180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_4133 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_4133  transport-associated  100 
 
 		 188 aa  362  1e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3707  transport-associated  63.33 
 
 		 181 aa  189  2e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.101636  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1415  transport-associated  60.54 
 
 		 184 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3995  transport-associated  56.59 
 
 		 182 aa  179  2e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000543546  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1317  transport-associated  59.55 
 
 		 181 aa  175  4e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1441  transport-associated  62.72 
 
 		 184 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001941  putative hyperosmotically inducible periplasmic protein  49.73 
 
 		 183 aa  172  1.9999999999999998e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1405  transport-associated protein  62.13 
 
 		 184 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2939  transport-associated  62.13 
 
 		 184 aa  170  1e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.537293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01237  putative hyperosmotically inducible periplasmic protein  56.52 
 
 		 175 aa  167  8e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.315155  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2744  transport-associated  59.76 
 
 		 182 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2676  transport-associated  59.17 
 
 		 182 aa  162  3e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2851  transport-associated  59.17 
 
 		 182 aa  162  3e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.884447 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0264  transport-associated  50.27 
 
 		 187 aa  160  7e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.47721  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0177  transport-associated  37.76 
 
 		 276 aa  101  6e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0258  histidine kinase  36.65 
 
 		 222 aa  97.8  9e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.469068 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2261  transport-associated  33.33 
 
 		 282 aa  97.4  1e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5094  transport-associated  34.57 
 
 		 273 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0983587  normal  0.219919 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0149  transport-associated  34.46 
 
 		 273 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.798997 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0262  transport-associated protein  35.17 
 
 		 279 aa  82.4  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2185  transport-associated  34.18 
 
 		 255 aa  81.6  0.000000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1784  transport-associated  33.76 
 
 		 275 aa  81.3  0.000000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0010501  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0333  hypothetical protein  33.79 
 
 		 279 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0134  transport-associated protein  32.77 
 
 		 273 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.892998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0151  transport-associated  33.33 
 
 		 273 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2553  hypothetical protein  30.71 
 
 		 278 aa  71.6  0.000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3587  transport-associated  30.53 
 
 		 191 aa  61.6  0.000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1195  transport-associated protein  30.05 
 
 		 192 aa  61.6  0.000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0836  periplasmic protein  30.77 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3503  periplasmic protein  30.77 
 
 		 204 aa  58.5  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3632  periplasmic protein  30.77 
 
 		 204 aa  58.5  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0552  periplasmic protein  30.07 
 
 		 202 aa  58.2  0.00000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.783524  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2300  transport-associated  32.43 
 
 		 217 aa  58.2  0.00000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.53534  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04251  periplasmic protein  27.41 
 
 		 201 aa  57  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.368391  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3623  transport-associated  27.41 
 
 		 201 aa  57  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3681  periplasmic protein  27.41 
 
 		 201 aa  57  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.261916  hitchhiker  0.00179473 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4973  periplasmic protein  27.41 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00297721  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4565  transport-associated  29.53 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.192769 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04217  hypothetical protein  27.41 
 
 		 201 aa  57  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.310729  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4432  transport-associated  29.53 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4919  periplasmic protein  30.87 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.618733  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4610  periplasmic protein  27.41 
 
 		 201 aa  57  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0762495  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1193  transport-associated protein  28.57 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0454  periplasmic protein  29.37 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.390695  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6056  transport-associated  31.61 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.822447  hitchhiker  0.00012166 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0189  hypothetical protein  31.91 
 
 		 215 aa  55.1  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.193269 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0826  transport-associated  25.83 
 
 		 245 aa  54.7  0.0000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0362569 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5888  periplasmic protein  26.9 
 
 		 201 aa  54.7  0.0000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.223121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0453  OsmY domain-containing protein  32 
 
 		 197 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584382  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4976  periplasmic protein  30.41 
 
 		 205 aa  54.3  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.163142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4917  periplasmic protein  30.41 
 
 		 205 aa  54.3  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.292031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4815  periplasmic protein  30.41 
 
 		 205 aa  54.3  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4882  periplasmic protein  30.41 
 
 		 205 aa  54.3  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0715597  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4969  periplasmic protein  30.41 
 
 		 205 aa  54.3  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1025  OsmY domain-containing protein  28.78 
 
 		 197 aa  54.3  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4923  periplasmic protein  26.9 
 
 		 201 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.497608  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0155  OsmY domain-containing protein  28.78 
 
 		 216 aa  53.1  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0073  transport-associated  27.44 
 
 		 196 aa  53.1  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1324  OsmY domain-containing protein  28.78 
 
 		 216 aa  53.1  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2759  putative phospholipid-binding protein  28.78 
 
 		 216 aa  53.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2616  putative phospholipid-binding protein  28.78 
 
 		 216 aa  53.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0180  OsmY domain-containing protein  28.78 
 
 		 216 aa  53.1  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1220  transport-associated protein  31.62 
 
 		 214 aa  52.8  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2077  transport-associated  33.57 
 
 		 307 aa  52.8  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.735501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0535  periplasmic protein  31.08 
 
 		 205 aa  52  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.388761  hitchhiker  0.00819185 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3603  transport-associated  43.84 
 
 		 116 aa  52  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.335448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1151  transport-associated protein  32.03 
 
 		 141 aa  52  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0106  hypothetical protein  35.14 
 
 		 190 aa  51.2  0.000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.277757  normal  0.0163837 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62690  hypothetical protein  43.84 
 
 		 114 aa  51.2  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5456  hypothetical protein  43.84 
 
 		 114 aa  51.2  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.469146  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3297  transport-associated  27.89 
 
 		 201 aa  50.4  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.173268  normal  0.854509 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13110  hypothetical protein  27.92 
 
 		 161 aa  50.8  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0125  transport-associated  34.51 
 
 		 267 aa  49.7  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7765  Smc22-1 ( osmotically inducible sensory protein)  34.51 
 
 		 217 aa  49.7  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.705157  normal  0.17558 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4039  transport-associated protein  40.91 
 
 		 156 aa  48.9  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.130048  normal  0.0885216 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0140  putative phospholipid-binding protein  30.43 
 
 		 237 aa  48.9  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0116  OsmY domain-containing protein  30.43 
 
 		 215 aa  48.5  0.00006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.567152  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0562  transport-associated  31.08 
 
 		 300 aa  48.5  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0407  transport-associated  33.02 
 
 		 265 aa  48.5  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1280  OsmY domain-containing protein  30.43 
 
 		 215 aa  48.5  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.84893  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2437  CBS domain containing protein  28.24 
 
 		 628 aa  48.5  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000875184  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2802  putative phospholipid-binding protein  30.43 
 
 		 215 aa  48.5  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2657  putative lipoprotein  31.62 
 
 		 195 aa  48.5  0.00006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2660  putative phospholipid-binding protein  30.43 
 
 		 237 aa  48.1  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1063  OsmY domain-containing protein  30.43 
 
 		 215 aa  48.1  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0414  OsmY domain-containing protein  31.43 
 
 		 215 aa  48.1  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1744  putative phospholipid-binding protein  30.43 
 
 		 256 aa  47.8  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3178  putative phospholipid-binding protein  30.43 
 
 		 256 aa  47.8  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2799  transporter, putative  30.43 
 
 		 266 aa  47.8  0.00009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00116321  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0039  phospholipid-binding domain-containing protein  30.43 
 
 		 266 aa  47.8  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0022  putative phospholipid-binding protein  30.43 
 
 		 266 aa  47.8  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0386174  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3817  putative phospholipid-binding protein  30.43 
 
 		 266 aa  47.8  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.262069  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3898  putative phospholipid-binding protein  30.43 
 
 		 266 aa  47.8  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4429  transport-associated  30.53 
 
 		 215 aa  47.4  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1642  putative periplasmic protein  36.76 
 
 		 144 aa  47.4  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0830703  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4562  transport-associated  30.53 
 
 		 215 aa  47.4  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.266043 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4311  periplasmic phospholipid binding protein  33.02 
 
 		 264 aa  47.8  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43670  Transport-associated protein  33.73 
 
 		 120 aa  47.4  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.226738  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3022  transport-associated  36.11 
 
 		 158 aa  47.4  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.631889  normal  0.200341 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3429  transport-associated protein  27.47 
 
 		 412 aa  47.8  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.389194  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>