148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0874 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_0874  transport-associated  100 
 
 		 163 aa  322  2e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.586964 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0915  transport-associated  56.55 
 
 		 165 aa  147  4e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.629645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4039  transport-associated protein  47.52 
 
 		 156 aa  114  3.9999999999999997e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.130048  normal  0.0885216 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1600  transport-associated  48.89 
 
 		 150 aa  99.8  1e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2274  transport-associated  48.89 
 
 		 150 aa  99.8  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.431584  normal  0.766565 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3022  transport-associated  44.37 
 
 		 158 aa  95.9  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.631889  normal  0.200341 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2175  osmotically inducible periplasmic protein  47.37 
 
 		 166 aa  96.3  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.17152  normal  0.224433 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4115  transport-associated  50 
 
 		 166 aa  75.9  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1642  putative periplasmic protein  44.74 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0830703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1033  transport-associated  33.79 
 
 		 134 aa  61.6  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.232129  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0477  transport-associated  41.67 
 
 		 103 aa  60.1  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0258  histidine kinase  48.57 
 
 		 222 aa  60.5  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.469068 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0278  periplasmic or secreted lipoprotein  41.1 
 
 		 103 aa  58.9  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.406104  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0950  transport-associated  39.19 
 
 		 171 aa  57  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.239728  normal  0.788848 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1094  transport-associated  39.19 
 
 		 171 aa  57  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2047  transport-associated protein  36.84 
 
 		 104 aa  55.1  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.186123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0093  transport-associated protein  35.71 
 
 		 119 aa  55.1  0.0000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.419766  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1372  transport-associated  44.44 
 
 		 136 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.389649  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6457  transport-associated  44.44 
 
 		 136 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.591912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1805  transport-associated protein  40.28 
 
 		 106 aa  55.1  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6387  transport-associated  41.67 
 
 		 134 aa  53.9  0.0000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.508762 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5639  transport-associated  41.67 
 
 		 134 aa  53.9  0.0000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.149696 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3514  transport-associated  40.28 
 
 		 104 aa  53.5  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0552  periplasmic protein  40.79 
 
 		 202 aa  53.9  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.783524  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2261  transport-associated  43.84 
 
 		 282 aa  53.5  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2837  transport-associated  40.28 
 
 		 104 aa  53.9  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.47962  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3867  transport-associated  38.89 
 
 		 104 aa  52.8  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0916  transport-associated  38.67 
 
 		 104 aa  53.1  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2407  transport-associated protein  37.33 
 
 		 104 aa  52.4  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00333473  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0333  hypothetical protein  40.28 
 
 		 279 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1195  transport-associated protein  35.14 
 
 		 192 aa  51.6  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2052  transport-associated protein  30.28 
 
 		 139 aa  51.2  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0454  periplasmic protein  40.79 
 
 		 202 aa  51.6  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.390695  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0262  transport-associated protein  35.85 
 
 		 279 aa  51.2  0.000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1671  transport-associated  38.67 
 
 		 105 aa  50.8  0.000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0063  transport-associated  36.99 
 
 		 110 aa  50.8  0.000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.37402  normal  0.306207 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0535  periplasmic protein  36.05 
 
 		 205 aa  50.4  0.000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.388761  hitchhiker  0.00819185 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3603  transport-associated  41.18 
 
 		 116 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.335448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0875  transport-associated  39.73 
 
 		 104 aa  50.4  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.647487  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43670  Transport-associated protein  38.24 
 
 		 120 aa  50.4  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.226738  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0674  transport-associated  38.24 
 
 		 115 aa  50.1  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0177  transport-associated  41.18 
 
 		 276 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2416  transport-associated  46.67 
 
 		 118 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2542  transport-associated protein  37.33 
 
 		 105 aa  50.1  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000702242 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3244  transport-associated  37.5 
 
 		 118 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.688311  normal  0.631575 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0425  hypothetical protein  40 
 
 		 183 aa  49.3  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1193  transport-associated protein  38.36 
 
 		 199 aa  49.3  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6049  transport-associated  42.86 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0480722 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2909  putative lipoprotein  40.28 
 
 		 104 aa  49.7  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.434819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5453  transport-associated protein  41.67 
 
 		 134 aa  49.7  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.627587  hitchhiker  0.00543554 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0449  hypothetical protein  40 
 
 		 183 aa  48.9  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2251  transport-associated  37.5 
 
 		 103 aa  48.9  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2203  transport-associated  34.67 
 
 		 188 aa  48.9  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.801164  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3156  phospholipid-binding domain-containing protein  39.73 
 
 		 246 aa  48.9  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3027  phospholipid-binding domain-containing protein  39.73 
 
 		 184 aa  48.9  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.119447  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3849  transport-associated  35.29 
 
 		 115 aa  49.3  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000819027 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4984  transport-associated  60 
 
 		 113 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0812534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1376  osmotically inducible protein Y  39.73 
 
 		 174 aa  48.5  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.177857  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3585  periplasmic protein  35.87 
 
 		 218 aa  48.5  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1501  transport-associated protein  38.89 
 
 		 104 aa  48.1  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1333  transport-associated  38.89 
 
 		 303 aa  48.1  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.286279 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3880  putative periplasmic protein  47.46 
 
 		 117 aa  48.1  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3503  periplasmic protein  36.78 
 
 		 204 aa  47.8  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3632  periplasmic protein  36.78 
 
 		 204 aa  47.8  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2185  transport-associated  38.32 
 
 		 255 aa  47.8  0.00007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2676  hypothetical protein  38.89 
 
 		 303 aa  47.8  0.00007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.462534  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0836  periplasmic protein  39.19 
 
 		 204 aa  47.8  0.00007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6692  transport-associated  31.33 
 
 		 543 aa  47.4  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2076  transport-associated protein  40.85 
 
 		 107 aa  47  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.585071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5436  transport-associated  35.62 
 
 		 113 aa  47  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.627744 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2553  hypothetical protein  29.86 
 
 		 278 aa  45.8  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0799  transport-associated  47.46 
 
 		 117 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.655099 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1170  phospholipid binding protein  35.62 
 
 		 112 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.191898 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2170  transport-associated  34.72 
 
 		 104 aa  46.2  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.395466  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1784  transport-associated  35.62 
 
 		 275 aa  45.8  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0010501  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04303  putative phospholipid-binding domain family  39.06 
 
 		 120 aa  45.8  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3297  transport-associated  38.89 
 
 		 201 aa  45.4  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.173268  normal  0.854509 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3465  periplasmic protein  38.37 
 
 		 202 aa  45.4  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2545  transport-associated protein  53.49 
 
 		 120 aa  45.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.899169 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4919  periplasmic protein  33.72 
 
 		 201 aa  45.1  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.618733  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0073  transport-associated  31.65 
 
 		 196 aa  45.1  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4004  transport-associated  33.33 
 
 		 104 aa  45.1  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.38345  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5888  periplasmic protein  33.72 
 
 		 201 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.223121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0653  periplasmic protein  37.31 
 
 		 204 aa  44.7  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4923  periplasmic protein  33.72 
 
 		 201 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.497608  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04251  periplasmic protein  33.72 
 
 		 201 aa  44.7  0.0006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.368391  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3623  transport-associated  33.72 
 
 		 201 aa  44.7  0.0006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1063  OsmY domain-containing protein  36.23 
 
 		 215 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04217  hypothetical protein  33.72 
 
 		 201 aa  44.7  0.0006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.310729  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4917  periplasmic protein  33.72 
 
 		 205 aa  44.7  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.292031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4815  periplasmic protein  33.72 
 
 		 205 aa  44.7  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1133  transport-associated  40 
 
 		 207 aa  44.7  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.125022  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4133  transport-associated  37.88 
 
 		 188 aa  44.7  0.0006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4882  periplasmic protein  33.72 
 
 		 205 aa  44.7  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0715597  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3482  transport-associated  40 
 
 		 165 aa  44.7  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0182  Peptidoglycan-binding LysM  45.28 
 
 		 187 aa  44.7  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4969  periplasmic protein  33.72 
 
 		 205 aa  44.7  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4610  periplasmic protein  33.72 
 
 		 201 aa  44.7  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0762495  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3681  periplasmic protein  33.72 
 
 		 201 aa  44.7  0.0006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.261916  hitchhiker  0.00179473 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4976  periplasmic protein  33.72 
 
 		 205 aa  44.7  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.163142  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>