204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_3445 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E3622  hypothetical protein  99.48 
 
 
191 aa  380  1e-105  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3445  hypothetical protein  100 
 
 
191 aa  381  1e-105  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03017  hypothetical protein  98.95 
 
 
191 aa  378  1e-104  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0555  transport-associated  98.95 
 
 
191 aa  378  1e-104  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3632  hypothetical protein  98.95 
 
 
191 aa  378  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3342  hypothetical protein  98.95 
 
 
191 aa  378  1e-104  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0548  hypothetical protein  98.95 
 
 
191 aa  378  1e-104  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.496742  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02968  hypothetical protein  98.95 
 
 
191 aa  378  1e-104  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4469  hypothetical protein  98.95 
 
 
191 aa  378  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3456  hypothetical protein  92.67 
 
 
191 aa  330  5e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3525  hypothetical protein  92.67 
 
 
191 aa  330  5e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.950572  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3562  hypothetical protein  92.67 
 
 
191 aa  330  5e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3454  hypothetical protein  92.67 
 
 
191 aa  330  5e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3622  hypothetical protein  92.67 
 
 
191 aa  330  5e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3587  hypothetical protein  86.91 
 
 
191 aa  314  6e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.666559  normal  0.189864 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4339  hypothetical protein  74.87 
 
 
191 aa  293  1e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.135394 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3785  hypothetical protein  73.16 
 
 
191 aa  285  4e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00453791  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3627  hypothetical protein  72.11 
 
 
190 aa  283  9e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0472  hypothetical protein  74.87 
 
 
191 aa  268  2.9999999999999997e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0536  hypothetical protein  74.87 
 
 
191 aa  268  2.9999999999999997e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.35439  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0305  hypothetical protein  71.73 
 
 
190 aa  267  8e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0106896  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1123  hypothetical protein  73.82 
 
 
191 aa  265  2.9999999999999995e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0311  hypothetical protein  70.16 
 
 
190 aa  260  6.999999999999999e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.716428  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0737  hypothetical protein  51.41 
 
 
195 aa  188  4e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.131598  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0297  putative lipoprotein  39.79 
 
 
188 aa  152  2e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3687  transport-associated  39.79 
 
 
188 aa  152  4e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0258  transport-associated  39.79 
 
 
188 aa  152  4e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3883  transport-associated  39.79 
 
 
188 aa  152  4e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.180812 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4190  transport-associated  40.21 
 
 
188 aa  151  7e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4072  transport-associated  40.21 
 
 
188 aa  151  7e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3992  transport-associated  40.21 
 
 
188 aa  151  7e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4102  transport-associated  40.21 
 
 
188 aa  151  7e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3695  transport-associated  38.74 
 
 
188 aa  147  9e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.904296  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0270  transport-associated  41.95 
 
 
191 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000691335  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3357  putative lipoprotein  40.43 
 
 
188 aa  144  1e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0349  transport-associated protein  39.04 
 
 
189 aa  141  6e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.118689  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0386  transport-associated  38.46 
 
 
189 aa  137  6e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3696  transport-associated  39.67 
 
 
192 aa  137  1e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.148519  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0249  transport-associated  37.57 
 
 
189 aa  135  2e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0224  transport-associated  40.94 
 
 
189 aa  134  5e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.130883  normal  0.197651 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4526  transport-associated  37.44 
 
 
192 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4254  transport-associated  39.18 
 
 
189 aa  129  3e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000113499 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4402  transport-associated  37.44 
 
 
192 aa  128  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.148625 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1322  transport-associated protein  37.44 
 
 
192 aa  128  6e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2657  putative lipoprotein  39.68 
 
 
195 aa  127  1.0000000000000001e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0930  transport-associated  36.96 
 
 
192 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004504  putative hemolysin  38.25 
 
 
221 aa  125  5e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000000407403  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3063  hypothetical protein  38.38 
 
 
190 aa  124  9e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4435  putative transport protein  39.01 
 
 
202 aa  124  1e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2920  hypothetical protein  38.38 
 
 
190 aa  124  1e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4998  putative lipoprotein  39.87 
 
 
192 aa  122  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.263747  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4687  transport-associated protein  39.22 
 
 
192 aa  120  8e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.314355  normal  0.0505791 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57510  putative secreted lipoprotein  39.22 
 
 
192 aa  120  9e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00888  hypothetical protein  36.07 
 
 
219 aa  120  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0353  periplasmic or secreted lipoprotein  35.57 
 
 
200 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03360  transport-associated  38.46 
 
 
170 aa  117  9.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1174  transport-associated  37.85 
 
 
189 aa  117  9.999999999999999e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.382619  normal  0.116131 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0416  transport-associated  40.12 
 
 
224 aa  115  3e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0110  putative lipoprotein  37.43 
 
 
189 aa  115  3.9999999999999997e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.319547  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0408  transport-associated  40.12 
 
 
224 aa  114  6e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4422  lipoprotein, putative  37.57 
 
 
192 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.303803  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1936  putative phospholipid-binding liporotein  37.91 
 
 
191 aa  113  2.0000000000000002e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00720124  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2206  transport-associated protein  36.84 
 
 
195 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0257  lipoprotein  37.91 
 
 
191 aa  113  2.0000000000000002e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4116  transport-associated protein  39.22 
 
 
192 aa  112  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13110  hypothetical protein  39.22 
 
 
161 aa  111  5e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0908  transport-associated  41.25 
 
 
177 aa  111  7.000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.324141  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3146  transporter, putative  35.2 
 
 
266 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2203  transport-associated  32.02 
 
 
188 aa  109  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.801164  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3428  transport-associated  37.3 
 
 
284 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.179471  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0500  transport-associated protein  37.71 
 
 
222 aa  108  5e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.476678 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2799  transporter, putative  34.64 
 
 
266 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00116321  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0039  phospholipid-binding domain-containing protein  34.64 
 
 
266 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0022  putative phospholipid-binding protein  34.64 
 
 
266 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0386174  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1744  putative phospholipid-binding protein  34.64 
 
 
256 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3817  putative phospholipid-binding protein  34.64 
 
 
266 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.262069  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3898  putative phospholipid-binding protein  34.64 
 
 
266 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3178  putative phospholipid-binding protein  34.64 
 
 
256 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3442  transport-associated  36.36 
 
 
219 aa  105  4e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.933167  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0199  transport-associated protein  34.46 
 
 
265 aa  105  6e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.89233  unclonable  0.00000000000748386 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3148  putative lipoprotein  35.23 
 
 
192 aa  104  8e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3393  periplasmic or secreted lipoprotein  34.66 
 
 
265 aa  103  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0632  transport-associated  35.8 
 
 
218 aa  103  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0273  transport-associated  37.3 
 
 
221 aa  103  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3575  transport-associated protein  34.3 
 
 
220 aa  102  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.913691  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0218  transport-associated  33.15 
 
 
265 aa  102  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.011843 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0273  transport-associated  33.52 
 
 
266 aa  101  6e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0122562 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2814  transport-associated  33.52 
 
 
266 aa  101  6e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0292  transport-associated  33.52 
 
 
266 aa  101  6e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2285  transport-associated  37.37 
 
 
194 aa  101  7e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.590876 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3263  transport-associated protein  34.29 
 
 
272 aa  99.4  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.369629  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0204  transport-associated  32.58 
 
 
265 aa  98.6  5e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0125  transport-associated  32.96 
 
 
267 aa  97.1  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3875  transport-associated  34.05 
 
 
214 aa  97.4  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.835805  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0036  transport-associated  32.07 
 
 
216 aa  97.4  1e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0240953  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0628  transport-associated  36.9 
 
 
215 aa  95.9  3e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0106  hypothetical protein  37.42 
 
 
190 aa  95.1  5e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.277757  normal  0.0163837 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1064  transport-associated protein  38.51 
 
 
243 aa  92  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.21469 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0407  transport-associated  33.52 
 
 
265 aa  89  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3264  putative signal peptide protein  34.25 
 
 
271 aa  87  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>