115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6133 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_6133  transport-associated  100 
 
 		 178 aa  355  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2622  transport-associated  74.34 
 
 		 215 aa  224  4e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0431  transport-associated  74.34 
 
 		 215 aa  209  2e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.390186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2264  transport-associated  56.13 
 
 		 216 aa  174  6e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2881  transport-associated  53.1 
 
 		 216 aa  156  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3604  hypothetical protein  50 
 
 		 215 aa  150  8.999999999999999e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.984998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2606  transport-associated  51.53 
 
 		 216 aa  142  3e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0213477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0417  transport-associated  50.92 
 
 		 216 aa  141  4e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.421605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3808  transport-associated  45.45 
 
 		 216 aa  138  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0189  hypothetical protein  44.44 
 
 		 215 aa  137  6e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.193269 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4234  transport-associated  45.16 
 
 		 215 aa  137  7e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.855371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2456  transport-associated  45.16 
 
 		 215 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.262468  normal  0.570841 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2613  transport-associated  47.74 
 
 		 214 aa  134  5e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.574258  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1664  hypothetical protein  45.7 
 
 		 215 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0800901  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4562  transport-associated  48.05 
 
 		 215 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.266043 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4429  transport-associated  48.05 
 
 		 215 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1909  transport-associated  44.08 
 
 		 215 aa  132  3e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.966808  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1200  transport-associated  44.37 
 
 		 217 aa  128  4.0000000000000003e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.649848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1226  transport-associated protein  42.48 
 
 		 217 aa  127  8.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.528686  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3886  transport-associated  48.99 
 
 		 214 aa  127  8.000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.121  normal  0.085803 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2300  transport-associated  43.92 
 
 		 217 aa  126  1.0000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.53534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3859  transport-associated protein  41.56 
 
 		 216 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.790334 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1491  transport-associated  42.21 
 
 		 216 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0204  hypothetical protein  42.95 
 
 		 219 aa  125  5e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5578  transport-associated  42.86 
 
 		 217 aa  124  9e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00026661  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0425  transport-associated  44.83 
 
 		 214 aa  121  6e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.379914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5932  transport-associated protein  45.39 
 
 		 216 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1868  transport-associated  37.66 
 
 		 216 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.882392  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0139  transport-associated protein  42.21 
 
 		 223 aa  115  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1220  transport-associated protein  42.95 
 
 		 214 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0390  transport-associated  41.43 
 
 		 217 aa  114  7.999999999999999e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3328  transport-associated  39.35 
 
 		 217 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.686073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7765  Smc22-1 ( osmotically inducible sensory protein)  38.31 
 
 		 217 aa  112  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.705157  normal  0.17558 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7783  putative osmotically-inducible protein Y (precursor)  38.71 
 
 		 220 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.379132  normal  0.155349 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3634  transport-associated  40.48 
 
 		 228 aa  110  9e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000681524 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6189  transport-associated  40.28 
 
 		 216 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.551844  normal  0.435123 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1101  transport-associated  41.83 
 
 		 216 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5912  transport-associated protein  41.67 
 
 		 216 aa  107  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.203256  normal  0.355197 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1870  periplasmic phospholipid binding protein  40.52 
 
 		 216 aa  104  6e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.388852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7784  putative osmotically inducible protein Y precursor  40 
 
 		 217 aa  103  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0602659  normal  0.220051 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1111  transport-associated  43.33 
 
 		 226 aa  103  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6897  transport-associated  39.1 
 
 		 217 aa  102  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.35821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1899  periplasmic phospholipid binding protein  38.24 
 
 		 233 aa  101  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.60597 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1892  putative phophoslipid binding protein  39.22 
 
 		 216 aa  100  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.953866 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0186  hypothetical protein  36.31 
 
 		 217 aa  100  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.117611 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4565  transport-associated  35.67 
 
 		 217 aa  99.8  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.192769 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4432  transport-associated  35.67 
 
 		 217 aa  99.8  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1108  transport-associated  43.75 
 
 		 216 aa  99.4  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5544  transport-associated  38.82 
 
 		 216 aa  99.4  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.078197  normal  0.764141 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5562  transport-associated  38.99 
 
 		 216 aa  99.4  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.221455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0414  OsmY domain-containing protein  44.37 
 
 		 215 aa  92.8  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0353  phospholipid binding protein  36.84 
 
 		 216 aa  90.5  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1151  transport-associated protein  38.03 
 
 		 141 aa  89.7  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2660  putative phospholipid-binding protein  41.55 
 
 		 237 aa  86.3  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4061  transport-associated  39.6 
 
 		 213 aa  86.3  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.221026  normal  0.208315 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0155  OsmY domain-containing protein  43.03 
 
 		 216 aa  85.9  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1063  OsmY domain-containing protein  41.55 
 
 		 215 aa  85.5  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1324  OsmY domain-containing protein  43.03 
 
 		 216 aa  85.9  3e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2759  putative phospholipid-binding protein  43.03 
 
 		 216 aa  85.9  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2616  putative phospholipid-binding protein  43.03 
 
 		 216 aa  85.9  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0180  OsmY domain-containing protein  43.03 
 
 		 216 aa  85.9  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0140  putative phospholipid-binding protein  41.55 
 
 		 237 aa  85.5  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0116  OsmY domain-containing protein  41.55 
 
 		 215 aa  85.1  5e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.567152  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1280  OsmY domain-containing protein  41.55 
 
 		 215 aa  85.1  5e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.84893  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2802  putative phospholipid-binding protein  41.55 
 
 		 215 aa  85.1  5e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6209  transport-associated  33.14 
 
 		 215 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.716513 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5879  transport-associated protein  31.95 
 
 		 215 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7774  hypothetical protein  30.28 
 
 		 203 aa  73.2  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.194796  normal  0.37862 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3809  transport-associated  47.62 
 
 		 108 aa  70.9  0.000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.810583  normal  0.967769 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1025  OsmY domain-containing protein  41.5 
 
 		 197 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3502  transport-associated  46.43 
 
 		 108 aa  70.5  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.260556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0453  OsmY domain-containing protein  40.14 
 
 		 197 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584382  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6056  transport-associated  32.84 
 
 		 226 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.822447  hitchhiker  0.00012166 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2077  transport-associated  27.53 
 
 		 307 aa  56.6  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.735501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3008  transport-associated  38.36 
 
 		 106 aa  55.1  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.845377  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0653  periplasmic protein  31.17 
 
 		 204 aa  52.8  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3503  periplasmic protein  27.52 
 
 		 204 aa  50.1  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0836  periplasmic protein  27.52 
 
 		 204 aa  50.1  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3632  periplasmic protein  27.52 
 
 		 204 aa  50.1  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3600  transport-associated  38.81 
 
 		 175 aa  48.5  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0552  periplasmic protein  30.16 
 
 		 202 aa  48.1  0.00006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.783524  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2676  hypothetical protein  40.85 
 
 		 303 aa  47.8  0.00008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.462534  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4917  periplasmic protein  31.3 
 
 		 205 aa  47.8  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.292031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4969  periplasmic protein  31.3 
 
 		 205 aa  47.8  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4815  periplasmic protein  31.3 
 
 		 205 aa  47.8  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4882  periplasmic protein  31.3 
 
 		 205 aa  47.8  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0715597  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4976  periplasmic protein  31.3 
 
 		 205 aa  47.8  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.163142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1214  transport-associated  41.43 
 
 		 315 aa  47.4  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0393886  normal  0.108337 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0454  periplasmic protein  30.95 
 
 		 202 aa  47.4  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.390695  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6692  transport-associated  31.62 
 
 		 543 aa  46.2  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0258  histidine kinase  42.03 
 
 		 222 aa  46.6  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.469068 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1333  transport-associated  41.18 
 
 		 303 aa  46.2  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.286279 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0535  periplasmic protein  32.09 
 
 		 205 aa  46.6  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.388761  hitchhiker  0.00819185 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3585  periplasmic protein  28.03 
 
 		 218 aa  46.6  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2437  CBS domain containing protein  31.08 
 
 		 628 aa  46.2  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000875184  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4919  periplasmic protein  32.09 
 
 		 201 aa  46.2  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.618733  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0141  transport-associated  39.44 
 
 		 309 aa  44.7  0.0006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2827  transport-associated  36.84 
 
 		 76 aa  45.1  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0761193  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0194  transport-associated protein  32.2 
 
 		 173 aa  44.7  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4923  periplasmic protein  31.34 
 
 		 201 aa  44.7  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.497608  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>