53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_3600 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_3600  transport-associated  100 
 
 
175 aa  351  4e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1310  transport-associated  45.71 
 
 
179 aa  151  4e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0905482  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0194  transport-associated protein  51.55 
 
 
173 aa  136  1e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2077  transport-associated  38.57 
 
 
307 aa  97.1  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.735501  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2956  transport-associated protein  25.17 
 
 
295 aa  71.6  0.000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1870  periplasmic phospholipid binding protein  29.93 
 
 
216 aa  57  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.388852  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0189  hypothetical protein  29.71 
 
 
215 aa  55.1  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.193269 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5562  transport-associated  29.2 
 
 
216 aa  53.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.221455  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1108  transport-associated  25.55 
 
 
216 aa  52.4  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5912  transport-associated protein  25.5 
 
 
216 aa  52  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.203256  normal  0.355197 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0264  transport-associated  30.41 
 
 
187 aa  51.6  0.000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.47721  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1111  transport-associated  30.66 
 
 
226 aa  50.4  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177622  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6189  transport-associated  25.5 
 
 
216 aa  50.1  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.551844  normal  0.435123 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1193  transport-associated protein  28.29 
 
 
199 aa  50.1  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1151  transport-associated protein  30.43 
 
 
141 aa  50.1  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1220  transport-associated protein  32.76 
 
 
214 aa  49.7  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0453  OsmY domain-containing protein  29.2 
 
 
197 aa  48.5  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584382  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2622  transport-associated  46.55 
 
 
215 aa  48.5  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6133  transport-associated  37.33 
 
 
178 aa  48.5  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1324  OsmY domain-containing protein  29.2 
 
 
216 aa  47.8  0.00008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0155  OsmY domain-containing protein  29.2 
 
 
216 aa  47.8  0.00008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0180  OsmY domain-containing protein  29.2 
 
 
216 aa  47.8  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2616  putative phospholipid-binding protein  29.2 
 
 
216 aa  47.8  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2759  putative phospholipid-binding protein  29.2 
 
 
216 aa  47.8  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1025  OsmY domain-containing protein  29.2 
 
 
197 aa  47.8  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0366  transport-associated, putative  26.06 
 
 
191 aa  46.6  0.0002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.140163  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3604  hypothetical protein  26.28 
 
 
215 aa  46.2  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.984998  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4133  transport-associated  27.94 
 
 
188 aa  45.8  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0139  transport-associated protein  45 
 
 
223 aa  45.4  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01237  putative hyperosmotically inducible periplasmic protein  26.24 
 
 
175 aa  45.4  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.315155  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0826  transport-associated  27.22 
 
 
245 aa  45.1  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0362569 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5932  transport-associated protein  29.2 
 
 
216 aa  45.1  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1784  transport-associated  26.54 
 
 
275 aa  44.7  0.0007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0010501  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3587  transport-associated  27.21 
 
 
191 aa  44.7  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3634  transport-associated  39.24 
 
 
228 aa  44.3  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000681524 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0186  hypothetical protein  27.78 
 
 
217 aa  43.9  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.117611 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2261  transport-associated  26.87 
 
 
282 aa  43.1  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1101  transport-associated  25.55 
 
 
216 aa  43.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0258  histidine kinase  27.45 
 
 
222 aa  43.1  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.469068 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0335  putative osmotically inducible protein  25.58 
 
 
202 aa  43.1  0.002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.161455  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5898  transport-associated  38.46 
 
 
116 aa  42.4  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2300  transport-associated  31.67 
 
 
217 aa  42.4  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.53534  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5544  transport-associated  39.51 
 
 
216 aa  42  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.078197  normal  0.764141 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7765  Smc22-1 ( osmotically inducible sensory protein)  25.64 
 
 
217 aa  42  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.705157  normal  0.17558 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3886  transport-associated  38.89 
 
 
214 aa  42.4  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.121  normal  0.085803 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2827  transport-associated  41.38 
 
 
76 aa  42  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0761193  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1195  transport-associated protein  25.68 
 
 
192 aa  42  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3328  transport-associated  27.01 
 
 
217 aa  41.6  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.686073  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1892  putative phophoslipid binding protein  24.82 
 
 
216 aa  41.6  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.953866 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0477  transport-associated  33.72 
 
 
103 aa  41.2  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0932  transport-associated  24.64 
 
 
131 aa  41.2  0.008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4429  transport-associated  27.56 
 
 
215 aa  40.8  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4562  transport-associated  27.56 
 
 
215 aa  40.8  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.266043 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>