163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2047 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2047  transport-associated protein  100 
 
 		 104 aa  204  4e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.186123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2048  transport-associated  59.22 
 
 		 104 aa  116  7.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2319  phospholipid-binding domain-containing protein  59.22 
 
 		 104 aa  116  7.999999999999999e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1939  phospholipid-binding domain-containing protein  59.22 
 
 		 104 aa  116  7.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.315443  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2407  transport-associated protein  60 
 
 		 104 aa  110  5e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00333473  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1788  transport-associated  55.56 
 
 		 103 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0663263  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2170  transport-associated  50.96 
 
 		 104 aa  107  5e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.395466  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1671  transport-associated  51.49 
 
 		 105 aa  103  8e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1501  transport-associated protein  52.88 
 
 		 104 aa  103  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2542  transport-associated protein  49.5 
 
 		 105 aa  100  9e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000702242 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2673  transport-associated  61.25 
 
 		 104 aa  98.2  4e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000178392 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1119  transport-associated  53.85 
 
 		 104 aa  96.3  1e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.777172 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0477  transport-associated  53.33 
 
 		 103 aa  95.5  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2549  hypothetical protein  51.02 
 
 		 113 aa  95.1  3e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0063  transport-associated  44.33 
 
 		 110 aa  87.8  5e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.37402  normal  0.306207 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0278  periplasmic or secreted lipoprotein  39.42 
 
 		 103 aa  85.9  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.406104  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0950  transport-associated  56.94 
 
 		 171 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.239728  normal  0.788848 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1094  transport-associated  56.94 
 
 		 171 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1033  transport-associated  48.28 
 
 		 134 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.232129  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0916  transport-associated  44.12 
 
 		 104 aa  77.4  0.00000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1195  transport-associated protein  52 
 
 		 192 aa  75.1  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0875  transport-associated  44.58 
 
 		 104 aa  74.7  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.647487  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0535  periplasmic protein  40 
 
 		 205 aa  73.6  0.0000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.388761  hitchhiker  0.00819185 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1805  transport-associated protein  36.19 
 
 		 106 aa  73.6  0.0000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1170  phospholipid binding protein  52.7 
 
 		 112 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.191898 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3632  periplasmic protein  50.65 
 
 		 204 aa  72  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4815  periplasmic protein  50 
 
 		 205 aa  72.8  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0790  hypothetical protein  46.43 
 
 		 103 aa  72.8  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4917  periplasmic protein  50 
 
 		 205 aa  72.8  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.292031  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0761  hypothetical protein  46.43 
 
 		 103 aa  72.8  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4882  periplasmic protein  50 
 
 		 205 aa  72.8  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0715597  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1193  transport-associated protein  38.94 
 
 		 199 aa  72.4  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4004  transport-associated  43.02 
 
 		 104 aa  72.8  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.38345  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0836  periplasmic protein  50.65 
 
 		 204 aa  72  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4976  periplasmic protein  50 
 
 		 205 aa  72.8  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.163142  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0454  periplasmic protein  51.43 
 
 		 202 aa  72.8  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.390695  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4969  periplasmic protein  50 
 
 		 205 aa  72.8  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3503  periplasmic protein  50.65 
 
 		 204 aa  72  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5303  transport-associated  45 
 
 		 112 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.320232  normal  0.0505821 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2909  putative lipoprotein  39.42 
 
 		 104 aa  71.6  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.434819  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04251  periplasmic protein  48.61 
 
 		 201 aa  71.2  0.000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.368391  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3623  transport-associated  48.61 
 
 		 201 aa  71.2  0.000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4919  periplasmic protein  48.61 
 
 		 201 aa  71.6  0.000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.618733  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3681  periplasmic protein  48.61 
 
 		 201 aa  71.2  0.000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.261916  hitchhiker  0.00179473 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5888  periplasmic protein  48.61 
 
 		 201 aa  71.2  0.000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.223121  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04217  hypothetical protein  48.61 
 
 		 201 aa  71.2  0.000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.310729  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4923  periplasmic protein  48.61 
 
 		 201 aa  71.2  0.000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.497608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4610  periplasmic protein  48.61 
 
 		 201 aa  71.2  0.000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0762495  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0552  periplasmic protein  44.87 
 
 		 202 aa  71.2  0.000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.783524  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3585  periplasmic protein  47.14 
 
 		 218 aa  70.1  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5436  transport-associated  50 
 
 		 113 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.627744 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4973  periplasmic protein  47.22 
 
 		 201 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00297721  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0653  periplasmic protein  50 
 
 		 204 aa  68.9  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3465  periplasmic protein  36.45 
 
 		 202 aa  68.6  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0073  transport-associated  46.15 
 
 		 196 aa  68.2  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3514  transport-associated  36.27 
 
 		 104 aa  68.2  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2837  transport-associated  36.27 
 
 		 104 aa  68.6  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.47962  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5898  transport-associated  38.78 
 
 		 116 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2251  transport-associated  37.37 
 
 		 103 aa  66.6  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2343  transport-associated  43.02 
 
 		 104 aa  65.5  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.259537  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3867  transport-associated  39.33 
 
 		 104 aa  65.9  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3027  phospholipid-binding domain-containing protein  40.7 
 
 		 184 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.119447  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1376  osmotically inducible protein Y  40.7 
 
 		 174 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.177857  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1649  transport-associated protein  38.24 
 
 		 130 aa  64.3  0.0000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3156  phospholipid-binding domain-containing protein  41.98 
 
 		 246 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2052  transport-associated protein  46.15 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3436  transport-associated  44.3 
 
 		 127 aa  62.4  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.865751  normal  0.0604848 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43670  Transport-associated protein  47.89 
 
 		 120 aa  62  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.226738  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1642  putative periplasmic protein  39.47 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0830703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4039  transport-associated protein  39.51 
 
 		 156 aa  59.3  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.130048  normal  0.0885216 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0333  hypothetical protein  38.2 
 
 		 279 aa  57.8  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5453  transport-associated protein  41.1 
 
 		 134 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.627587  hitchhiker  0.00543554 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2076  transport-associated protein  37.25 
 
 		 107 aa  57.4  0.00000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.585071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62690  hypothetical protein  40.74 
 
 		 114 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5456  hypothetical protein  40.74 
 
 		 114 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.469146  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0262  transport-associated protein  37.08 
 
 		 279 aa  57  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2802  transport-associated  42.86 
 
 		 184 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0874  transport-associated  36.84 
 
 		 163 aa  55.1  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.586964 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3022  transport-associated  40 
 
 		 158 aa  55.1  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.631889  normal  0.200341 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5639  transport-associated  36.11 
 
 		 134 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.149696 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6387  transport-associated  36.11 
 
 		 134 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.508762 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0177  transport-associated  44 
 
 		 276 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04303  putative phospholipid-binding domain family  46.03 
 
 		 120 aa  54.7  0.0000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0010  transport-associated  46.15 
 
 		 101 aa  53.5  0.0000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1372  transport-associated  37.5 
 
 		 136 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.389649  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6457  transport-associated  37.5 
 
 		 136 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.591912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3412  transport-associated  39.81 
 
 		 116 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5244  transport-associated  39.81 
 
 		 116 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.797989  normal  0.73518 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3603  transport-associated  38.96 
 
 		 116 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.335448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5977  transport-associated  33.33 
 
 		 136 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.663122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3989  transport-associated  33.33 
 
 		 136 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.279726  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4378  transport-associated  33.33 
 
 		 136 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.294226  normal  0.933336 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0674  transport-associated  41.18 
 
 		 115 aa  52.8  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1784  transport-associated  38.57 
 
 		 275 aa  52.4  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0010501  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5156  transport-associated protein  40.85 
 
 		 115 aa  52  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.609853 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5083  transport-associated protein  38.57 
 
 		 151 aa  51.6  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2682  transport-associated protein  44.29 
 
 		 116 aa  51.2  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1446  transport-associated  38.95 
 
 		 125 aa  51.2  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.609395  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2203  transport-associated  33.01 
 
 		 188 aa  50.8  0.000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.801164  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6049  transport-associated  37.68 
 
 		 134 aa  50.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0480722 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>