 
 
249 aa  56.6  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.435467  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3809  transport-associated  51.43 
 
 
108 aa  56.2  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.810583  normal  0.967769 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3502  transport-associated  50 
 
 
108 aa  55.8  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.260556  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0552  periplasmic protein  30.26 
 
 
202 aa  55.1  0.0000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.783524  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3008  transport-associated  42.19 
 
 
106 aa  53.5  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.845377  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1214  transport-associated  44.29 
 
 
315 aa  52.8  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0393886  normal  0.108337 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0454  periplasmic protein  31.76 
 
 
202 aa  52  0.000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.390695  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0141  transport-associated  42.25 
 
 
309 aa  51.2  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1784  transport-associated  25.66 
 
 
275 aa  51.2  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0010501  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0333  hypothetical protein  35.21 
 
 
279 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0262  transport-associated protein  28.36 
 
 
279 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2077  transport-associated  25.34 
 
 
307 aa  50.8  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.735501  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3503  periplasmic protein  30.41 
 
 
204 aa  50.1  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0836  periplasmic protein  30.41 
 
 
204 aa  50.1  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3632  periplasmic protein  30.41 
 
 
204 aa  50.1  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0653  periplasmic protein  29.53 
 
 
204 aa  49.7  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2676  hypothetical protein  41.43 
 
 
303 aa  49.3  0.00005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.462534  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2676  transport-associated  35.29 
 
 
182 aa  48.9  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2851  transport-associated  35.29 
 
 
182 aa  48.9  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.884447 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1333  transport-associated  41.43 
 
 
303 aa  48.9  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.286279 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5904  hypothetical protein  53.19 
 
 
65 aa  48.5  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.749534  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3465  periplasmic protein  28.19 
 
 
202 aa  48.5  0.00007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3555  putative phophoslipid binding protein  31.71 
 
 
188 aa  48.5  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>