126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2966 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2966  periplasmic or secreted lipoprotein OsmY  100 
 
 		 219 aa  447  1e-125  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000230813  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0727  transport-associated protein  36.48 
 
 		 240 aa  137  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0421  transport-associated protein  36.4 
 
 		 241 aa  135  4e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2836  transport-associated  33.89 
 
 		 240 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0986  transport-associated  33.05 
 
 		 240 aa  119  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3274  transport-associated protein  33.77 
 
 		 240 aa  105  5e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1367  periplasmic or secreted lipoprotein  30.45 
 
 		 245 aa  102  6e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.487396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1978  transport-associated protein  30.13 
 
 		 241 aa  100  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4872  hypothetical protein  33.49 
 
 		 271 aa  93.2  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4370  transport-associated protein  30.23 
 
 		 243 aa  91.3  9e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0390  transport-associated  30.5 
 
 		 217 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1774  periplasmic or secreted lipoprotein  25.6 
 
 		 255 aa  81.6  0.000000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0221772  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3328  transport-associated  30.41 
 
 		 217 aa  80.5  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.686073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7783  putative osmotically-inducible protein Y (precursor)  26.73 
 
 		 220 aa  70.1  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.379132  normal  0.155349 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2613  transport-associated  28.06 
 
 		 214 aa  69.3  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.574258  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4565  transport-associated  31.12 
 
 		 217 aa  67.8  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.192769 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4432  transport-associated  31.12 
 
 		 217 aa  67.8  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1111  transport-associated  28.96 
 
 		 226 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0353  phospholipid binding protein  27.35 
 
 		 216 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6897  transport-associated  28.51 
 
 		 217 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.35821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1220  transport-associated protein  29.67 
 
 		 214 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0139  transport-associated protein  28.44 
 
 		 223 aa  63.9  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0425  transport-associated  26.53 
 
 		 214 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.379914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1200  transport-associated  28.96 
 
 		 217 aa  62.8  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.649848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3634  transport-associated  27.19 
 
 		 228 aa  62.8  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000681524 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6692  transport-associated  27.78 
 
 		 543 aa  62.8  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0186  hypothetical protein  29.29 
 
 		 217 aa  62.4  0.000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.117611 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4061  transport-associated  29.17 
 
 		 213 aa  62.4  0.000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.221026  normal  0.208315 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2185  transport-associated  30.28 
 
 		 255 aa  61.6  0.000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7765  Smc22-1 ( osmotically inducible sensory protein)  26.26 
 
 		 217 aa  61.2  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.705157  normal  0.17558 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2300  transport-associated  28.19 
 
 		 217 aa  60.5  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.53534  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0189  hypothetical protein  28.09 
 
 		 215 aa  58.9  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.193269 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1226  transport-associated protein  27.23 
 
 		 217 aa  57  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.528686  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3808  transport-associated  26.11 
 
 		 216 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4234  transport-associated  26.18 
 
 		 215 aa  57  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.855371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1101  transport-associated  26.7 
 
 		 216 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5932  transport-associated protein  25.45 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0264  transport-associated  29.84 
 
 		 187 aa  55.8  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.47721  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0177  transport-associated  28.57 
 
 		 276 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2622  transport-associated  22.7 
 
 		 215 aa  55.1  0.0000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0431  transport-associated  23.47 
 
 		 215 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.390186  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0204  hypothetical protein  28.28 
 
 		 219 aa  53.5  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1870  periplasmic phospholipid binding protein  28.25 
 
 		 216 aa  53.5  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.388852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3604  hypothetical protein  25.63 
 
 		 215 aa  53.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.984998  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5578  transport-associated  26.91 
 
 		 217 aa  53.5  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00026661  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5544  transport-associated  27.62 
 
 		 216 aa  53.1  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.078197  normal  0.764141 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1892  putative phophoslipid binding protein  28.72 
 
 		 216 aa  52.8  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.953866 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1909  transport-associated  33.93 
 
 		 215 aa  52.8  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.966808  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1868  transport-associated  26.87 
 
 		 216 aa  52  0.000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.882392  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2676  transport-associated  34.86 
 
 		 182 aa  51.6  0.000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2851  transport-associated  34.86 
 
 		 182 aa  51.6  0.000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.884447 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1317  transport-associated  33.94 
 
 		 181 aa  51.6  0.000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2744  transport-associated  34.86 
 
 		 182 aa  50.8  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2956  transport-associated protein  23.44 
 
 		 295 aa  51.2  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3886  transport-associated  32 
 
 		 214 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.121  normal  0.085803 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0414  OsmY domain-containing protein  28.18 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1491  transport-associated  28 
 
 		 216 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2456  transport-associated  23.86 
 
 		 215 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.262468  normal  0.570841 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0653  periplasmic protein  25.17 
 
 		 204 aa  50.4  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5562  transport-associated  27.56 
 
 		 216 aa  50.4  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.221455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1441  transport-associated  33.96 
 
 		 184 aa  50.1  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0826  transport-associated  26.34 
 
 		 245 aa  50.1  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0362569 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0262  transport-associated protein  28.08 
 
 		 279 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1405  transport-associated protein  33.02 
 
 		 184 aa  48.9  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3503  periplasmic protein  25.95 
 
 		 204 aa  47.8  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3632  periplasmic protein  25.95 
 
 		 204 aa  47.8  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0333  hypothetical protein  28.08 
 
 		 279 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3707  transport-associated  33.03 
 
 		 181 aa  47.4  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.101636  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0535  periplasmic protein  26.9 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.388761  hitchhiker  0.00819185 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0836  periplasmic protein  25.95 
 
 		 204 aa  47.4  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3585  periplasmic protein  26 
 
 		 218 aa  47  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2437  CBS domain containing protein  31.45 
 
 		 628 aa  47  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000875184  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2660  putative phospholipid-binding protein  30.33 
 
 		 237 aa  46.6  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0140  putative phospholipid-binding protein  30.33 
 
 		 237 aa  46.6  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2261  transport-associated  31.45 
 
 		 282 aa  46.6  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0116  OsmY domain-containing protein  30.33 
 
 		 215 aa  46.2  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.567152  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1063  OsmY domain-containing protein  30.33 
 
 		 215 aa  46.2  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3995  transport-associated  32.71 
 
 		 182 aa  46.2  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000543546  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1280  OsmY domain-containing protein  30.33 
 
 		 215 aa  46.2  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.84893  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2802  putative phospholipid-binding protein  30.33 
 
 		 215 aa  46.2  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6209  transport-associated  27.43 
 
 		 215 aa  46.2  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.716513 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4562  transport-associated  26.37 
 
 		 215 aa  45.8  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.266043 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3859  transport-associated protein  27.97 
 
 		 216 aa  45.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.790334 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4919  periplasmic protein  26.9 
 
 		 201 aa  45.8  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.618733  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4429  transport-associated  26.37 
 
 		 215 aa  45.8  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04251  periplasmic protein  26.9 
 
 		 201 aa  45.4  0.0006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.368391  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3623  transport-associated  26.9 
 
 		 201 aa  45.4  0.0006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04217  hypothetical protein  26.9 
 
 		 201 aa  45.4  0.0006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.310729  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2939  transport-associated  32.08 
 
 		 184 aa  45.4  0.0006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.537293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2077  transport-associated  21.92 
 
 		 307 aa  45.8  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.735501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4610  periplasmic protein  26.9 
 
 		 201 aa  45.4  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0762495  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3681  periplasmic protein  26.9 
 
 		 201 aa  45.4  0.0006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.261916  hitchhiker  0.00179473 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4923  periplasmic protein  26.9 
 
 		 201 aa  45.4  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.497608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1415  transport-associated  32.11 
 
 		 184 aa  45.1  0.0007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1784  transport-associated  23.04 
 
 		 275 aa  45.1  0.0009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0010501  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1151  transport-associated protein  31.9 
 
 		 141 aa  44.3  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2264  transport-associated  22.44 
 
 		 216 aa  44.3  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5888  periplasmic protein  26.9 
 
 		 201 aa  44.3  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.223121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7784  putative osmotically inducible protein Y precursor  27.56 
 
 		 217 aa  44.7  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0602659  normal  0.220051 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2881  transport-associated  29.37 
 
 		 216 aa  44.7  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>