169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2956 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2956  transport-associated protein  100 
 
 		 295 aa  602  1.0000000000000001e-171  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1310  transport-associated  29.41 
 
 		 179 aa  72.4  0.000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0905482  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1220  transport-associated protein  31.75 
 
 		 214 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3600  transport-associated  25.17 
 
 		 175 aa  71.6  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2077  transport-associated  28.5 
 
 		 307 aa  69.7  0.00000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.735501  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3585  periplasmic protein  29.07 
 
 		 218 aa  68.6  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1784  transport-associated  26.73 
 
 		 275 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0010501  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1151  transport-associated protein  34.06 
 
 		 141 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2553  hypothetical protein  25.46 
 
 		 278 aa  65.5  0.0000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0836  periplasmic protein  26.88 
 
 		 204 aa  63.2  0.000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3632  periplasmic protein  26.88 
 
 		 204 aa  63.2  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3503  periplasmic protein  26.88 
 
 		 204 aa  63.2  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0653  periplasmic protein  27.89 
 
 		 204 aa  62.4  0.000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4917  periplasmic protein  27.5 
 
 		 205 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.292031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4882  periplasmic protein  27.5 
 
 		 205 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0715597  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4976  periplasmic protein  27.5 
 
 		 205 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.163142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4969  periplasmic protein  27.5 
 
 		 205 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4815  periplasmic protein  27.5 
 
 		 205 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2622  transport-associated  25.12 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0552  periplasmic protein  26.53 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.783524  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2261  transport-associated  23.53 
 
 		 282 aa  59.3  0.00000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0186  hypothetical protein  27.13 
 
 		 217 aa  58.9  0.00000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.117611 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2185  transport-associated  27.8 
 
 		 255 aa  58.9  0.00000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4565  transport-associated  28.72 
 
 		 217 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.192769 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0431  transport-associated  25 
 
 		 215 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.390186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3808  transport-associated  22.48 
 
 		 216 aa  58.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4432  transport-associated  28.72 
 
 		 217 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0454  periplasmic protein  26.9 
 
 		 202 aa  58.5  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.390695  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2300  transport-associated  23.26 
 
 		 217 aa  58.2  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.53534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0390  transport-associated  25.88 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4919  periplasmic protein  27.04 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.618733  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0932  transport-associated  31.69 
 
 		 131 aa  57  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04251  periplasmic protein  27.04 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.368391  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3623  transport-associated  27.04 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1200  transport-associated  26.32 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.649848  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04217  hypothetical protein  27.04 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.310729  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3681  periplasmic protein  27.04 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.261916  hitchhiker  0.00179473 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4610  periplasmic protein  27.04 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0762495  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4973  periplasmic protein  27.04 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00297721  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7783  putative osmotically-inducible protein Y (precursor)  27.59 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.379132  normal  0.155349 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5888  periplasmic protein  27.04 
 
 		 201 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.223121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6692  transport-associated  21.9 
 
 		 543 aa  55.1  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3328  transport-associated  27.23 
 
 		 217 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.686073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0421  transport-associated protein  25.7 
 
 		 241 aa  54.7  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4923  periplasmic protein  25.79 
 
 		 201 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.497608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2613  transport-associated  23.26 
 
 		 214 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.574258  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3465  periplasmic protein  29.25 
 
 		 202 aa  54.7  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3604  hypothetical protein  23.83 
 
 		 215 aa  54.3  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.984998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0535  periplasmic protein  26.03 
 
 		 205 aa  54.7  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.388761  hitchhiker  0.00819185 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5932  transport-associated protein  29.38 
 
 		 216 aa  54.7  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0425  hypothetical protein  27.52 
 
 		 183 aa  53.5  0.000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0262  transport-associated protein  23.96 
 
 		 279 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3274  transport-associated protein  32.58 
 
 		 240 aa  53.5  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1415  transport-associated  31.78 
 
 		 184 aa  53.5  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1226  transport-associated protein  26.42 
 
 		 217 aa  53.1  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.528686  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0204  hypothetical protein  29.53 
 
 		 219 aa  52.8  0.000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0449  hypothetical protein  27.52 
 
 		 183 aa  52.8  0.000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0930  transport-associated  28.67 
 
 		 192 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13110  hypothetical protein  27.27 
 
 		 161 aa  52  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4526  transport-associated  28.67 
 
 		 192 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1322  transport-associated protein  28.67 
 
 		 192 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2966  periplasmic or secreted lipoprotein OsmY  23.44 
 
 		 219 aa  51.2  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000230813  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0177  transport-associated  22.52 
 
 		 276 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2456  transport-associated  23.29 
 
 		 215 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.262468  normal  0.570841 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1193  transport-associated protein  27.66 
 
 		 199 aa  50.8  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5544  transport-associated  29.25 
 
 		 216 aa  50.4  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.078197  normal  0.764141 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1317  transport-associated  31.25 
 
 		 181 aa  50.8  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3634  transport-associated  26.37 
 
 		 228 aa  50.4  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000681524 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5094  transport-associated  21.66 
 
 		 273 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0983587  normal  0.219919 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6897  transport-associated  26.82 
 
 		 217 aa  50.1  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.35821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4402  transport-associated  27.97 
 
 		 192 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.148625 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0189  hypothetical protein  22.9 
 
 		 215 aa  50.1  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.193269 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2203  transport-associated  25.17 
 
 		 188 aa  49.7  0.00006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.801164  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0194  transport-associated protein  30 
 
 		 173 aa  49.7  0.00007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2660  putative phospholipid-binding protein  27.66 
 
 		 237 aa  49.3  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1123  hypothetical protein  32.86 
 
 		 191 aa  49.3  0.00007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4422  lipoprotein, putative  26.57 
 
 		 192 aa  49.3  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.303803  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0986  transport-associated  33.03 
 
 		 240 aa  49.3  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1063  OsmY domain-containing protein  27.66 
 
 		 215 aa  49.3  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0140  putative phospholipid-binding protein  27.66 
 
 		 237 aa  49.3  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0116  OsmY domain-containing protein  27.66 
 
 		 215 aa  48.9  0.00009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.567152  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1195  transport-associated protein  29.57 
 
 		 192 aa  48.9  0.00009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1280  OsmY domain-containing protein  27.66 
 
 		 215 aa  48.9  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.84893  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2802  putative phospholipid-binding protein  27.66 
 
 		 215 aa  48.9  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4370  transport-associated protein  27.65 
 
 		 243 aa  48.9  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0414  OsmY domain-containing protein  32.41 
 
 		 215 aa  48.9  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3886  transport-associated  22.33 
 
 		 214 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.121  normal  0.085803 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0353  phospholipid binding protein  23.04 
 
 		 216 aa  48.9  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0425  transport-associated  21.86 
 
 		 214 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.379914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1108  transport-associated  23.7 
 
 		 216 aa  48.5  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1868  transport-associated  25.85 
 
 		 216 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.882392  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0333  hypothetical protein  23.58 
 
 		 279 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4116  transport-associated protein  27.27 
 
 		 192 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3707  transport-associated  30.08 
 
 		 181 aa  47.8  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.101636  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0536  hypothetical protein  32.14 
 
 		 191 aa  47.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.35439  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1405  transport-associated protein  31.82 
 
 		 184 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0472  hypothetical protein  32.14 
 
 		 191 aa  47.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1441  transport-associated  31.82 
 
 		 184 aa  47.8  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2881  transport-associated  25.15 
 
 		 216 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5912  transport-associated protein  27.89 
 
 		 216 aa  47.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.203256  normal  0.355197 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>