More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0653 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_0653  periplasmic protein  100 
 
 		 204 aa  392  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3632  periplasmic protein  75 
 
 		 204 aa  304  5.0000000000000004e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3503  periplasmic protein  75 
 
 		 204 aa  304  5.0000000000000004e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0836  periplasmic protein  75 
 
 		 204 aa  301  3.0000000000000004e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0535  periplasmic protein  74.5 
 
 		 205 aa  277  6e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.388761  hitchhiker  0.00819185 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4917  periplasmic protein  67.49 
 
 		 205 aa  255  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.292031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4976  periplasmic protein  67.49 
 
 		 205 aa  255  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.163142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4882  periplasmic protein  67.49 
 
 		 205 aa  255  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0715597  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4969  periplasmic protein  67.49 
 
 		 205 aa  255  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4815  periplasmic protein  67.49 
 
 		 205 aa  255  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4923  periplasmic protein  68.47 
 
 		 201 aa  254  5e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.497608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4919  periplasmic protein  68.97 
 
 		 201 aa  254  8e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.618733  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04251  periplasmic protein  68.47 
 
 		 201 aa  253  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.368391  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3623  transport-associated  68.47 
 
 		 201 aa  253  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04217  hypothetical protein  68.47 
 
 		 201 aa  253  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.310729  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3681  periplasmic protein  68.47 
 
 		 201 aa  253  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.261916  hitchhiker  0.00179473 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4610  periplasmic protein  68.47 
 
 		 201 aa  253  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0762495  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5888  periplasmic protein  68.47 
 
 		 201 aa  252  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.223121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4973  periplasmic protein  67.49 
 
 		 201 aa  250  8.000000000000001e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00297721  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0454  periplasmic protein  67.98 
 
 		 202 aa  249  1e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.390695  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0552  periplasmic protein  66.5 
 
 		 202 aa  248  5e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.783524  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3585  periplasmic protein  59.7 
 
 		 218 aa  218  5e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3465  periplasmic protein  48.28 
 
 		 202 aa  180  2e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1193  transport-associated protein  44.97 
 
 		 199 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1195  transport-associated protein  42.95 
 
 		 192 aa  100  1e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0073  transport-associated  39.64 
 
 		 196 aa  97.4  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0425  hypothetical protein  33.54 
 
 		 183 aa  76.6  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2185  transport-associated  36.55 
 
 		 255 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2673  transport-associated  56.34 
 
 		 104 aa  75.9  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000178392 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0449  hypothetical protein  31.65 
 
 		 183 aa  74.3  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2048  transport-associated  50.7 
 
 		 104 aa  72.8  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2319  phospholipid-binding domain-containing protein  50.7 
 
 		 104 aa  72.8  0.000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1939  phospholipid-binding domain-containing protein  50.7 
 
 		 104 aa  72.8  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.315443  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0278  periplasmic or secreted lipoprotein  48.19 
 
 		 103 aa  72  0.000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.406104  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4004  transport-associated  41.77 
 
 		 104 aa  70.9  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.38345  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0916  transport-associated  43.04 
 
 		 104 aa  71.2  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3297  transport-associated  28.19 
 
 		 201 aa  69.3  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.173268  normal  0.854509 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2170  transport-associated  47.37 
 
 		 104 aa  69.7  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.395466  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2047  transport-associated protein  50 
 
 		 104 aa  68.9  0.00000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.186123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2000  transport-associated protein  34.01 
 
 		 185 aa  67  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0471437  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0177  transport-associated  30.57 
 
 		 276 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0875  transport-associated  39.24 
 
 		 104 aa  66.6  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.647487  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2837  transport-associated  41.77 
 
 		 104 aa  66.6  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.47962  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3514  transport-associated  40.51 
 
 		 104 aa  66.2  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0950  transport-associated  55.22 
 
 		 171 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.239728  normal  0.788848 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1094  transport-associated  55.22 
 
 		 171 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0826  transport-associated  29.81 
 
 		 245 aa  66.2  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0362569 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2300  transport-associated  33.56 
 
 		 217 aa  66.2  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.53534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2622  transport-associated  34.42 
 
 		 215 aa  65.9  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0477  transport-associated  46.48 
 
 		 103 aa  65.9  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1501  transport-associated protein  48 
 
 		 104 aa  65.9  0.0000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3867  transport-associated  41.56 
 
 		 104 aa  65.5  0.0000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7765  Smc22-1 ( osmotically inducible sensory protein)  33.11 
 
 		 217 aa  65.5  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.705157  normal  0.17558 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0258  histidine kinase  31.21 
 
 		 222 aa  65.5  0.0000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.469068 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2251  transport-associated  42.25 
 
 		 103 aa  63.9  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2343  transport-associated  35 
 
 		 104 aa  63.5  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.259537  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4234  transport-associated  34.67 
 
 		 215 aa  63.5  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.855371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1033  transport-associated  36.21 
 
 		 134 aa  62.4  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.232129  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2956  transport-associated protein  27.89 
 
 		 295 aa  62.4  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04303  putative phospholipid-binding domain family  49.3 
 
 		 120 aa  62  0.000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2802  transport-associated  32.88 
 
 		 184 aa  61.6  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1788  transport-associated  45.71 
 
 		 103 aa  61.6  0.000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0663263  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3587  transport-associated  29.08 
 
 		 191 aa  60.5  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2909  putative lipoprotein  42.31 
 
 		 104 aa  60.1  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.434819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001941  putative hyperosmotically inducible periplasmic protein  30.87 
 
 		 183 aa  60.1  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7783  putative osmotically-inducible protein Y (precursor)  32.08 
 
 		 220 aa  60.5  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.379132  normal  0.155349 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0204  hypothetical protein  32.33 
 
 		 219 aa  59.7  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1805  transport-associated protein  37.66 
 
 		 106 aa  59.7  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0908  transport-associated  31.33 
 
 		 177 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.324141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2261  transport-associated  31.79 
 
 		 282 aa  59.3  0.00000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1123  hypothetical protein  34.23 
 
 		 191 aa  59.7  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6897  transport-associated  33.57 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.35821  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2549  hypothetical protein  46.15 
 
 		 113 aa  58.9  0.00000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3627  hypothetical protein  33.78 
 
 		 190 aa  58.9  0.00000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0063  transport-associated  41.56 
 
 		 110 aa  58.9  0.00000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.37402  normal  0.306207 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3027  phospholipid-binding domain-containing protein  42.71 
 
 		 184 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.119447  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0262  transport-associated protein  30.71 
 
 		 279 aa  58.5  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1317  transport-associated  36.07 
 
 		 181 aa  58.5  0.00000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3156  phospholipid-binding domain-containing protein  42.71 
 
 		 246 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1376  osmotically inducible protein Y  43.62 
 
 		 174 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.177857  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3328  transport-associated  33.56 
 
 		 217 aa  58.2  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.686073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01237  putative hyperosmotically inducible periplasmic protein  28.48 
 
 		 175 aa  58.2  0.00000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.315155  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5898  transport-associated  42.86 
 
 		 116 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62690  hypothetical protein  42.47 
 
 		 114 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5456  hypothetical protein  42.47 
 
 		 114 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.469146  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0536  hypothetical protein  33.56 
 
 		 191 aa  57.8  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.35439  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0472  hypothetical protein  33.56 
 
 		 191 aa  57.8  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4562  transport-associated  31.69 
 
 		 215 aa  57  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.266043 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4429  transport-associated  31.69 
 
 		 215 aa  57  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0790  hypothetical protein  48.57 
 
 		 103 aa  56.6  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0761  hypothetical protein  48.57 
 
 		 103 aa  57  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1796  transport-associated  37.8 
 
 		 108 aa  57.4  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4998  putative lipoprotein  31.61 
 
 		 192 aa  57  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.263747  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0589  phospholipid-binding domain-containing protein  30.56 
 
 		 183 aa  56.6  0.0000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2264  transport-associated  28.79 
 
 		 216 aa  57  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3785  hypothetical protein  33.33 
 
 		 191 aa  56.6  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00453791  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0726  transport-associated  47.89 
 
 		 117 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.724439  normal  0.0177667 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2437  CBS domain containing protein  29.41 
 
 		 628 aa  56.6  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000875184  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0264  transport-associated  31.74 
 
 		 187 aa  56.2  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.47721  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3849  transport-associated  33.03 
 
 		 115 aa  55.8  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000819027 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>