128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1870 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1870  periplasmic phospholipid binding protein  100 
 
 
216 aa  426  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.388852  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5562  transport-associated  81.02 
 
 
216 aa  316  2e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.221455  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5912  transport-associated protein  64.65 
 
 
216 aa  280  1e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.203256  normal  0.355197 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6189  transport-associated  64.19 
 
 
216 aa  280  1e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.551844  normal  0.435123 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1108  transport-associated  66.98 
 
 
216 aa  270  1e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0353  phospholipid binding protein  66.67 
 
 
216 aa  265  5e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1220  transport-associated protein  59.62 
 
 
214 aa  236  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1111  transport-associated  58.33 
 
 
226 aa  227  1e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177622  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1892  putative phophoslipid binding protein  56.02 
 
 
216 aa  224  7e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.953866 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0189  hypothetical protein  53.95 
 
 
215 aa  222  4e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.193269 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0155  OsmY domain-containing protein  63.26 
 
 
216 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1324  OsmY domain-containing protein  63.26 
 
 
216 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2759  putative phospholipid-binding protein  63.26 
 
 
216 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2616  putative phospholipid-binding protein  63.26 
 
 
216 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0180  OsmY domain-containing protein  63.26 
 
 
216 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5544  transport-associated  55.12 
 
 
216 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.078197  normal  0.764141 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4429  transport-associated  55.81 
 
 
215 aa  218  5e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4562  transport-associated  55.81 
 
 
215 aa  218  5e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.266043 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1101  transport-associated  50.93 
 
 
216 aa  215  4e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5932  transport-associated protein  51.63 
 
 
216 aa  208  5e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2300  transport-associated  52.78 
 
 
217 aa  205  5e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.53534  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0453  OsmY domain-containing protein  64.62 
 
 
197 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584382  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1025  OsmY domain-containing protein  63.59 
 
 
197 aa  193  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1226  transport-associated protein  46.98 
 
 
217 aa  193  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.528686  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5578  transport-associated  46.98 
 
 
217 aa  188  5.999999999999999e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00026661  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0186  hypothetical protein  48.15 
 
 
217 aa  186  3e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.117611 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0204  hypothetical protein  45.83 
 
 
219 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0414  OsmY domain-containing protein  52.09 
 
 
215 aa  181  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0390  transport-associated  45.58 
 
 
217 aa  180  2e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1899  periplasmic phospholipid binding protein  48.82 
 
 
233 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.60597 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0140  putative phospholipid-binding protein  52.09 
 
 
237 aa  178  7e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0116  OsmY domain-containing protein  52.09 
 
 
215 aa  177  8e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.567152  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1280  OsmY domain-containing protein  52.09 
 
 
215 aa  177  8e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.84893  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2802  putative phospholipid-binding protein  52.09 
 
 
215 aa  177  8e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4432  transport-associated  44.91 
 
 
217 aa  177  1e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4565  transport-associated  44.91 
 
 
217 aa  177  1e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.192769 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1063  OsmY domain-containing protein  51.39 
 
 
215 aa  176  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2660  putative phospholipid-binding protein  51.63 
 
 
237 aa  176  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2622  transport-associated  46.7 
 
 
215 aa  175  5e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2264  transport-associated  43.72 
 
 
216 aa  174  9.999999999999999e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6209  transport-associated  47.69 
 
 
215 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.716513 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1200  transport-associated  46.76 
 
 
217 aa  172  5e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.649848  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5879  transport-associated protein  48.15 
 
 
215 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0431  transport-associated  47.89 
 
 
215 aa  171  7.999999999999999e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.390186  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7765  Smc22-1 ( osmotically inducible sensory protein)  42.33 
 
 
217 aa  165  4e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.705157  normal  0.17558 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4234  transport-associated  44.13 
 
 
215 aa  165  4e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.855371  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3808  transport-associated  44.19 
 
 
216 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3604  hypothetical protein  41.51 
 
 
215 aa  161  7e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.984998  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0139  transport-associated protein  43.93 
 
 
223 aa  159  3e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2881  transport-associated  45.02 
 
 
216 aa  157  9e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3328  transport-associated  42.45 
 
 
217 aa  155  7e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.686073  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7783  putative osmotically-inducible protein Y (precursor)  41.67 
 
 
220 aa  152  4e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.379132  normal  0.155349 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7784  putative osmotically inducible protein Y precursor  45.12 
 
 
217 aa  151  5.9999999999999996e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0602659  normal  0.220051 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3859  transport-associated protein  42.4 
 
 
216 aa  151  8e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.790334 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1909  transport-associated  43.46 
 
 
215 aa  148  5e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.966808  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1868  transport-associated  43.32 
 
 
216 aa  148  5e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.882392  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1491  transport-associated  40.74 
 
 
216 aa  146  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2456  transport-associated  39.44 
 
 
215 aa  145  3e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.262468  normal  0.570841 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6897  transport-associated  39.53 
 
 
217 aa  145  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.35821  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1664  hypothetical protein  40.19 
 
 
215 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0800901  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2613  transport-associated  41.12 
 
 
214 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.574258  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3886  transport-associated  41.78 
 
 
214 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.121  normal  0.085803 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0425  transport-associated  40.19 
 
 
214 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.379914  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3634  transport-associated  38.89 
 
 
228 aa  135  4e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000681524 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0417  transport-associated  43.6 
 
 
216 aa  135  4e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.421605  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2606  transport-associated  44.08 
 
 
216 aa  135  5e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0213477  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1151  transport-associated protein  50 
 
 
141 aa  124  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6133  transport-associated  40.52 
 
 
178 aa  118  7e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4061  transport-associated  39.45 
 
 
213 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.221026  normal  0.208315 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6056  transport-associated  34.76 
 
 
226 aa  102  6e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.822447  hitchhiker  0.00012166 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7774  hypothetical protein  32 
 
 
203 aa  98.6  6e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.194796  normal  0.37862 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2966  periplasmic or secreted lipoprotein OsmY  28.25 
 
 
219 aa  62.4  0.000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000230813  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6692  transport-associated  29.81 
 
 
543 aa  58.5  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1784  transport-associated  25.32 
 
 
275 aa  58.5  0.00000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0010501  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3600  transport-associated  29.93 
 
 
175 aa  57  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3008  transport-associated  40.3 
 
 
106 aa  54.3  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.845377  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1214  transport-associated  47.14 
 
 
315 aa  53.1  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0393886  normal  0.108337 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2077  transport-associated  29.5 
 
 
307 aa  53.1  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.735501  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3809  transport-associated  46.27 
 
 
108 aa  52.4  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.810583  normal  0.967769 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3502  transport-associated  44.78 
 
 
108 aa  52  0.000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.260556  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1310  transport-associated  30.6 
 
 
179 aa  50.4  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0905482  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2827  transport-associated  41.79 
 
 
76 aa  50.8  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0761193  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0454  periplasmic protein  33.56 
 
 
202 aa  50.1  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.390695  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3503  periplasmic protein  34.01 
 
 
204 aa  50.1  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0836  periplasmic protein  34.01 
 
 
204 aa  50.1  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3632  periplasmic protein  34.01 
 
 
204 aa  50.1  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2185  transport-associated  25.37 
 
 
255 aa  49.3  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2676  hypothetical protein  41.43 
 
 
303 aa  49.7  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.462534  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3707  transport-associated  32 
 
 
181 aa  49.7  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.101636  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1333  transport-associated  41.43 
 
 
303 aa  49.7  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.286279 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2437  CBS domain containing protein  31.43 
 
 
628 aa  48.5  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000875184  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0552  periplasmic protein  32.19 
 
 
202 aa  48.5  0.00007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.783524  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2553  hypothetical protein  24.36 
 
 
278 aa  46.6  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3033  putative phophoslipid binding protein  30.63 
 
 
249 aa  46.6  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.435467  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4133  transport-associated  31.01 
 
 
188 aa  46.6  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0134  transport-associated protein  26.71 
 
 
273 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.892998  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2920  hypothetical protein  29.93 
 
 
190 aa  44.7  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0151  transport-associated  26.49 
 
 
273 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01237  putative hyperosmotically inducible periplasmic protein  25.85 
 
 
175 aa  44.3  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.315155  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0826  transport-associated  29.19 
 
 
245 aa  44.7  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0362569 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>