212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_62690 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_62690  hypothetical protein  100 
 
 		 114 aa  220  7e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5456  hypothetical protein  100 
 
 		 114 aa  220  7e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.469146  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3603  transport-associated  66.33 
 
 		 116 aa  127  6e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.335448  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43670  Transport-associated protein  59.82 
 
 		 120 aa  118  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.226738  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0726  transport-associated  55.79 
 
 		 117 aa  99.4  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.724439  normal  0.0177667 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4706  transport-associated  60 
 
 		 116 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.275207  normal  0.0404063 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4818  transport-associated protein  53.61 
 
 		 118 aa  95.1  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.958315  normal  0.118263 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4484  hypothetical protein  54.74 
 
 		 117 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04303  putative phospholipid-binding domain family  54.67 
 
 		 120 aa  85.5  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3436  transport-associated  45.45 
 
 		 127 aa  85.1  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.865751  normal  0.0604848 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0262  transport-associated protein  50 
 
 		 279 aa  84  6e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4707  transport-associated protein  50.53 
 
 		 116 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00217947 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4572  transport-associated  50.53 
 
 		 116 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.414411  normal  0.472278 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0333  hypothetical protein  47.96 
 
 		 279 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4175  transport-associated protein  48.42 
 
 		 117 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0177  transport-associated  45.33 
 
 		 276 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1784  transport-associated  52.24 
 
 		 275 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0010501  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1195  transport-associated protein  50 
 
 		 192 aa  73.9  0.0000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2553  hypothetical protein  52.24 
 
 		 278 aa  72  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1446  transport-associated  41.23 
 
 		 125 aa  69.3  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.609395  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4236  transport-associated protein  38.6 
 
 		 175 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1193  transport-associated protein  55.56 
 
 		 199 aa  65.1  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5244  transport-associated  40.19 
 
 		 116 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.797989  normal  0.73518 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3412  transport-associated  40.19 
 
 		 116 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0836  periplasmic protein  46.48 
 
 		 204 aa  62.4  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3503  periplasmic protein  46.48 
 
 		 204 aa  62  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2261  transport-associated  48.53 
 
 		 282 aa  62.4  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3632  periplasmic protein  46.48 
 
 		 204 aa  62  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5156  transport-associated protein  44.44 
 
 		 115 aa  62  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.609853 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0278  periplasmic or secreted lipoprotein  43.02 
 
 		 103 aa  60.8  0.000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.406104  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4815  periplasmic protein  45.07 
 
 		 205 aa  60.5  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4976  periplasmic protein  45.07 
 
 		 205 aa  60.5  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.163142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4969  periplasmic protein  45.07 
 
 		 205 aa  60.5  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0151  transport-associated  43.28 
 
 		 273 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4917  periplasmic protein  45.07 
 
 		 205 aa  60.5  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.292031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0535  periplasmic protein  41 
 
 		 205 aa  60.5  0.000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.388761  hitchhiker  0.00819185 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4882  periplasmic protein  45.07 
 
 		 205 aa  60.5  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0715597  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0134  transport-associated protein  43.28 
 
 		 273 aa  60.5  0.000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.892998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5083  transport-associated protein  40.48 
 
 		 151 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5094  transport-associated  41.79 
 
 		 273 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0983587  normal  0.219919 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0149  transport-associated  41.79 
 
 		 273 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.798997 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2682  transport-associated protein  38.32 
 
 		 116 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0477  transport-associated  40.21 
 
 		 103 aa  58.2  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01237  putative hyperosmotically inducible periplasmic protein  41.77 
 
 		 175 aa  57.8  0.00000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.315155  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04251  periplasmic protein  35.65 
 
 		 201 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.368391  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3623  transport-associated  35.65 
 
 		 201 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2673  transport-associated  46.77 
 
 		 104 aa  57.4  0.00000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000178392 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4610  periplasmic protein  35.65 
 
 		 201 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0762495  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04217  hypothetical protein  35.65 
 
 		 201 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.310729  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3681  periplasmic protein  35.65 
 
 		 201 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.261916  hitchhiker  0.00179473 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5888  periplasmic protein  35.65 
 
 		 201 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.223121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4923  periplasmic protein  35.65 
 
 		 201 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.497608  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0454  periplasmic protein  50.79 
 
 		 202 aa  57.4  0.00000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.390695  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2047  transport-associated protein  41.25 
 
 		 104 aa  57  0.00000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.186123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3297  transport-associated  46.15 
 
 		 201 aa  57  0.00000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.173268  normal  0.854509 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4919  periplasmic protein  37.5 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.618733  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3469  transport-associated  37.38 
 
 		 116 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0653  periplasmic protein  42.47 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4052  transport-associated  37.38 
 
 		 116 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3156  phospholipid-binding domain-containing protein  41.94 
 
 		 246 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3027  phospholipid-binding domain-containing protein  41.94 
 
 		 184 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.119447  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1376  osmotically inducible protein Y  41.94 
 
 		 174 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.177857  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4973  periplasmic protein  34.78 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00297721  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2319  phospholipid-binding domain-containing protein  36.54 
 
 		 104 aa  54.7  0.0000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1939  phospholipid-binding domain-containing protein  36.54 
 
 		 104 aa  54.7  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.315443  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2048  transport-associated  36.54 
 
 		 104 aa  54.7  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1642  putative periplasmic protein  38.24 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0830703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3995  transport-associated  46.88 
 
 		 182 aa  54.3  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000543546  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2185  transport-associated  43.06 
 
 		 255 aa  53.1  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0010  transport-associated  47.83 
 
 		 101 aa  53.1  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0950  transport-associated  45.07 
 
 		 171 aa  52.4  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.239728  normal  0.788848 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1094  transport-associated  45.07 
 
 		 171 aa  52.4  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5303  transport-associated  35.24 
 
 		 112 aa  52  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.320232  normal  0.0505821 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3022  transport-associated  28.68 
 
 		 158 aa  52.8  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.631889  normal  0.200341 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0449  hypothetical protein  33.33 
 
 		 183 aa  52  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4039  transport-associated protein  40 
 
 		 156 aa  52  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.130048  normal  0.0885216 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2170  transport-associated  37.21 
 
 		 104 aa  51.6  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.395466  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0552  periplasmic protein  47.62 
 
 		 202 aa  52  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.783524  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0073  transport-associated  46.03 
 
 		 196 aa  51.2  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3707  transport-associated  45.31 
 
 		 181 aa  51.6  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.101636  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4133  transport-associated  43.84 
 
 		 188 aa  51.6  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34760  Phospholipid-binding domain-containing protein  38.55 
 
 		 114 aa  51.2  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3849  transport-associated  41.18 
 
 		 115 aa  50.8  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000819027 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001941  putative hyperosmotically inducible periplasmic protein  45.16 
 
 		 183 aa  50.8  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0425  hypothetical protein  32.32 
 
 		 183 aa  50.8  0.000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3587  transport-associated  39.06 
 
 		 191 aa  50.4  0.000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1979  transport-associated protein  34.29 
 
 		 273 aa  50.1  0.000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000154767  normal  0.0601452 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1170  phospholipid binding protein  37.14 
 
 		 112 aa  50.4  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.191898 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0826  transport-associated  37.7 
 
 		 245 aa  50.4  0.000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0362569 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1788  transport-associated  37.97 
 
 		 103 aa  50.4  0.000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0663263  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1501  transport-associated protein  34.38 
 
 		 104 aa  48.9  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0875  transport-associated  44.62 
 
 		 104 aa  49.3  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.647487  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0110  putative lipoprotein  45.31 
 
 		 189 aa  48.9  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.319547  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0737  hypothetical protein  37.5 
 
 		 195 aa  48.9  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.131598  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0916  transport-associated  46.15 
 
 		 104 aa  49.3  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0063  transport-associated  38.67 
 
 		 110 aa  48.5  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.37402  normal  0.306207 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3587  hypothetical protein  40.74 
 
 		 191 aa  48.1  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.666559  normal  0.189864 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3465  periplasmic protein  34 
 
 		 202 aa  48.1  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0249  transport-associated  44.26 
 
 		 189 aa  48.1  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4004  transport-associated  41.94 
 
 		 104 aa  47.8  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.38345  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>