259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_1784 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_1784  transport-associated  100 
 
 		 275 aa  551  1e-156  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0010501  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2553  hypothetical protein  83.09 
 
 		 278 aa  430  1e-119  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2261  transport-associated  52.38 
 
 		 282 aa  273  3e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0177  transport-associated  42.53 
 
 		 276 aa  193  3e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0262  transport-associated protein  41.32 
 
 		 279 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0333  hypothetical protein  40.08 
 
 		 279 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5094  transport-associated  31.75 
 
 		 273 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0983587  normal  0.219919 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0151  transport-associated  30.29 
 
 		 273 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0149  transport-associated  29.2 
 
 		 273 aa  135  5e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.798997 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0134  transport-associated protein  29.93 
 
 		 273 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.892998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2185  transport-associated  29.72 
 
 		 255 aa  100  4e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4133  transport-associated  33.76 
 
 		 188 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0826  transport-associated  28.79 
 
 		 245 aa  77  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0362569 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1193  transport-associated protein  29.33 
 
 		 199 aa  76.3  0.0000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43670  Transport-associated protein  50.75 
 
 		 120 aa  76.3  0.0000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.226738  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5456  hypothetical protein  52.24 
 
 		 114 aa  75.5  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.469146  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62690  hypothetical protein  52.24 
 
 		 114 aa  75.5  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01237  putative hyperosmotically inducible periplasmic protein  35.22 
 
 		 175 aa  74.7  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.315155  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3603  transport-associated  45.21 
 
 		 116 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.335448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04303  putative phospholipid-binding domain family  50.75 
 
 		 120 aa  72  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4565  transport-associated  26.25 
 
 		 217 aa  70.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.192769 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4432  transport-associated  26.25 
 
 		 217 aa  70.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0258  histidine kinase  29.75 
 
 		 222 aa  69.7  0.00000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.469068 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6692  transport-associated  25.63 
 
 		 543 aa  68.6  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0073  transport-associated  32.08 
 
 		 196 aa  68.6  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2956  transport-associated protein  26.73 
 
 		 295 aa  68.2  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0189  hypothetical protein  26.48 
 
 		 215 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.193269 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3436  transport-associated  41.49 
 
 		 127 aa  66.6  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.865751  normal  0.0604848 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0155  OsmY domain-containing protein  29.53 
 
 		 216 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1220  transport-associated protein  25.11 
 
 		 214 aa  66.2  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1324  OsmY domain-containing protein  29.53 
 
 		 216 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1025  OsmY domain-containing protein  29.53 
 
 		 197 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2759  putative phospholipid-binding protein  29.53 
 
 		 216 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0180  OsmY domain-containing protein  29.53 
 
 		 216 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2616  putative phospholipid-binding protein  29.53 
 
 		 216 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3297  transport-associated  32.08 
 
 		 201 aa  66.2  0.0000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.173268  normal  0.854509 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1317  transport-associated  35.34 
 
 		 181 aa  66.2  0.0000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001941  putative hyperosmotically inducible periplasmic protein  36.76 
 
 		 183 aa  65.9  0.0000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3707  transport-associated  30.23 
 
 		 181 aa  65.5  0.0000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.101636  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1195  transport-associated protein  31.45 
 
 		 192 aa  65.1  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0453  OsmY domain-containing protein  30.2 
 
 		 197 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584382  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0353  phospholipid binding protein  26.61 
 
 		 216 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5932  transport-associated protein  25.51 
 
 		 216 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3995  transport-associated  31.01 
 
 		 182 aa  65.1  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000543546  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5562  transport-associated  25.75 
 
 		 216 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.221455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1415  transport-associated  34.81 
 
 		 184 aa  63.2  0.000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0186  hypothetical protein  25.32 
 
 		 217 aa  62.4  0.000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.117611 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1108  transport-associated  25.44 
 
 		 216 aa  62  0.000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2077  transport-associated  25.35 
 
 		 307 aa  62  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.735501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3886  transport-associated  24.79 
 
 		 214 aa  62  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.121  normal  0.085803 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4339  hypothetical protein  31.16 
 
 		 191 aa  60.8  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.135394 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3632  periplasmic protein  49.23 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3328  transport-associated  23.38 
 
 		 217 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.686073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3503  periplasmic protein  49.23 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5879  transport-associated protein  23.87 
 
 		 215 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0836  periplasmic protein  49.23 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1664  hypothetical protein  27.05 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0800901  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6209  transport-associated  24.77 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.716513 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1405  transport-associated protein  35.77 
 
 		 184 aa  60.8  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1441  transport-associated  34.38 
 
 		 184 aa  60.1  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0264  transport-associated  28.29 
 
 		 187 aa  60.1  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.47721  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1111  transport-associated  26.28 
 
 		 226 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2744  transport-associated  33.06 
 
 		 182 aa  60.1  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3585  periplasmic protein  29.3 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2939  transport-associated  34.38 
 
 		 184 aa  59.7  0.00000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.537293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0726  transport-associated  46.27 
 
 		 117 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.724439  normal  0.0177667 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2676  transport-associated  35.54 
 
 		 182 aa  59.7  0.00000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2851  transport-associated  35.54 
 
 		 182 aa  59.7  0.00000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.884447 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4706  transport-associated  43.28 
 
 		 116 aa  59.3  0.00000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.275207  normal  0.0404063 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1200  transport-associated  27.81 
 
 		 217 aa  58.9  0.00000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.649848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0390  transport-associated  22.83 
 
 		 217 aa  58.9  0.00000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3634  transport-associated  30 
 
 		 228 aa  58.5  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000681524 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0454  periplasmic protein  48.53 
 
 		 202 aa  58.5  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.390695  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4707  transport-associated protein  46.27 
 
 		 116 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00217947 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4484  hypothetical protein  41.43 
 
 		 117 aa  57  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4572  transport-associated  46.27 
 
 		 116 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.414411  normal  0.472278 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2613  transport-associated  25.83 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.574258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7765  Smc22-1 ( osmotically inducible sensory protein)  26.29 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.705157  normal  0.17558 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0552  periplasmic protein  48.53 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.783524  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5912  transport-associated protein  27.18 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.203256  normal  0.355197 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2456  transport-associated  23.4 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.262468  normal  0.570841 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6189  transport-associated  25.56 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.551844  normal  0.435123 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0737  hypothetical protein  30.57 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.131598  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1101  transport-associated  22.52 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4422  lipoprotein, putative  32.08 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.303803  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4234  transport-associated  22.82 
 
 		 215 aa  55.5  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.855371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6056  transport-associated  24 
 
 		 226 aa  55.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.822447  hitchhiker  0.00012166 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4818  transport-associated protein  43.28 
 
 		 118 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.958315  normal  0.118263 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1892  putative phophoslipid binding protein  23.42 
 
 		 216 aa  55.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.953866 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6897  transport-associated  26.97 
 
 		 217 aa  54.3  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.35821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004504  putative hemolysin  34.03 
 
 		 221 aa  54.7  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000000407403  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2657  putative lipoprotein  31.91 
 
 		 195 aa  54.3  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0139  transport-associated protein  26.75 
 
 		 223 aa  54.7  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3465  periplasmic protein  44.62 
 
 		 202 aa  54.3  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1123  hypothetical protein  28.48 
 
 		 191 aa  54.3  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13110  hypothetical protein  29.52 
 
 		 161 aa  54.3  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0653  periplasmic protein  28.48 
 
 		 204 aa  54.7  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1868  transport-associated  24.49 
 
 		 216 aa  53.9  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.882392  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0305  hypothetical protein  29.7 
 
 		 190 aa  53.5  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0106896  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0278  periplasmic or secreted lipoprotein  40 
 
 		 103 aa  53.9  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.406104  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>