138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3604 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3604  hypothetical protein  100 
 
 		 215 aa  419  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.984998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2264  transport-associated  55.81 
 
 		 216 aa  241  6e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2622  transport-associated  51.4 
 
 		 215 aa  207  7e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0431  transport-associated  51.4 
 
 		 215 aa  203  2e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.390186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4234  transport-associated  48.6 
 
 		 215 aa  194  8.000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.855371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2456  transport-associated  45.28 
 
 		 215 aa  191  5e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.262468  normal  0.570841 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2881  transport-associated  48.58 
 
 		 216 aa  191  7e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3808  transport-associated  45.16 
 
 		 216 aa  191  8e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1909  transport-associated  46.51 
 
 		 215 aa  191  9e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.966808  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3859  transport-associated protein  46.3 
 
 		 216 aa  189  2e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.790334 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1868  transport-associated  45.83 
 
 		 216 aa  186  3e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.882392  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1491  transport-associated  45.62 
 
 		 216 aa  184  6e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4429  transport-associated  47.42 
 
 		 215 aa  184  7e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4562  transport-associated  47.42 
 
 		 215 aa  184  7e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.266043 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0189  hypothetical protein  46.7 
 
 		 215 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.193269 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1664  hypothetical protein  44.39 
 
 		 215 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0800901  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0390  transport-associated  45.28 
 
 		 217 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1226  transport-associated protein  42.25 
 
 		 217 aa  175  5e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.528686  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2606  transport-associated  46.7 
 
 		 216 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0213477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0417  transport-associated  46.23 
 
 		 216 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.421605  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0204  hypothetical protein  43.87 
 
 		 219 aa  170  1e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1220  transport-associated protein  43.4 
 
 		 214 aa  169  4e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0139  transport-associated protein  43.66 
 
 		 223 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2613  transport-associated  42.52 
 
 		 214 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.574258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7765  Smc22-1 ( osmotically inducible sensory protein)  41.04 
 
 		 217 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.705157  normal  0.17558 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3328  transport-associated  39.72 
 
 		 217 aa  162  3e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.686073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2300  transport-associated  43.87 
 
 		 217 aa  162  4.0000000000000004e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.53534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6897  transport-associated  41.51 
 
 		 217 aa  160  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.35821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0425  transport-associated  41.59 
 
 		 214 aa  159  4e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.379914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7783  putative osmotically-inducible protein Y (precursor)  39.34 
 
 		 220 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.379132  normal  0.155349 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3886  transport-associated  42.99 
 
 		 214 aa  154  7e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.121  normal  0.085803 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1870  periplasmic phospholipid binding protein  41.51 
 
 		 216 aa  151  7e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.388852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6133  transport-associated  49.68 
 
 		 178 aa  150  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5578  transport-associated  38.68 
 
 		 217 aa  148  8e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00026661  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1108  transport-associated  39.62 
 
 		 216 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3634  transport-associated  40.74 
 
 		 228 aa  145  7.0000000000000006e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000681524 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0186  hypothetical protein  38.21 
 
 		 217 aa  144  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.117611 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6189  transport-associated  38.68 
 
 		 216 aa  142  3e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.551844  normal  0.435123 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5932  transport-associated protein  39.62 
 
 		 216 aa  142  4e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1200  transport-associated  40.57 
 
 		 217 aa  140  9.999999999999999e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.649848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5912  transport-associated protein  38.68 
 
 		 216 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.203256  normal  0.355197 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4432  transport-associated  38.21 
 
 		 217 aa  139  3e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4565  transport-associated  38.21 
 
 		 217 aa  139  3e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.192769 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7784  putative osmotically inducible protein Y precursor  41.04 
 
 		 217 aa  135  4e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0602659  normal  0.220051 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1111  transport-associated  41.04 
 
 		 226 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1101  transport-associated  37.74 
 
 		 216 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1892  putative phophoslipid binding protein  37.74 
 
 		 216 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.953866 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5562  transport-associated  39.62 
 
 		 216 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.221455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5544  transport-associated  36.63 
 
 		 216 aa  124  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.078197  normal  0.764141 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0353  phospholipid binding protein  37.26 
 
 		 216 aa  123  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0414  OsmY domain-containing protein  36.32 
 
 		 215 aa  118  7e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1063  OsmY domain-containing protein  36.62 
 
 		 215 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2660  putative phospholipid-binding protein  36.62 
 
 		 237 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0116  OsmY domain-containing protein  36.62 
 
 		 215 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.567152  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1280  OsmY domain-containing protein  36.62 
 
 		 215 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.84893  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2802  putative phospholipid-binding protein  36.62 
 
 		 215 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0140  putative phospholipid-binding protein  36.62 
 
 		 237 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6209  transport-associated  36.62 
 
 		 215 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.716513 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0155  OsmY domain-containing protein  41.04 
 
 		 216 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1324  OsmY domain-containing protein  41.04 
 
 		 216 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2759  putative phospholipid-binding protein  41.04 
 
 		 216 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2616  putative phospholipid-binding protein  41.04 
 
 		 216 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0180  OsmY domain-containing protein  41.04 
 
 		 216 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4061  transport-associated  38.86 
 
 		 213 aa  113  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.221026  normal  0.208315 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5879  transport-associated protein  35.21 
 
 		 215 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1899  periplasmic phospholipid binding protein  33.82 
 
 		 233 aa  107  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.60597 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0453  OsmY domain-containing protein  41.03 
 
 		 197 aa  105  5e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584382  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1025  OsmY domain-containing protein  41.03 
 
 		 197 aa  102  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6056  transport-associated  32.51 
 
 		 226 aa  93.2  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.822447  hitchhiker  0.00012166 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7774  hypothetical protein  30.89 
 
 		 203 aa  91.7  8e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.194796  normal  0.37862 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1151  transport-associated protein  39.42 
 
 		 141 aa  88.6  7e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6692  transport-associated  30.99 
 
 		 543 aa  78.2  0.00000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3809  transport-associated  44.93 
 
 		 108 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.810583  normal  0.967769 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3502  transport-associated  43.48 
 
 		 108 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.260556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0552  periplasmic protein  30.2 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.783524  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2437  CBS domain containing protein  30.99 
 
 		 628 aa  56.6  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000875184  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2077  transport-associated  26.62 
 
 		 307 aa  56.2  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.735501  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0454  periplasmic protein  28.86 
 
 		 202 aa  54.3  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.390695  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2956  transport-associated protein  23.83 
 
 		 295 aa  54.3  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2966  periplasmic or secreted lipoprotein OsmY  25.63 
 
 		 219 aa  53.5  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000230813  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1047  hypothetical protein  29.56 
 
 		 184 aa  53.5  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.202465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3503  periplasmic protein  28.57 
 
 		 204 aa  53.9  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0836  periplasmic protein  28.57 
 
 		 204 aa  53.9  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3632  periplasmic protein  28.57 
 
 		 204 aa  53.9  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0826  transport-associated  28.11 
 
 		 245 aa  53.5  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0362569 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2185  transport-associated  22.47 
 
 		 255 aa  53.1  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3008  transport-associated  33.82 
 
 		 106 aa  50.4  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.845377  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0333  hypothetical protein  25.12 
 
 		 279 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0262  transport-associated protein  26.11 
 
 		 279 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1784  transport-associated  23.43 
 
 		 275 aa  48.9  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0010501  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3429  transport-associated protein  23.74 
 
 		 412 aa  48.5  0.00008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.389194  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2676  hypothetical protein  36.11 
 
 		 303 aa  48.1  0.00009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.462534  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0535  periplasmic protein  28.1 
 
 		 205 aa  48.1  0.00009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.388761  hitchhiker  0.00819185 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5271  transport-associated  39.68 
 
 		 86 aa  46.2  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.833634 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1333  transport-associated  39.06 
 
 		 303 aa  46.6  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.286279 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4687  transport-associated protein  29.01 
 
 		 192 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.314355  normal  0.0505791 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3600  transport-associated  26.28 
 
 		 175 aa  46.2  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2261  transport-associated  23.74 
 
 		 282 aa  45.8  0.0005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0653  periplasmic protein  27.27 
 
 		 204 aa  45.8  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57510  putative secreted lipoprotein  26.92 
 
 		 192 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>