106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0141 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0141  transport-associated  100 
 
 		 309 aa  580  1.0000000000000001e-165  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3315  transport-associated  37.68 
 
 		 301 aa  101  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2676  hypothetical protein  57.32 
 
 		 303 aa  96.3  5e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.462534  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4411  transport-associated  58.75 
 
 		 244 aa  96.3  5e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.128668  normal  0.799504 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1333  transport-associated  58.23 
 
 		 303 aa  95.1  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.286279 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1714  transport-associated  47.75 
 
 		 355 aa  95.1  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4733  transport-associated  48.96 
 
 		 326 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3903  transport-associated  57.32 
 
 		 231 aa  92  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0263909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3822  transport-associated  41.61 
 
 		 210 aa  88.2  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.139226  hitchhiker  0.00915179 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3144  transport-associated  58.44 
 
 		 174 aa  88.2  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1214  transport-associated  35.51 
 
 		 315 aa  87  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0393886  normal  0.108337 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3206  transport-associated  42.06 
 
 		 313 aa  84.7  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.445559  normal  0.396268 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4223  transport-associated protein  45.92 
 
 		 178 aa  83.2  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1389  transport-associated  41.75 
 
 		 287 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0291894  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6440  transport-associated  41.75 
 
 		 287 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.661052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5436  transport-associated protein  45.65 
 
 		 397 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0448845 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4381  transport-associated protein  52.56 
 
 		 308 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.946547  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3175  phospholipid-binding domain-containing protein  45.45 
 
 		 604 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1995  hypothetical protein  45.45 
 
 		 355 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1393  hypothetical protein  45.45 
 
 		 448 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1687  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3047  phospholipid-binding domain-containing protein  45.45 
 
 		 584 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2281  hypothetical protein  45.45 
 
 		 521 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6031  transport-associated  41.9 
 
 		 294 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.237369 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1017  hypothetical protein  45.45 
 
 		 544 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1305  hypothetical protein  45.45 
 
 		 544 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5656  transport-associated  47.37 
 
 		 288 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.22123  normal  0.630318 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6404  transport-associated  47.37 
 
 		 286 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0981375  normal  0.190645 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3339  transport-associated  44.58 
 
 		 198 aa  71.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4238  transport-associated protein  41.51 
 
 		 244 aa  70.5  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.248738  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1236  transport-associated protein  46.75 
 
 		 170 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4375  transport-associated protein  45.67 
 
 		 372 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.291836  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4591  transport-associated protein  45.54 
 
 		 367 aa  65.9  0.0000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2264  transport-associated  44.93 
 
 		 216 aa  57.8  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2480  transport-associated protein  36.36 
 
 		 129 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.567161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2574  transport-associated protein  44.12 
 
 		 179 aa  55.5  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.155982  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1715  transport-associated  39.19 
 
 		 90 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.487712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3885  transport-associated  39.51 
 
 		 135 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.225437 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4429  transport-associated  47.22 
 
 		 215 aa  53.9  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4562  transport-associated  47.22 
 
 		 215 aa  53.9  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.266043 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3156  phospholipid-binding domain-containing protein  39.73 
 
 		 246 aa  53.1  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1376  osmotically inducible protein Y  39.73 
 
 		 174 aa  52.4  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.177857  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3027  phospholipid-binding domain-containing protein  39.73 
 
 		 184 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.119447  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6356  transport-associated  34.88 
 
 		 125 aa  51.2  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.802203  normal  0.334542 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0826  transport-associated  53.19 
 
 		 245 aa  50.8  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0362569 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0189  hypothetical protein  45.21 
 
 		 215 aa  50.4  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.193269 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5211  transport-associated  36.11 
 
 		 123 aa  50.4  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0618952  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5648  transport-associated  36.11 
 
 		 123 aa  50.4  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0978596  normal  0.176508 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7784  putative osmotically inducible protein Y precursor  41.1 
 
 		 217 aa  49.3  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0602659  normal  0.220051 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3270  transport-associated  29.73 
 
 		 139 aa  48.5  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.21303  normal  0.821762 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3429  transport-associated protein  40 
 
 		 412 aa  48.9  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.389194  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1111  transport-associated  40.79 
 
 		 226 aa  48.5  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177622  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0186  hypothetical protein  42.25 
 
 		 217 aa  47.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.117611 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1624  putative phospholipid-binding protein  34.74 
 
 		 119 aa  48.1  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0267001  normal  0.292905 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4234  transport-associated  40 
 
 		 215 aa  48.1  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.855371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5031  transport-associated  36.11 
 
 		 119 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.677375 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7783  putative osmotically-inducible protein Y (precursor)  29.31 
 
 		 220 aa  47.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.379132  normal  0.155349 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0948  transport-associated  36.47 
 
 		 110 aa  47  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2416  transport-associated  32.98 
 
 		 118 aa  47  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1220  transport-associated protein  33.33 
 
 		 214 aa  46.6  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3026  transport-associated protein  40.85 
 
 		 124 aa  46.6  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.311021  normal  0.461623 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3148  putative phospholipid-binding protein  36.49 
 
 		 294 aa  47  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6049  transport-associated  39.71 
 
 		 134 aa  46.6  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0480722 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2261  transport-associated  48.21 
 
 		 282 aa  46.2  0.0006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4432  transport-associated  38.36 
 
 		 217 aa  46.2  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4565  transport-associated  38.36 
 
 		 217 aa  46.2  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.192769 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2741  transport-associated protein  30.67 
 
 		 140 aa  46.2  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7765  Smc22-1 ( osmotically inducible sensory protein)  30.51 
 
 		 217 aa  46.2  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.705157  normal  0.17558 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5453  transport-associated protein  35.62 
 
 		 134 aa  45.8  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.627587  hitchhiker  0.00543554 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3201  phospholipid-binding domain-containing protein  36.49 
 
 		 221 aa  45.8  0.0009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.883979  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0653  periplasmic protein  39.51 
 
 		 204 aa  45.8  0.0009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2029  transport-associated domain-containing protein  36.49 
 
 		 221 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.168793  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1226  transport-associated protein  40.58 
 
 		 217 aa  45.4  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.528686  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5639  transport-associated  35.62 
 
 		 134 aa  45.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.149696 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2719  transport-associated domain-containing protein  36.49 
 
 		 221 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6387  transport-associated  35.62 
 
 		 134 aa  45.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.508762 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1101  transport-associated  44.44 
 
 		 216 aa  44.3  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6897  transport-associated  43.66 
 
 		 217 aa  44.3  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.35821  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1664  hypothetical protein  35.53 
 
 		 215 aa  44.3  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0800901  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0139  transport-associated protein  39.44 
 
 		 223 aa  43.9  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1899  periplasmic phospholipid binding protein  35.53 
 
 		 233 aa  44.3  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.60597 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1679  transport-associated protein  39.06 
 
 		 118 aa  44.3  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.3238  normal  0.893681 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1047  hypothetical protein  43.42 
 
 		 184 aa  43.9  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.202465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3177  transport-associated  33.71 
 
 		 123 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.944582  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5191  transport-associated  33.71 
 
 		 123 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00696153 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5086  transport-associated  33.71 
 
 		 123 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3886  transport-associated  42.03 
 
 		 214 aa  43.9  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.121  normal  0.085803 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01237  putative hyperosmotically inducible periplasmic protein  41.07 
 
 		 175 aa  43.9  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.315155  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2770  transport-associated  32.94 
 
 		 100 aa  43.5  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.253359  hitchhiker  0.000519176 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3209  hypothetical protein  25.13 
 
 		 1143 aa  43.5  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0782308  normal  0.555781 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1151  transport-associated protein  35.62 
 
 		 141 aa  43.1  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3859  transport-associated protein  40 
 
 		 216 aa  43.1  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.790334 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2719  putative phospholipid-binding protein  36.11 
 
 		 116 aa  43.1  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2456  transport-associated protein  31.58 
 
 		 84 aa  43.1  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.148047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1419  transport-associated domain-containing protein  36.49 
 
 		 222 aa  43.1  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3008  transport-associated  34.88 
 
 		 106 aa  43.1  0.007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.845377  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3707  transport-associated  41.18 
 
 		 181 aa  42.7  0.007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.101636  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4244  transport-associated protein  39.73 
 
 		 136 aa  42.7  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4015  transport-associated  29.03 
 
 		 118 aa  42.7  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6133  transport-associated  44.07 
 
 		 178 aa  42.7  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4971  transport-associated  33.77 
 
 		 115 aa  42.7  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.314311  normal  0.115696 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>