290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A1195 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A1195  transport-associated protein  100 
 
 		 192 aa  377  1e-104  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1193  transport-associated protein  79.57 
 
 		 199 aa  290  1e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0073  transport-associated  50.89 
 
 		 196 aa  159  3e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0552  periplasmic protein  42.05 
 
 		 202 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.783524  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0454  periplasmic protein  40.51 
 
 		 202 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.390695  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0535  periplasmic protein  40 
 
 		 205 aa  113  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.388761  hitchhiker  0.00819185 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0836  periplasmic protein  47.65 
 
 		 204 aa  113  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3503  periplasmic protein  47.65 
 
 		 204 aa  113  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3632  periplasmic protein  47.65 
 
 		 204 aa  113  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4919  periplasmic protein  44.44 
 
 		 201 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.618733  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4923  periplasmic protein  44.44 
 
 		 201 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.497608  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04251  periplasmic protein  44.44 
 
 		 201 aa  108  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.368391  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3623  transport-associated  44.44 
 
 		 201 aa  108  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5888  periplasmic protein  44.44 
 
 		 201 aa  108  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.223121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4610  periplasmic protein  44.44 
 
 		 201 aa  108  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0762495  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4973  periplasmic protein  44.44 
 
 		 201 aa  108  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00297721  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04217  hypothetical protein  44.44 
 
 		 201 aa  108  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.310729  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3681  periplasmic protein  44.44 
 
 		 201 aa  108  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.261916  hitchhiker  0.00179473 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4815  periplasmic protein  43.79 
 
 		 205 aa  108  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4882  periplasmic protein  43.79 
 
 		 205 aa  108  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0715597  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4969  periplasmic protein  43.79 
 
 		 205 aa  108  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4917  periplasmic protein  43.79 
 
 		 205 aa  108  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.292031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4976  periplasmic protein  43.79 
 
 		 205 aa  108  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.163142  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3465  periplasmic protein  39.6 
 
 		 202 aa  100  9e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0653  periplasmic protein  42.95 
 
 		 204 aa  100  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3585  periplasmic protein  40 
 
 		 218 aa  95.1  5e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2802  transport-associated  39.04 
 
 		 184 aa  82.8  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2673  transport-associated  56.16 
 
 		 104 aa  79.7  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000178392 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2319  phospholipid-binding domain-containing protein  47.56 
 
 		 104 aa  78.6  0.00000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2048  transport-associated  47.56 
 
 		 104 aa  78.6  0.00000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1939  phospholipid-binding domain-containing protein  47.56 
 
 		 104 aa  78.6  0.00000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.315443  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0278  periplasmic or secreted lipoprotein  52.78 
 
 		 103 aa  76.3  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.406104  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5898  transport-associated  41.28 
 
 		 116 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2047  transport-associated protein  52 
 
 		 104 aa  75.1  0.0000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.186123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0950  transport-associated  52.05 
 
 		 171 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.239728  normal  0.788848 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1094  transport-associated  52.05 
 
 		 171 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3297  transport-associated  31.97 
 
 		 201 aa  73.6  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.173268  normal  0.854509 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0477  transport-associated  48.05 
 
 		 103 aa  73.6  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0177  transport-associated  29.01 
 
 		 276 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2261  transport-associated  32.52 
 
 		 282 aa  73.6  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2170  transport-associated  52.78 
 
 		 104 aa  72.4  0.000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.395466  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62690  hypothetical protein  49.48 
 
 		 114 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5456  hypothetical protein  49.48 
 
 		 114 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.469146  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0674  transport-associated  38.26 
 
 		 115 aa  72  0.000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3587  transport-associated  32.21 
 
 		 191 aa  71.6  0.000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2204  transport-associated  34.25 
 
 		 176 aa  70.5  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04303  putative phospholipid-binding domain family  59.68 
 
 		 120 aa  71.2  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3849  transport-associated  38.26 
 
 		 115 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000819027 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3436  transport-associated  45.71 
 
 		 127 aa  70.5  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.865751  normal  0.0604848 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3156  phospholipid-binding domain-containing protein  49.33 
 
 		 246 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1501  transport-associated protein  40.78 
 
 		 104 aa  69.7  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1376  osmotically inducible protein Y  49.33 
 
 		 174 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.177857  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3027  phospholipid-binding domain-containing protein  49.33 
 
 		 184 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.119447  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3627  hypothetical protein  32.5 
 
 		 190 aa  69.3  0.00000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0063  transport-associated  40.2 
 
 		 110 aa  68.2  0.00000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.37402  normal  0.306207 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2407  transport-associated protein  50 
 
 		 104 aa  67.8  0.00000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00333473  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1671  transport-associated  40.2 
 
 		 105 aa  67.8  0.00000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0093  transport-associated protein  41.89 
 
 		 119 aa  67  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.419766  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43670  Transport-associated protein  42.11 
 
 		 120 aa  67  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.226738  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1642  putative periplasmic protein  48.05 
 
 		 144 aa  66.6  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0830703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5156  transport-associated protein  45.35 
 
 		 115 aa  67  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.609853 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2542  transport-associated protein  38.24 
 
 		 105 aa  66.2  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000702242 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3785  hypothetical protein  31.64 
 
 		 191 aa  66.2  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00453791  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1123  hypothetical protein  33.12 
 
 		 191 aa  66.2  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2078  transport-associated  36.19 
 
 		 113 aa  65.5  0.0000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.278114  normal  0.920711 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3587  hypothetical protein  31.45 
 
 		 191 aa  65.9  0.0000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.666559  normal  0.189864 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1784  transport-associated  31.45 
 
 		 275 aa  65.1  0.0000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0010501  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0826  transport-associated  31.65 
 
 		 245 aa  65.5  0.0000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0362569 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0258  histidine kinase  29.78 
 
 		 222 aa  65.1  0.0000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.469068 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3445  hypothetical protein  30.63 
 
 		 191 aa  64.7  0.0000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1788  transport-associated  47.22 
 
 		 103 aa  64.7  0.0000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0663263  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03017  hypothetical protein  30.63 
 
 		 191 aa  64.7  0.0000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0555  transport-associated  30.63 
 
 		 191 aa  64.7  0.0000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3342  hypothetical protein  30.63 
 
 		 191 aa  64.7  0.0000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3622  hypothetical protein  30.63 
 
 		 191 aa  64.7  0.0000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02968  hypothetical protein  30.63 
 
 		 191 aa  64.7  0.0000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0548  hypothetical protein  30.63 
 
 		 191 aa  64.7  0.0000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.496742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4469  hypothetical protein  30.63 
 
 		 191 aa  64.7  0.0000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3632  hypothetical protein  30.63 
 
 		 191 aa  64.7  0.0000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2000  transport-associated protein  33.55 
 
 		 185 aa  64.3  0.0000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0471437  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0536  hypothetical protein  32.48 
 
 		 191 aa  64.3  0.0000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.35439  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0472  hypothetical protein  32.48 
 
 		 191 aa  64.3  0.0000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3603  transport-associated  50.77 
 
 		 116 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.335448  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2553  hypothetical protein  29.41 
 
 		 278 aa  63.2  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4484  hypothetical protein  50 
 
 		 117 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1033  transport-associated  47.22 
 
 		 134 aa  63.2  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.232129  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3412  transport-associated  37.14 
 
 		 116 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5244  transport-associated  37.14 
 
 		 116 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.797989  normal  0.73518 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3622  hypothetical protein  30.19 
 
 		 191 aa  62  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3454  hypothetical protein  30.19 
 
 		 191 aa  62  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3525  hypothetical protein  30.19 
 
 		 191 aa  62  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.950572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3562  hypothetical protein  30.19 
 
 		 191 aa  62  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3456  hypothetical protein  30.19 
 
 		 191 aa  62  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1805  transport-associated protein  44 
 
 		 106 aa  61.6  0.000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2077  transport-associated  30.82 
 
 		 307 aa  61.6  0.000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.735501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4133  transport-associated  30.05 
 
 		 188 aa  61.6  0.000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3867  transport-associated  43.24 
 
 		 104 aa  61.2  0.000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0875  transport-associated  38.46 
 
 		 104 aa  60.8  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.647487  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0916  transport-associated  36.63 
 
 		 104 aa  60.5  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0305  hypothetical protein  30.13 
 
 		 190 aa  60.8  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0106896  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>