210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0826 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0826  transport-associated  100 
 
 		 245 aa  482  1e-135  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0362569 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2185  transport-associated  42.11 
 
 		 255 aa  157  1e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0262  transport-associated protein  34.43 
 
 		 279 aa  95.5  8e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0333  hypothetical protein  30.86 
 
 		 279 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0177  transport-associated  34.66 
 
 		 276 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7765  Smc22-1 ( osmotically inducible sensory protein)  34.3 
 
 		 217 aa  79  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.705157  normal  0.17558 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4565  transport-associated  34.11 
 
 		 217 aa  79  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.192769 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4432  transport-associated  34.11 
 
 		 217 aa  79  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2261  transport-associated  39.69 
 
 		 282 aa  78.6  0.00000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1101  transport-associated  30.56 
 
 		 216 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0151  transport-associated  31.47 
 
 		 273 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1784  transport-associated  28.79 
 
 		 275 aa  77  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0010501  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0134  transport-associated protein  31.47 
 
 		 273 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.892998  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04251  periplasmic protein  31.79 
 
 		 201 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.368391  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3623  transport-associated  31.79 
 
 		 201 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3681  periplasmic protein  31.79 
 
 		 201 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.261916  hitchhiker  0.00179473 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4234  transport-associated  31.25 
 
 		 215 aa  73.9  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.855371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4923  periplasmic protein  31.79 
 
 		 201 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.497608  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04217  hypothetical protein  31.79 
 
 		 201 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.310729  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4610  periplasmic protein  31.79 
 
 		 201 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0762495  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4919  periplasmic protein  31.79 
 
 		 201 aa  73.9  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.618733  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4973  periplasmic protein  31.13 
 
 		 201 aa  72  0.000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00297721  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0139  transport-associated protein  31.88 
 
 		 223 aa  71.6  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0149  transport-associated  30.24 
 
 		 273 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.798997 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5888  periplasmic protein  31.13 
 
 		 201 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.223121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4815  periplasmic protein  30.72 
 
 		 205 aa  70.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4882  periplasmic protein  30.72 
 
 		 205 aa  70.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0715597  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4976  periplasmic protein  30.72 
 
 		 205 aa  70.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.163142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4917  periplasmic protein  30.72 
 
 		 205 aa  70.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.292031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4969  periplasmic protein  30.72 
 
 		 205 aa  70.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0535  periplasmic protein  31.13 
 
 		 205 aa  70.1  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.388761  hitchhiker  0.00819185 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5094  transport-associated  29.08 
 
 		 273 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0983587  normal  0.219919 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3297  transport-associated  31.37 
 
 		 201 aa  68.2  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.173268  normal  0.854509 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0258  histidine kinase  28.21 
 
 		 222 aa  67.4  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.469068 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0653  periplasmic protein  29.27 
 
 		 204 aa  67  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3632  periplasmic protein  29.56 
 
 		 204 aa  66.6  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0836  periplasmic protein  29.56 
 
 		 204 aa  66.6  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3503  periplasmic protein  29.56 
 
 		 204 aa  66.6  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1193  transport-associated protein  32.28 
 
 		 199 aa  65.5  0.0000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1195  transport-associated protein  31.65 
 
 		 192 aa  65.5  0.0000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3328  transport-associated  29.26 
 
 		 217 aa  65.1  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.686073  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0186  hypothetical protein  31.13 
 
 		 217 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.117611 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3634  transport-associated  32.75 
 
 		 228 aa  65.1  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000681524 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5932  transport-associated protein  37.14 
 
 		 216 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0454  periplasmic protein  31.17 
 
 		 202 aa  63.9  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.390695  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5879  transport-associated protein  28.02 
 
 		 215 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1111  transport-associated  32.21 
 
 		 226 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177622  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2553  hypothetical protein  31.06 
 
 		 278 aa  63.2  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001941  putative hyperosmotically inducible periplasmic protein  29.11 
 
 		 183 aa  62.8  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6209  transport-associated  27.16 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.716513 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0421  transport-associated protein  37.82 
 
 		 241 aa  62  0.000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0552  periplasmic protein  29.22 
 
 		 202 aa  61.6  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.783524  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7783  putative osmotically-inducible protein Y (precursor)  30 
 
 		 220 aa  61.2  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.379132  normal  0.155349 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0055  putative osmotically inducible protein  31.16 
 
 		 219 aa  60.8  0.00000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1226  transport-associated protein  28.17 
 
 		 217 aa  60.1  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.528686  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3995  transport-associated  33.06 
 
 		 182 aa  60.1  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000543546  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1317  transport-associated  35.83 
 
 		 181 aa  60.1  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1200  transport-associated  31.73 
 
 		 217 aa  59.3  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.649848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3707  transport-associated  36 
 
 		 181 aa  58.9  0.00000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.101636  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1892  putative phophoslipid binding protein  28.45 
 
 		 216 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.953866 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0204  hypothetical protein  26.64 
 
 		 219 aa  58.5  0.00000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3585  periplasmic protein  28.1 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2077  transport-associated  26.87 
 
 		 307 aa  58.5  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.735501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2300  transport-associated  28.64 
 
 		 217 aa  58.5  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.53534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0264  transport-associated  29.87 
 
 		 187 aa  57.8  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.47721  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2613  transport-associated  27.62 
 
 		 214 aa  57  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.574258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2456  transport-associated  28.04 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.262468  normal  0.570841 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4061  transport-associated  31.47 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.221026  normal  0.208315 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1220  transport-associated protein  32.52 
 
 		 214 aa  55.1  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2264  transport-associated  26.09 
 
 		 216 aa  55.1  0.0000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3587  transport-associated  35.65 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4133  transport-associated  25.83 
 
 		 188 aa  54.7  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1415  transport-associated  34.13 
 
 		 184 aa  55.1  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01237  putative hyperosmotically inducible periplasmic protein  28.48 
 
 		 175 aa  54.3  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.315155  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0425  transport-associated  26.67 
 
 		 214 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.379914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3886  transport-associated  27.54 
 
 		 214 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.121  normal  0.085803 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6056  transport-associated  34.53 
 
 		 226 aa  53.9  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.822447  hitchhiker  0.00012166 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3604  hypothetical protein  28.11 
 
 		 215 aa  53.5  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.984998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2676  transport-associated  35.14 
 
 		 182 aa  52.8  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2851  transport-associated  35.14 
 
 		 182 aa  52.8  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.884447 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5544  transport-associated  27.6 
 
 		 216 aa  53.1  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.078197  normal  0.764141 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1868  transport-associated  29.75 
 
 		 216 aa  52.8  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.882392  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6692  transport-associated  30.5 
 
 		 543 aa  52.4  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0189  hypothetical protein  27.67 
 
 		 215 aa  52  0.000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.193269 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1664  hypothetical protein  29.67 
 
 		 215 aa  52  0.000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0800901  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2939  transport-associated  37.25 
 
 		 184 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.537293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1367  periplasmic or secreted lipoprotein  31.15 
 
 		 245 aa  51.6  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.487396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1491  transport-associated  31.45 
 
 		 216 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2744  transport-associated  35.14 
 
 		 182 aa  51.2  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0155  OsmY domain-containing protein  32 
 
 		 216 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43670  Transport-associated protein  33 
 
 		 120 aa  50.8  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.226738  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1025  OsmY domain-containing protein  32 
 
 		 197 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0390  transport-associated  26.32 
 
 		 217 aa  50.4  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4004  transport-associated  37.31 
 
 		 104 aa  51.2  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.38345  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1405  transport-associated protein  35.29 
 
 		 184 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1324  OsmY domain-containing protein  32 
 
 		 216 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2759  putative phospholipid-binding protein  32 
 
 		 216 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2616  putative phospholipid-binding protein  32 
 
 		 216 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0180  OsmY domain-containing protein  32 
 
 		 216 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1441  transport-associated  36.27 
 
 		 184 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>