139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0353 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0353  phospholipid binding protein  100 
 
 
216 aa  426  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1870  periplasmic phospholipid binding protein  66.67 
 
 
216 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.388852  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6189  transport-associated  60.47 
 
 
216 aa  257  1e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.551844  normal  0.435123 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5562  transport-associated  66.2 
 
 
216 aa  255  3e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.221455  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5912  transport-associated protein  60.47 
 
 
216 aa  254  5e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.203256  normal  0.355197 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1108  transport-associated  64.19 
 
 
216 aa  249  3e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0155  OsmY domain-containing protein  61.4 
 
 
216 aa  216  2e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1324  OsmY domain-containing protein  61.4 
 
 
216 aa  216  2e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2759  putative phospholipid-binding protein  61.4 
 
 
216 aa  216  2e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2616  putative phospholipid-binding protein  61.4 
 
 
216 aa  216  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0180  OsmY domain-containing protein  61.4 
 
 
216 aa  216  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1220  transport-associated protein  53.95 
 
 
214 aa  211  9e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1892  putative phophoslipid binding protein  51.39 
 
 
216 aa  202  4e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.953866 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1111  transport-associated  51.85 
 
 
226 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177622  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0189  hypothetical protein  49.3 
 
 
215 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.193269 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5932  transport-associated protein  46.51 
 
 
216 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1101  transport-associated  49.07 
 
 
216 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0453  OsmY domain-containing protein  61.54 
 
 
197 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584382  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4562  transport-associated  50.7 
 
 
215 aa  194  1e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.266043 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4429  transport-associated  50.7 
 
 
215 aa  194  1e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1025  OsmY domain-containing protein  61.54 
 
 
197 aa  191  6e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5544  transport-associated  48.78 
 
 
216 aa  190  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.078197  normal  0.764141 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2300  transport-associated  48.15 
 
 
217 aa  187  1e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.53534  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0204  hypothetical protein  43.98 
 
 
219 aa  178  4.999999999999999e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0390  transport-associated  43.72 
 
 
217 aa  178  4.999999999999999e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1226  transport-associated protein  43.26 
 
 
217 aa  177  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.528686  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5578  transport-associated  45.12 
 
 
217 aa  176  3e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00026661  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1200  transport-associated  46.3 
 
 
217 aa  170  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.649848  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2622  transport-associated  45.75 
 
 
215 aa  170  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4565  transport-associated  43.52 
 
 
217 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.192769 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4432  transport-associated  43.52 
 
 
217 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4234  transport-associated  44.6 
 
 
215 aa  162  3e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.855371  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0139  transport-associated protein  44.19 
 
 
223 aa  160  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0431  transport-associated  45.54 
 
 
215 aa  160  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.390186  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3328  transport-associated  42.45 
 
 
217 aa  158  6e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.686073  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0186  hypothetical protein  41.67 
 
 
217 aa  157  9e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.117611 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0414  OsmY domain-containing protein  45.37 
 
 
215 aa  157  9e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2264  transport-associated  40.47 
 
 
216 aa  156  3e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7765  Smc22-1 ( osmotically inducible sensory protein)  39.81 
 
 
217 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.705157  normal  0.17558 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0116  OsmY domain-containing protein  44.91 
 
 
215 aa  152  4e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.567152  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1280  OsmY domain-containing protein  44.91 
 
 
215 aa  152  4e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.84893  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2802  putative phospholipid-binding protein  44.91 
 
 
215 aa  152  4e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0140  putative phospholipid-binding protein  44.91 
 
 
237 aa  152  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1063  OsmY domain-containing protein  44.44 
 
 
215 aa  150  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2660  putative phospholipid-binding protein  44.44 
 
 
237 aa  150  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3808  transport-associated  42.13 
 
 
216 aa  145  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1899  periplasmic phospholipid binding protein  42.65 
 
 
233 aa  145  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.60597 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1909  transport-associated  41.59 
 
 
215 aa  143  2e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.966808  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7783  putative osmotically-inducible protein Y (precursor)  39.17 
 
 
220 aa  143  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.379132  normal  0.155349 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2613  transport-associated  40.85 
 
 
214 aa  142  4e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.574258  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5879  transport-associated protein  40.28 
 
 
215 aa  141  9e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1664  hypothetical protein  39.25 
 
 
215 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0800901  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3859  transport-associated protein  40.37 
 
 
216 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.790334 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2881  transport-associated  42.11 
 
 
216 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6209  transport-associated  39.35 
 
 
215 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.716513 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6897  transport-associated  38.6 
 
 
217 aa  136  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.35821  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3886  transport-associated  39.91 
 
 
214 aa  137  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.121  normal  0.085803 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1491  transport-associated  38.71 
 
 
216 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2456  transport-associated  40.28 
 
 
215 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.262468  normal  0.570841 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3604  hypothetical protein  37.26 
 
 
215 aa  132  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.984998  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7784  putative osmotically inducible protein Y precursor  42.59 
 
 
217 aa  132  5e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0602659  normal  0.220051 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1868  transport-associated  38.99 
 
 
216 aa  132  5e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.882392  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0425  transport-associated  38.5 
 
 
214 aa  132  6e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.379914  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0417  transport-associated  42.11 
 
 
216 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.421605  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2606  transport-associated  42.58 
 
 
216 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0213477  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3634  transport-associated  38.99 
 
 
228 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000681524 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4061  transport-associated  41.31 
 
 
213 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.221026  normal  0.208315 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1151  transport-associated protein  45.71 
 
 
141 aa  114  7.999999999999999e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6133  transport-associated  37.09 
 
 
178 aa  105  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6056  transport-associated  34.76 
 
 
226 aa  100  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.822447  hitchhiker  0.00012166 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2966  periplasmic or secreted lipoprotein OsmY  27.35 
 
 
219 aa  74.3  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000230813  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7774  hypothetical protein  26.4 
 
 
203 aa  74.7  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.194796  normal  0.37862 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6692  transport-associated  32.21 
 
 
543 aa  70.9  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1784  transport-associated  26.61 
 
 
275 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0010501  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2185  transport-associated  25.37 
 
 
255 aa  64.7  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2553  hypothetical protein  26.18 
 
 
278 aa  60.1  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2827  transport-associated  49.25 
 
 
76 aa  60.1  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0761193  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0421  transport-associated protein  28.89 
 
 
241 aa  58.5  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0826  transport-associated  29.61 
 
 
245 aa  58.2  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0362569 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0727  transport-associated protein  28.57 
 
 
240 aa  57  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3008  transport-associated  38.81 
 
 
106 aa  56.6  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.845377  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0262  transport-associated protein  23.68 
 
 
279 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2261  transport-associated  26.16 
 
 
282 aa  54.7  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2676  transport-associated  31.78 
 
 
182 aa  53.5  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2851  transport-associated  31.78 
 
 
182 aa  53.5  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.884447 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1405  transport-associated protein  36.36 
 
 
184 aa  53.5  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2956  transport-associated protein  23.15 
 
 
295 aa  54.3  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2744  transport-associated  31.78 
 
 
182 aa  53.1  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0134  transport-associated protein  26.05 
 
 
273 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.892998  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3502  transport-associated  44.93 
 
 
108 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.260556  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0333  hypothetical protein  24.12 
 
 
279 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3809  transport-associated  43.48 
 
 
108 aa  52  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.810583  normal  0.967769 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1441  transport-associated  35.45 
 
 
184 aa  51.6  0.000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2939  transport-associated  34.55 
 
 
184 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.537293  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1415  transport-associated  31.3 
 
 
184 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3707  transport-associated  27.78 
 
 
181 aa  50.4  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.101636  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0177  transport-associated  28.77 
 
 
276 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0151  transport-associated  25.58 
 
 
273 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1214  transport-associated  41.43 
 
 
315 aa  49.7  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0393886  normal  0.108337 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1317  transport-associated  34.55 
 
 
181 aa  49.7  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>