170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5436 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5436  transport-associated  100 
 
 		 113 aa  222  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.627744 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1170  phospholipid binding protein  88.5 
 
 		 112 aa  181  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.191898 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5303  transport-associated  72.57 
 
 		 112 aa  166  8e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.320232  normal  0.0505821 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2048  transport-associated  44.44 
 
 		 104 aa  77.4  0.00000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2319  phospholipid-binding domain-containing protein  44.44 
 
 		 104 aa  77.4  0.00000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1939  phospholipid-binding domain-containing protein  44.44 
 
 		 104 aa  77.4  0.00000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.315443  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2047  transport-associated protein  45.74 
 
 		 104 aa  73.6  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.186123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2673  transport-associated  48.1 
 
 		 104 aa  67.8  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000178392 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2407  transport-associated protein  47.44 
 
 		 104 aa  67.4  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00333473  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5083  transport-associated protein  46.58 
 
 		 151 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5453  transport-associated protein  49.3 
 
 		 134 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.627587  hitchhiker  0.00543554 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4039  transport-associated protein  43.18 
 
 		 156 aa  64.3  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.130048  normal  0.0885216 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2542  transport-associated protein  46.38 
 
 		 105 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000702242 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6387  transport-associated  45.07 
 
 		 134 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.508762 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5639  transport-associated  45.07 
 
 		 134 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.149696 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1671  transport-associated  46.38 
 
 		 105 aa  63.5  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0950  transport-associated  47.22 
 
 		 171 aa  63.2  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.239728  normal  0.788848 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1094  transport-associated  47.22 
 
 		 171 aa  63.2  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1372  transport-associated  44.59 
 
 		 136 aa  62  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.389649  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6457  transport-associated  44.59 
 
 		 136 aa  62  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.591912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1788  transport-associated  38.18 
 
 		 103 aa  62  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0663263  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1376  osmotically inducible protein Y  41.57 
 
 		 174 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.177857  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3027  phospholipid-binding domain-containing protein  41.57 
 
 		 184 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.119447  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3156  phospholipid-binding domain-containing protein  41.57 
 
 		 246 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4917  periplasmic protein  41 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.292031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4815  periplasmic protein  41 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4882  periplasmic protein  41 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0715597  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4976  periplasmic protein  41 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.163142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4969  periplasmic protein  41 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0535  periplasmic protein  41.82 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.388761  hitchhiker  0.00819185 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2170  transport-associated  41.03 
 
 		 104 aa  58.5  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.395466  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0063  transport-associated  34.09 
 
 		 110 aa  58.2  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.37402  normal  0.306207 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1195  transport-associated protein  40.37 
 
 		 192 aa  58.2  0.00000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1805  transport-associated protein  38.95 
 
 		 106 aa  58.2  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4004  transport-associated  37.8 
 
 		 104 aa  57.8  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.38345  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2549  hypothetical protein  35.4 
 
 		 113 aa  56.6  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1501  transport-associated protein  41.67 
 
 		 104 aa  56.6  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6049  transport-associated  45.59 
 
 		 134 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0480722 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1193  transport-associated protein  43.37 
 
 		 199 aa  55.8  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0278  periplasmic or secreted lipoprotein  30.61 
 
 		 103 aa  53.9  0.0000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.406104  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0552  periplasmic protein  40 
 
 		 202 aa  53.5  0.0000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.783524  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0477  transport-associated  39.73 
 
 		 103 aa  53.5  0.0000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2343  transport-associated  38.82 
 
 		 104 aa  53.5  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.259537  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0454  periplasmic protein  40 
 
 		 202 aa  53.1  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.390695  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0674  transport-associated  36.84 
 
 		 115 aa  53.5  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4052  transport-associated  47.31 
 
 		 116 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4244  transport-associated protein  34 
 
 		 136 aa  52.4  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3244  transport-associated  34.48 
 
 		 118 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.688311  normal  0.631575 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1624  putative phospholipid-binding protein  35.25 
 
 		 119 aa  52.8  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0267001  normal  0.292905 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1119  transport-associated  37.37 
 
 		 104 aa  52.4  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.777172 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3469  transport-associated  47.31 
 
 		 116 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2909  putative lipoprotein  40.85 
 
 		 104 aa  52.8  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.434819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5031  transport-associated  31.62 
 
 		 119 aa  51.6  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.677375 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0875  transport-associated  38.89 
 
 		 104 aa  51.6  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.647487  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0916  transport-associated  35.05 
 
 		 104 aa  51.6  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4919  periplasmic protein  39.18 
 
 		 201 aa  51.2  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.618733  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0073  transport-associated  43.82 
 
 		 196 aa  50.8  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4973  periplasmic protein  39.18 
 
 		 201 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00297721  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04251  periplasmic protein  39.18 
 
 		 201 aa  50.4  0.000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.368391  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3623  transport-associated  39.18 
 
 		 201 aa  50.4  0.000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5888  periplasmic protein  39.18 
 
 		 201 aa  50.4  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.223121  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04217  hypothetical protein  39.18 
 
 		 201 aa  50.4  0.000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.310729  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4923  periplasmic protein  39.18 
 
 		 201 aa  50.4  0.000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.497608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4610  periplasmic protein  39.18 
 
 		 201 aa  50.4  0.000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0762495  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3681  periplasmic protein  39.18 
 
 		 201 aa  50.4  0.000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.261916  hitchhiker  0.00179473 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1446  transport-associated  43.24 
 
 		 125 aa  50.4  0.000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.609395  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62690  hypothetical protein  36.45 
 
 		 114 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5456  hypothetical protein  36.45 
 
 		 114 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.469146  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0915  transport-associated  34.29 
 
 		 165 aa  49.7  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.629645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1642  putative periplasmic protein  40.85 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0830703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2251  transport-associated  38.03 
 
 		 103 aa  49.3  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3989  transport-associated  36.11 
 
 		 136 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.279726  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4378  transport-associated  36.11 
 
 		 136 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.294226  normal  0.933336 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04303  putative phospholipid-binding domain family  46.48 
 
 		 120 aa  48.9  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0790  hypothetical protein  40 
 
 		 103 aa  48.5  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3585  periplasmic protein  33.93 
 
 		 218 aa  48.5  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3436  transport-associated  46.88 
 
 		 127 aa  48.5  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.865751  normal  0.0604848 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0761  hypothetical protein  40 
 
 		 103 aa  48.1  0.00004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2052  transport-associated protein  46.05 
 
 		 139 aa  48.1  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1033  transport-associated  42.11 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.232129  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5977  transport-associated  36.11 
 
 		 136 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.663122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0836  periplasmic protein  40 
 
 		 204 aa  48.1  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3632  periplasmic protein  40 
 
 		 204 aa  48.1  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3503  periplasmic protein  40 
 
 		 204 aa  48.1  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0258  histidine kinase  39.73 
 
 		 222 aa  47.8  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.469068 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5156  transport-associated protein  43.9 
 
 		 115 aa  47.8  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.609853 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0874  transport-associated  35.62 
 
 		 163 aa  47  0.00009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.586964 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2203  transport-associated  35.06 
 
 		 188 aa  47  0.00009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.801164  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1123  hypothetical protein  37.33 
 
 		 191 aa  47  0.00009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1322  transport-associated protein  37.66 
 
 		 192 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3880  putative periplasmic protein  32.48 
 
 		 117 aa  46.6  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3297  transport-associated  35.71 
 
 		 201 aa  46.6  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.173268  normal  0.854509 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1784  transport-associated  34.78 
 
 		 275 aa  46.6  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0010501  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0930  transport-associated  36.36 
 
 		 192 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4484  hypothetical protein  42.05 
 
 		 117 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2076  transport-associated protein  48.65 
 
 		 107 aa  45.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.585071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0353  periplasmic or secreted lipoprotein  36.62 
 
 		 200 aa  45.8  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3026  transport-associated protein  31.62 
 
 		 124 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.311021  normal  0.461623 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2416  transport-associated  31.62 
 
 		 118 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4998  putative lipoprotein  35.44 
 
 		 192 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.263747  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>