158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_0726 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_0726  transport-associated  100 
 
 		 117 aa  231  3e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.724439  normal  0.0177667 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4707  transport-associated protein  89.74 
 
 		 116 aa  175  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00217947 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4572  transport-associated  89.74 
 
 		 116 aa  175  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.414411  normal  0.472278 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4706  transport-associated  75.21 
 
 		 116 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.275207  normal  0.0404063 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4484  hypothetical protein  70.94 
 
 		 117 aa  130  7.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4818  transport-associated protein  68.07 
 
 		 118 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.958315  normal  0.118263 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4175  transport-associated protein  65.81 
 
 		 117 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62690  hypothetical protein  55.34 
 
 		 114 aa  103  5e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5456  hypothetical protein  55.34 
 
 		 114 aa  103  5e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.469146  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3603  transport-associated  48.28 
 
 		 116 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.335448  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43670  Transport-associated protein  48.76 
 
 		 120 aa  87.8  4e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.226738  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3436  transport-associated  47.17 
 
 		 127 aa  73.6  0.0000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.865751  normal  0.0604848 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04303  putative phospholipid-binding domain family  57.35 
 
 		 120 aa  73.6  0.0000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0262  transport-associated protein  53.52 
 
 		 279 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0333  hypothetical protein  52.11 
 
 		 279 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0278  periplasmic or secreted lipoprotein  54.1 
 
 		 103 aa  60.8  0.000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.406104  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0177  transport-associated  38.16 
 
 		 276 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3412  transport-associated  42.11 
 
 		 116 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5244  transport-associated  42.11 
 
 		 116 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.797989  normal  0.73518 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1784  transport-associated  46.27 
 
 		 275 aa  59.3  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0010501  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3632  periplasmic protein  52 
 
 		 204 aa  58.2  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0836  periplasmic protein  52 
 
 		 204 aa  58.2  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3503  periplasmic protein  52 
 
 		 204 aa  58.2  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2553  hypothetical protein  44.78 
 
 		 278 aa  57  0.00000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5156  transport-associated protein  43.37 
 
 		 115 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.609853 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1195  transport-associated protein  58.73 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0653  periplasmic protein  47.89 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4052  transport-associated  48.65 
 
 		 116 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3469  transport-associated  48.65 
 
 		 116 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2682  transport-associated protein  39.45 
 
 		 116 aa  53.5  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0950  transport-associated  50 
 
 		 171 aa  53.1  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.239728  normal  0.788848 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1094  transport-associated  50 
 
 		 171 aa  53.1  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3063  hypothetical protein  37.33 
 
 		 190 aa  52  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2920  hypothetical protein  37.33 
 
 		 190 aa  52  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0249  transport-associated  46.03 
 
 		 189 aa  51.6  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004504  putative hemolysin  46.97 
 
 		 221 aa  51.2  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000000407403  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1193  transport-associated protein  55.56 
 
 		 199 aa  51.6  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0454  periplasmic protein  39.09 
 
 		 202 aa  50.8  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.390695  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4973  periplasmic protein  41.67 
 
 		 201 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00297721  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3297  transport-associated  41.18 
 
 		 201 aa  50.4  0.000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.173268  normal  0.854509 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3695  transport-associated  46.03 
 
 		 188 aa  50.8  0.000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.904296  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4976  periplasmic protein  50 
 
 		 205 aa  50.4  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.163142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4815  periplasmic protein  50 
 
 		 205 aa  50.4  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4882  periplasmic protein  50 
 
 		 205 aa  50.4  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0715597  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4917  periplasmic protein  50 
 
 		 205 aa  50.4  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.292031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4969  periplasmic protein  50 
 
 		 205 aa  50.4  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04251  periplasmic protein  40.74 
 
 		 201 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.368391  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3623  transport-associated  40.74 
 
 		 201 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5888  periplasmic protein  40.74 
 
 		 201 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.223121  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04217  hypothetical protein  40.74 
 
 		 201 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.310729  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4919  periplasmic protein  40.74 
 
 		 201 aa  50.1  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.618733  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3681  periplasmic protein  40.74 
 
 		 201 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.261916  hitchhiker  0.00179473 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4610  periplasmic protein  40.74 
 
 		 201 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0762495  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4923  periplasmic protein  40.74 
 
 		 201 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.497608  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0134  transport-associated protein  39.71 
 
 		 273 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.892998  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0297  putative lipoprotein  46.03 
 
 		 188 aa  48.9  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3263  transport-associated protein  43.55 
 
 		 272 aa  48.9  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.369629  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5094  transport-associated  39.71 
 
 		 273 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0983587  normal  0.219919 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0151  transport-associated  39.71 
 
 		 273 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00888  hypothetical protein  45.45 
 
 		 219 aa  48.5  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0149  transport-associated  39.71 
 
 		 273 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.798997 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3357  putative lipoprotein  44.44 
 
 		 188 aa  48.1  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0110  putative lipoprotein  44.44 
 
 		 189 aa  48.1  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.319547  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4102  transport-associated  46.03 
 
 		 188 aa  47.8  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4072  transport-associated  46.03 
 
 		 188 aa  47.8  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3992  transport-associated  46.03 
 
 		 188 aa  47.8  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4190  transport-associated  46.03 
 
 		 188 aa  47.8  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0010  transport-associated  46.58 
 
 		 101 aa  47.4  0.00007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2048  transport-associated  35.87 
 
 		 104 aa  47.4  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2319  phospholipid-binding domain-containing protein  35.87 
 
 		 104 aa  47.4  0.00007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1939  phospholipid-binding domain-containing protein  35.87 
 
 		 104 aa  47.4  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.315443  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0270  transport-associated  44.44 
 
 		 191 aa  47  0.00009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000691335  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0535  periplasmic protein  46.88 
 
 		 205 aa  47  0.00009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.388761  hitchhiker  0.00819185 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4998  putative lipoprotein  35.38 
 
 		 192 aa  47  0.00009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.263747  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0552  periplasmic protein  39.09 
 
 		 202 aa  46.2  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.783524  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3687  transport-associated  44.44 
 
 		 188 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0258  transport-associated  44.44 
 
 		 188 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3883  transport-associated  44.44 
 
 		 188 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.180812 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2542  transport-associated protein  45.31 
 
 		 105 aa  45.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000702242 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1123  hypothetical protein  42.62 
 
 		 191 aa  45.8  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1671  transport-associated  45.31 
 
 		 105 aa  45.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0536  hypothetical protein  42.62 
 
 		 191 aa  46.2  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.35439  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1788  transport-associated  37.65 
 
 		 103 aa  45.8  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0663263  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0472  hypothetical protein  42.62 
 
 		 191 aa  46.2  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2047  transport-associated protein  42.19 
 
 		 104 aa  45.4  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.186123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4236  transport-associated protein  33.9 
 
 		 175 aa  45.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1446  transport-associated  35.8 
 
 		 125 aa  45.1  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.609395  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4004  transport-associated  46.88 
 
 		 104 aa  45.1  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.38345  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0737  hypothetical protein  31.18 
 
 		 195 aa  45.1  0.0003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.131598  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57510  putative secreted lipoprotein  33.85 
 
 		 192 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0224  transport-associated  44.44 
 
 		 189 aa  45.1  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.130883  normal  0.197651 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4339  hypothetical protein  41.94 
 
 		 191 aa  45.4  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.135394 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4039  transport-associated protein  35.96 
 
 		 156 aa  45.4  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.130048  normal  0.0885216 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2170  transport-associated  41.25 
 
 		 104 aa  44.7  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.395466  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5303  transport-associated  40.85 
 
 		 112 aa  44.7  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.320232  normal  0.0505821 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3428  transport-associated  39.68 
 
 		 284 aa  44.7  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.179471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0386  transport-associated  41.27 
 
 		 189 aa  44.3  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3022  transport-associated  41.27 
 
 		 158 aa  44.3  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.631889  normal  0.200341 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2261  transport-associated  38.71 
 
 		 282 aa  43.9  0.0007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4133  transport-associated  43.48 
 
 		 188 aa  43.9  0.0007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>