77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_3989 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008061  Bcen_3989  transport-associated  100 
 
 		 136 aa  267  4e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.279726  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4378  transport-associated  100 
 
 		 136 aa  267  4e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.294226  normal  0.933336 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5977  transport-associated  97.79 
 
 		 136 aa  261  3e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.663122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4244  transport-associated protein  70.59 
 
 		 136 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1372  transport-associated  51.35 
 
 		 136 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.389649  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6457  transport-associated  51.35 
 
 		 136 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.591912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6387  transport-associated  48.65 
 
 		 134 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.508762 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5639  transport-associated  48.65 
 
 		 134 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.149696 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5453  transport-associated protein  51.35 
 
 		 134 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.627587  hitchhiker  0.00543554 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1376  osmotically inducible protein Y  44.44 
 
 		 174 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.177857  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3027  phospholipid-binding domain-containing protein  44.44 
 
 		 184 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.119447  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3156  phospholipid-binding domain-containing protein  44.44 
 
 		 246 aa  72  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6049  transport-associated  48.61 
 
 		 134 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0480722 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0535  periplasmic protein  34.51 
 
 		 205 aa  61.2  0.000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.388761  hitchhiker  0.00819185 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4969  periplasmic protein  32.74 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4917  periplasmic protein  32.74 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.292031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4815  periplasmic protein  32.74 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4882  periplasmic protein  32.74 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0715597  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4976  periplasmic protein  32.74 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.163142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4919  periplasmic protein  33.33 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.618733  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4973  periplasmic protein  33.33 
 
 		 201 aa  57.8  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00297721  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3681  periplasmic protein  33.33 
 
 		 201 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.261916  hitchhiker  0.00179473 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04251  periplasmic protein  33.33 
 
 		 201 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.368391  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4610  periplasmic protein  33.33 
 
 		 201 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0762495  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4923  periplasmic protein  33.33 
 
 		 201 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.497608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5888  periplasmic protein  33.33 
 
 		 201 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.223121  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04217  hypothetical protein  33.33 
 
 		 201 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.310729  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3623  transport-associated  33.33 
 
 		 201 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0836  periplasmic protein  30.65 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3632  periplasmic protein  32.61 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3503  periplasmic protein  32.61 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5303  transport-associated  34.34 
 
 		 112 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.320232  normal  0.0505821 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3585  periplasmic protein  37.68 
 
 		 218 aa  53.5  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0454  periplasmic protein  33.33 
 
 		 202 aa  52.8  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.390695  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2047  transport-associated protein  33.33 
 
 		 104 aa  52.8  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.186123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0552  periplasmic protein  30.95 
 
 		 202 aa  52  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.783524  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0653  periplasmic protein  34.57 
 
 		 204 aa  49.3  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1788  transport-associated  25.23 
 
 		 103 aa  48.5  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0663263  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5436  transport-associated  36.11 
 
 		 113 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.627744 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1170  phospholipid binding protein  34.72 
 
 		 112 aa  48.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.191898 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0073  transport-associated  34.57 
 
 		 196 aa  47.8  0.00006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1624  putative phospholipid-binding protein  34.69 
 
 		 119 aa  47  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0267001  normal  0.292905 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0383  phospholipid binding protein  38.1 
 
 		 115 aa  47  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0278  periplasmic or secreted lipoprotein  24.77 
 
 		 103 aa  46.6  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.406104  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4971  transport-associated  37.31 
 
 		 115 aa  44.7  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.314311  normal  0.115696 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3849  transport-associated  28.44 
 
 		 115 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000819027 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5083  transport-associated protein  27.47 
 
 		 151 aa  44.7  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2319  phospholipid-binding domain-containing protein  30.56 
 
 		 104 aa  44.7  0.0005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2048  transport-associated  30.56 
 
 		 104 aa  44.7  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1939  phospholipid-binding domain-containing protein  30.56 
 
 		 104 aa  44.7  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.315443  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2416  transport-associated  32.29 
 
 		 118 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3465  periplasmic protein  35.53 
 
 		 202 aa  43.9  0.0007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4236  transport-associated protein  40.3 
 
 		 175 aa  43.9  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1679  transport-associated protein  37.5 
 
 		 118 aa  43.5  0.0009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.3238  normal  0.893681 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0589  phospholipid-binding domain-containing protein  24.77 
 
 		 183 aa  43.1  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0950  transport-associated  28.41 
 
 		 171 aa  43.1  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.239728  normal  0.788848 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1094  transport-associated  28.41 
 
 		 171 aa  43.1  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62690  hypothetical protein  32.26 
 
 		 114 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4004  transport-associated  31.51 
 
 		 104 aa  42.7  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.38345  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3244  transport-associated  35.82 
 
 		 118 aa  42.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.688311  normal  0.631575 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3880  putative periplasmic protein  36.23 
 
 		 117 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5456  hypothetical protein  32.26 
 
 		 114 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.469146  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4039  transport-associated protein  30.67 
 
 		 156 aa  42.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.130048  normal  0.0885216 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2261  transport-associated  36 
 
 		 282 aa  42  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1195  transport-associated protein  33.77 
 
 		 192 aa  42  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1193  transport-associated protein  31.17 
 
 		 199 aa  41.6  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0258  histidine kinase  34.78 
 
 		 222 aa  41.2  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.469068 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0997  lipoprotein  54.05 
 
 		 38 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1285  transport-associated domain-containing protein  54.05 
 
 		 38 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2549  hypothetical protein  24.78 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0799  transport-associated  34.78 
 
 		 117 aa  40.4  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.655099 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01237  putative hyperosmotically inducible periplasmic protein  28.99 
 
 		 175 aa  40.4  0.007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.315155  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1844  transport-associated  36.36 
 
 		 235 aa  40.4  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5211  transport-associated  39.68 
 
 		 123 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0618952  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4707  transport-associated protein  32.79 
 
 		 116 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00217947 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4572  transport-associated  32.79 
 
 		 116 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.414411  normal  0.472278 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5648  transport-associated  39.68 
 
 		 123 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0978596  normal  0.176508 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>