238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3297 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3297  transport-associated  100 
 
 
201 aa  401  1e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.173268  normal  0.854509 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3587  transport-associated  34.25 
 
 
191 aa  86.3  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3263  transport-associated protein  33.86 
 
 
272 aa  83.6  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.369629  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3691  transport-associated protein  28.41 
 
 
211 aa  82.8  0.000000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.310052  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1193  transport-associated protein  33.33 
 
 
199 aa  80.5  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0055  putative osmotically inducible protein  29.53 
 
 
219 aa  80.5  0.00000000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2203  transport-associated  32.98 
 
 
188 aa  80.5  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.801164  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0416  transport-associated  35.27 
 
 
224 aa  80.1  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3696  transport-associated  31.46 
 
 
192 aa  79  0.00000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.148519  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0408  transport-associated  34.78 
 
 
224 aa  78.6  0.00000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00888  hypothetical protein  28.78 
 
 
219 aa  76.3  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004504  putative hemolysin  29.23 
 
 
221 aa  75.9  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000000407403  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1195  transport-associated protein  31.97 
 
 
192 aa  73.2  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2657  putative lipoprotein  31.11 
 
 
195 aa  73.2  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5888  periplasmic protein  31.69 
 
 
201 aa  72.8  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.223121  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3627  hypothetical protein  31.64 
 
 
190 aa  72.4  0.000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4973  periplasmic protein  31.69 
 
 
201 aa  71.6  0.000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00297721  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04251  periplasmic protein  31.69 
 
 
201 aa  71.6  0.000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.368391  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3623  transport-associated  31.69 
 
 
201 aa  71.6  0.000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4610  periplasmic protein  31.69 
 
 
201 aa  71.6  0.000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0762495  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04217  hypothetical protein  31.69 
 
 
201 aa  71.6  0.000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.310729  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3681  periplasmic protein  31.69 
 
 
201 aa  71.6  0.000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.261916  hitchhiker  0.00179473 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4923  periplasmic protein  31.69 
 
 
201 aa  71.2  0.000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.497608  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0110  putative lipoprotein  27.87 
 
 
189 aa  71.2  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.319547  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0036  transport-associated  26.29 
 
 
216 aa  70.9  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0240953  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4919  periplasmic protein  31.69 
 
 
201 aa  71.2  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.618733  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1064  transport-associated protein  37.06 
 
 
243 aa  70.1  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.21469 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0366  transport-associated, putative  27.84 
 
 
191 aa  70.5  0.00000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.140163  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3442  transport-associated  32.97 
 
 
219 aa  70.5  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.933167  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0836  periplasmic protein  31.97 
 
 
204 aa  69.7  0.00000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3632  periplasmic protein  31.97 
 
 
204 aa  69.7  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3575  transport-associated protein  32.22 
 
 
220 aa  69.7  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.913691  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3465  periplasmic protein  32.43 
 
 
202 aa  69.3  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0335  putative osmotically inducible protein  29.89 
 
 
202 aa  69.3  0.00000000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.161455  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4976  periplasmic protein  29.73 
 
 
205 aa  69.7  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.163142  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4969  periplasmic protein  29.73 
 
 
205 aa  69.7  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4917  periplasmic protein  29.73 
 
 
205 aa  69.7  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.292031  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4815  periplasmic protein  29.73 
 
 
205 aa  69.7  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4339  hypothetical protein  32.57 
 
 
191 aa  69.3  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.135394 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3503  periplasmic protein  31.97 
 
 
204 aa  69.7  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4882  periplasmic protein  29.73 
 
 
205 aa  69.7  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0715597  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0653  periplasmic protein  28.19 
 
 
204 aa  68.9  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1123  hypothetical protein  30.53 
 
 
191 aa  68.9  0.00000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3562  hypothetical protein  37.61 
 
 
191 aa  68.6  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3456  hypothetical protein  37.61 
 
 
191 aa  68.6  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3525  hypothetical protein  37.61 
 
 
191 aa  68.6  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.950572  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3454  hypothetical protein  37.61 
 
 
191 aa  68.6  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3622  hypothetical protein  37.61 
 
 
191 aa  68.6  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03017  hypothetical protein  33.8 
 
 
191 aa  68.2  0.00000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0555  transport-associated  33.8 
 
 
191 aa  68.2  0.00000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3632  hypothetical protein  33.8 
 
 
191 aa  68.2  0.00000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0548  hypothetical protein  33.8 
 
 
191 aa  68.2  0.00000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.496742  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02968  hypothetical protein  33.8 
 
 
191 aa  68.2  0.00000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4469  hypothetical protein  33.8 
 
 
191 aa  68.2  0.00000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3342  hypothetical protein  33.8 
 
 
191 aa  68.2  0.00000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3428  transport-associated  30.17 
 
 
284 aa  68.2  0.00000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.179471  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0826  transport-associated  31.13 
 
 
245 aa  67.4  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0362569 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3622  hypothetical protein  37.61 
 
 
191 aa  67.4  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3445  hypothetical protein  37.61 
 
 
191 aa  67.4  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0632  transport-associated  31.22 
 
 
218 aa  67.8  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3587  hypothetical protein  33.8 
 
 
191 aa  66.6  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.666559  normal  0.189864 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0536  hypothetical protein  30 
 
 
191 aa  67  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.35439  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0472  hypothetical protein  30 
 
 
191 aa  67  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3875  transport-associated  30 
 
 
214 aa  67  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.835805  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0273  transport-associated  30.43 
 
 
221 aa  66.6  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3785  hypothetical protein  30.9 
 
 
191 aa  66.2  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00453791  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3015  transport-associated  33.1 
 
 
230 aa  66.2  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3462  transport-associated  31.38 
 
 
272 aa  65.9  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13110  hypothetical protein  33.81 
 
 
161 aa  65.5  0.0000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0737  hypothetical protein  28.02 
 
 
195 aa  65.5  0.0000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.131598  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1784  transport-associated  32.08 
 
 
275 aa  65.5  0.0000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0010501  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0535  periplasmic protein  29.58 
 
 
205 aa  64.7  0.0000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.388761  hitchhiker  0.00819185 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1637  transport-associated  29.69 
 
 
229 aa  64.3  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0588013 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0454  periplasmic protein  30.22 
 
 
202 aa  64.3  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.390695  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0073  transport-associated  27.11 
 
 
196 aa  64.3  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3585  periplasmic protein  30.28 
 
 
218 aa  63.2  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0125  transport-associated  30.16 
 
 
267 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4687  transport-associated protein  28.16 
 
 
192 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.314355  normal  0.0505791 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0305  hypothetical protein  36.84 
 
 
190 aa  63.2  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0106896  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0552  periplasmic protein  29.79 
 
 
202 aa  62.4  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.783524  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2199  putative transport-associated  23.16 
 
 
191 aa  62.4  0.000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3264  putative signal peptide protein  29.81 
 
 
271 aa  62.4  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0589  phospholipid-binding domain-containing protein  24.16 
 
 
183 aa  62.4  0.000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3146  transporter, putative  34.71 
 
 
266 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2799  transporter, putative  34.71 
 
 
266 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00116321  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3178  putative phospholipid-binding protein  34.71 
 
 
256 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3898  putative phospholipid-binding protein  34.71 
 
 
266 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0106  hypothetical protein  32.39 
 
 
190 aa  60.8  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.277757  normal  0.0163837 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0039  phospholipid-binding domain-containing protein  34.71 
 
 
266 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3817  putative phospholipid-binding protein  34.71 
 
 
266 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.262069  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1744  putative phospholipid-binding protein  34.71 
 
 
256 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0311  hypothetical protein  35.96 
 
 
190 aa  60.8  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.716428  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0022  putative phospholipid-binding protein  34.71 
 
 
266 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0386174  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3134  transport-associated  31.87 
 
 
272 aa  60.1  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2000  transport-associated protein  26.19 
 
 
185 aa  60.5  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0471437  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3687  transport-associated  28.09 
 
 
188 aa  60.5  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0258  transport-associated  28.09 
 
 
188 aa  60.5  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2185  transport-associated  33.33 
 
 
255 aa  60.5  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3883  transport-associated  28.09 
 
 
188 aa  60.5  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.180812 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2206  transport-associated protein  32.42 
 
 
195 aa  59.7  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>