279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A1193 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A1193  transport-associated protein  100 
 
 
199 aa  392  1e-108  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1195  transport-associated protein  79.57 
 
 
192 aa  290  1e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0073  transport-associated  54.49 
 
 
196 aa  180  2e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4923  periplasmic protein  42.19 
 
 
201 aa  121  9e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.497608  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0454  periplasmic protein  48.32 
 
 
202 aa  120  9.999999999999999e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.390695  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4973  periplasmic protein  42.19 
 
 
201 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00297721  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04251  periplasmic protein  42.19 
 
 
201 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.368391  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3623  transport-associated  42.19 
 
 
201 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4610  periplasmic protein  42.19 
 
 
201 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0762495  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04217  hypothetical protein  42.19 
 
 
201 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.310729  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3681  periplasmic protein  42.19 
 
 
201 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.261916  hitchhiker  0.00179473 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5888  periplasmic protein  42.19 
 
 
201 aa  119  3e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.223121  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4919  periplasmic protein  41.03 
 
 
201 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.618733  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0552  periplasmic protein  47.65 
 
 
202 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.783524  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4976  periplasmic protein  38.86 
 
 
205 aa  115  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.163142  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4882  periplasmic protein  38.86 
 
 
205 aa  115  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0715597  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4969  periplasmic protein  38.86 
 
 
205 aa  115  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0535  periplasmic protein  46.41 
 
 
205 aa  115  3e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.388761  hitchhiker  0.00819185 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4917  periplasmic protein  38.86 
 
 
205 aa  115  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.292031  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4815  periplasmic protein  38.86 
 
 
205 aa  115  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3632  periplasmic protein  46.31 
 
 
204 aa  112  4.0000000000000004e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3503  periplasmic protein  46.31 
 
 
204 aa  112  4.0000000000000004e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0836  periplasmic protein  46.31 
 
 
204 aa  112  4.0000000000000004e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0653  periplasmic protein  44.97 
 
 
204 aa  109  3e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3585  periplasmic protein  42.67 
 
 
218 aa  104  9e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3465  periplasmic protein  39.33 
 
 
202 aa  101  9e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3587  transport-associated  32.98 
 
 
191 aa  88.6  6e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2802  transport-associated  38.36 
 
 
184 aa  86.3  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2261  transport-associated  34.97 
 
 
282 aa  85.1  7e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2078  transport-associated  38.26 
 
 
113 aa  83.6  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.278114  normal  0.920711 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1939  phospholipid-binding domain-containing protein  42.73 
 
 
104 aa  81.6  0.000000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.315443  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2048  transport-associated  42.73 
 
 
104 aa  81.6  0.000000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2319  phospholipid-binding domain-containing protein  42.73 
 
 
104 aa  81.6  0.000000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1123  hypothetical protein  34.74 
 
 
191 aa  81.3  0.000000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3587  hypothetical protein  34.9 
 
 
191 aa  81.3  0.000000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.666559  normal  0.189864 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0536  hypothetical protein  34.74 
 
 
191 aa  80.9  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.35439  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0472  hypothetical protein  34.74 
 
 
191 aa  80.9  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3297  transport-associated  33.33 
 
 
201 aa  80.9  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.173268  normal  0.854509 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3627  hypothetical protein  36.25 
 
 
190 aa  79  0.00000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3622  hypothetical protein  33.68 
 
 
191 aa  78.6  0.00000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03017  hypothetical protein  33.68 
 
 
191 aa  78.6  0.00000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0555  transport-associated  33.68 
 
 
191 aa  78.6  0.00000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3632  hypothetical protein  33.68 
 
 
191 aa  78.6  0.00000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02968  hypothetical protein  33.68 
 
 
191 aa  78.6  0.00000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0548  hypothetical protein  33.68 
 
 
191 aa  78.6  0.00000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.496742  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3342  hypothetical protein  33.68 
 
 
191 aa  78.6  0.00000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4469  hypothetical protein  33.68 
 
 
191 aa  78.6  0.00000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3785  hypothetical protein  36.81 
 
 
191 aa  78.6  0.00000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00453791  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2673  transport-associated  54.17 
 
 
104 aa  78.2  0.00000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000178392 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3456  hypothetical protein  34.24 
 
 
191 aa  77.4  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3454  hypothetical protein  34.24 
 
 
191 aa  77.4  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3562  hypothetical protein  34.24 
 
 
191 aa  77.4  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3445  hypothetical protein  33.16 
 
 
191 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3525  hypothetical protein  34.24 
 
 
191 aa  77.4  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.950572  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3622  hypothetical protein  34.24 
 
 
191 aa  77.4  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1784  transport-associated  29.33 
 
 
275 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0010501  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0950  transport-associated  53.42 
 
 
171 aa  75.1  0.0000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.239728  normal  0.788848 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1094  transport-associated  53.42 
 
 
171 aa  75.1  0.0000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0674  transport-associated  44.44 
 
 
115 aa  74.7  0.0000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1501  transport-associated protein  38.6 
 
 
104 aa  73.9  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0063  transport-associated  51.39 
 
 
110 aa  73.6  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.37402  normal  0.306207 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2000  transport-associated protein  31.31 
 
 
185 aa  73.6  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0471437  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0177  transport-associated  29.01 
 
 
276 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5898  transport-associated  37.1 
 
 
116 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0305  hypothetical protein  31.98 
 
 
190 aa  73.6  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0106896  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2204  transport-associated  33.33 
 
 
176 aa  72.8  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04303  putative phospholipid-binding domain family  62.9 
 
 
120 aa  73.2  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2047  transport-associated protein  38.94 
 
 
104 aa  72.4  0.000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.186123  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0737  hypothetical protein  37.5 
 
 
195 aa  71.2  0.000000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.131598  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2407  transport-associated protein  41.07 
 
 
104 aa  70.9  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00333473  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2203  transport-associated  30.73 
 
 
188 aa  71.2  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.801164  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0311  hypothetical protein  31.47 
 
 
190 aa  70.9  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.716428  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2170  transport-associated  51.39 
 
 
104 aa  70.5  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.395466  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0278  periplasmic or secreted lipoprotein  48.61 
 
 
103 aa  69.7  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.406104  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0093  transport-associated protein  35.92 
 
 
119 aa  68.9  0.00000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.419766  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3849  transport-associated  38.74 
 
 
115 aa  68.9  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  unclonable  0.00000819027 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1642  putative periplasmic protein  46.67 
 
 
144 aa  68.6  0.00000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0830703  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2553  hypothetical protein  33.12 
 
 
278 aa  68.2  0.00000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3156  phospholipid-binding domain-containing protein  46.67 
 
 
246 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3027  phospholipid-binding domain-containing protein  46.67 
 
 
184 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.119447  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0258  histidine kinase  28.92 
 
 
222 aa  67.4  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.469068 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4339  hypothetical protein  32.97 
 
 
191 aa  67.4  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.135394 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3436  transport-associated  45.13 
 
 
127 aa  67.8  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.865751  normal  0.0604848 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0477  transport-associated  35.14 
 
 
103 aa  66.6  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1376  osmotically inducible protein Y  46.67 
 
 
174 aa  67  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.177857  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0335  putative osmotically inducible protein  31.17 
 
 
202 aa  66.2  0.0000000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.161455  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4998  putative lipoprotein  36.24 
 
 
192 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.263747  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0826  transport-associated  32.28 
 
 
245 aa  65.5  0.0000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0362569 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5456  hypothetical protein  55.56 
 
 
114 aa  64.7  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.469146  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62690  hypothetical protein  55.56 
 
 
114 aa  64.7  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1671  transport-associated  44.44 
 
 
105 aa  63.9  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3603  transport-associated  48.57 
 
 
116 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.335448  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001941  putative hyperosmotically inducible periplasmic protein  31.94 
 
 
183 aa  63.9  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43670  Transport-associated protein  47.89 
 
 
120 aa  64.3  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.226738  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0321  hypothetical protein  35.57 
 
 
198 aa  63.5  0.000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1033  transport-associated  45.83 
 
 
134 aa  63.2  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.232129  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57510  putative secreted lipoprotein  35.57 
 
 
192 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2542  transport-associated protein  41.67 
 
 
105 aa  62.4  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000702242 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1788  transport-associated  45.83 
 
 
103 aa  62.4  0.000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0663263  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1119  transport-associated  41.07 
 
 
104 aa  62.4  0.000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.777172 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>