More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A4815 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A4917  periplasmic protein  100 
 
 
205 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.292031  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4969  periplasmic protein  100 
 
 
205 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4882  periplasmic protein  100 
 
 
205 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0715597  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4815  periplasmic protein  100 
 
 
205 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4976  periplasmic protein  100 
 
 
205 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.163142  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04251  periplasmic protein  90.15 
 
 
201 aa  353  8.999999999999999e-97  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.368391  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3623  transport-associated  90.15 
 
 
201 aa  353  8.999999999999999e-97  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4610  periplasmic protein  90.15 
 
 
201 aa  353  8.999999999999999e-97  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0762495  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04217  hypothetical protein  90.15 
 
 
201 aa  353  8.999999999999999e-97  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.310729  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3681  periplasmic protein  90.15 
 
 
201 aa  353  8.999999999999999e-97  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.261916  hitchhiker  0.00179473 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5888  periplasmic protein  89.66 
 
 
201 aa  351  4e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.223121  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4923  periplasmic protein  89.66 
 
 
201 aa  351  5e-96  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.497608  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4973  periplasmic protein  89.16 
 
 
201 aa  350  8e-96  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00297721  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4919  periplasmic protein  88.78 
 
 
201 aa  350  8.999999999999999e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.618733  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0535  periplasmic protein  82.76 
 
 
205 aa  325  4.0000000000000003e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.388761  hitchhiker  0.00819185 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3503  periplasmic protein  63.55 
 
 
204 aa  249  1e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0836  periplasmic protein  64.04 
 
 
204 aa  250  1e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3632  periplasmic protein  63.55 
 
 
204 aa  249  1e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0653  periplasmic protein  67.49 
 
 
204 aa  245  4e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0454  periplasmic protein  60.1 
 
 
202 aa  217  1e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.390695  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0552  periplasmic protein  57.64 
 
 
202 aa  207  1e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.783524  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3585  periplasmic protein  54.82 
 
 
218 aa  187  8e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3465  periplasmic protein  46.8 
 
 
202 aa  165  4e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1193  transport-associated protein  38.86 
 
 
199 aa  115  3e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1195  transport-associated protein  43.79 
 
 
192 aa  108  6e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0073  transport-associated  39.18 
 
 
196 aa  99.8  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1501  transport-associated protein  42.74 
 
 
104 aa  81.6  0.000000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2047  transport-associated protein  50 
 
 
104 aa  72.8  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.186123  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2000  transport-associated protein  31.94 
 
 
185 aa  72  0.000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0471437  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0278  periplasmic or secreted lipoprotein  46.99 
 
 
103 aa  71.2  0.000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.406104  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0826  transport-associated  30.72 
 
 
245 aa  70.9  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0362569 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2319  phospholipid-binding domain-containing protein  48.61 
 
 
104 aa  70.1  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3297  transport-associated  29.73 
 
 
201 aa  70.1  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.173268  normal  0.854509 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1939  phospholipid-binding domain-containing protein  48.61 
 
 
104 aa  70.1  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.315443  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2048  transport-associated  48.61 
 
 
104 aa  70.1  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2170  transport-associated  51.39 
 
 
104 aa  69.7  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.395466  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0258  histidine kinase  30.41 
 
 
222 aa  69.7  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.469068 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2673  transport-associated  50 
 
 
104 aa  69.3  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000178392 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0425  hypothetical protein  30.49 
 
 
183 aa  68.2  0.00000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3627  hypothetical protein  33.85 
 
 
190 aa  67  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0449  hypothetical protein  29.88 
 
 
183 aa  65.5  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0950  transport-associated  55.22 
 
 
171 aa  65.5  0.0000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.239728  normal  0.788848 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1094  transport-associated  55.22 
 
 
171 aa  65.5  0.0000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13110  hypothetical protein  31.17 
 
 
161 aa  65.5  0.0000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2802  transport-associated  34.9 
 
 
184 aa  65.5  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5898  transport-associated  43.84 
 
 
116 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2542  transport-associated protein  42.35 
 
 
105 aa  64.3  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000702242 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2185  transport-associated  33.33 
 
 
255 aa  63.9  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1671  transport-associated  43.9 
 
 
105 aa  64.3  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1123  hypothetical protein  37.67 
 
 
191 aa  63.5  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0055  putative osmotically inducible protein  29.76 
 
 
219 aa  63.5  0.000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1033  transport-associated  48.57 
 
 
134 aa  63.9  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.232129  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01237  putative hyperosmotically inducible periplasmic protein  31.01 
 
 
175 aa  62.8  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.315155  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04303  putative phospholipid-binding domain family  49.3 
 
 
120 aa  62.8  0.000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2261  transport-associated  34.38 
 
 
282 aa  62  0.000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4004  transport-associated  39.29 
 
 
104 aa  61.6  0.000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.38345  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0472  hypothetical protein  36.99 
 
 
191 aa  61.6  0.000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0536  hypothetical protein  36.99 
 
 
191 aa  61.6  0.000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.35439  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3436  transport-associated  39.82 
 
 
127 aa  61.2  0.000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.865751  normal  0.0604848 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3785  hypothetical protein  38.36 
 
 
191 aa  61.2  0.000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00453791  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3514  transport-associated  40.66 
 
 
104 aa  61.2  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2837  transport-associated  40.66 
 
 
104 aa  60.8  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.47962  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2956  transport-associated protein  27.5 
 
 
295 aa  61.2  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5456  hypothetical protein  45.07 
 
 
114 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.469146  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62690  hypothetical protein  45.07 
 
 
114 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0063  transport-associated  45.71 
 
 
110 aa  60.1  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.37402  normal  0.306207 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5083  transport-associated protein  40.7 
 
 
151 aa  59.3  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0264  transport-associated  33.12 
 
 
187 aa  59.7  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.47721  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4378  transport-associated  32.74 
 
 
136 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.294226  normal  0.933336 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7765  Smc22-1 ( osmotically inducible sensory protein)  32.43 
 
 
217 aa  59.3  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.705157  normal  0.17558 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3445  hypothetical protein  34.93 
 
 
191 aa  59.3  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3622  hypothetical protein  34.93 
 
 
191 aa  59.3  0.00000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3989  transport-associated  32.74 
 
 
136 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.279726  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3456  hypothetical protein  35.62 
 
 
191 aa  58.9  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3454  hypothetical protein  35.62 
 
 
191 aa  58.9  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3525  hypothetical protein  35.62 
 
 
191 aa  58.9  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.950572  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3622  hypothetical protein  35.62 
 
 
191 aa  58.9  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3562  hypothetical protein  35.62 
 
 
191 aa  58.9  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0916  transport-associated  38.46 
 
 
104 aa  58.5  0.00000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1642  putative periplasmic protein  37.66 
 
 
144 aa  58.5  0.00000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0830703  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2407  transport-associated protein  44.44 
 
 
104 aa  58.5  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00333473  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0177  transport-associated  28.48 
 
 
276 aa  58.5  0.00000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4339  hypothetical protein  36.99 
 
 
191 aa  58.5  0.00000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.135394 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2622  transport-associated  33.55 
 
 
215 aa  58.5  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1788  transport-associated  41.25 
 
 
103 aa  58.2  0.00000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0663263  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0908  transport-associated  31.08 
 
 
177 aa  58.2  0.00000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.324141  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5977  transport-associated  32.14 
 
 
136 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.663122  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0477  transport-associated  40.79 
 
 
103 aa  57.4  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2251  transport-associated  40 
 
 
103 aa  57.8  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1649  transport-associated protein  37.36 
 
 
130 aa  57.8  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4526  transport-associated  27.64 
 
 
192 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43670  Transport-associated protein  43.66 
 
 
120 aa  57.8  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.226738  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4234  transport-associated  35.76 
 
 
215 aa  57.8  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.855371  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03017  hypothetical protein  34.25 
 
 
191 aa  57  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4998  putative lipoprotein  29.78 
 
 
192 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.263747  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3603  transport-associated  43.04 
 
 
116 aa  57  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.335448  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3632  hypothetical protein  34.25 
 
 
191 aa  57  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0930  transport-associated  29.41 
 
 
192 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4469  hypothetical protein  34.25 
 
 
191 aa  57  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3587  hypothetical protein  35.62 
 
 
191 aa  56.6  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.666559  normal  0.189864 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>