103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3880 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3880  putative periplasmic protein  100 
 
 
117 aa  223  6e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0799  transport-associated  94.02 
 
 
117 aa  168  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.655099 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2416  transport-associated  72.88 
 
 
118 aa  148  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5031  transport-associated  61.54 
 
 
119 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.677375 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1624  putative phospholipid-binding protein  58.12 
 
 
119 aa  122  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0267001  normal  0.292905 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2545  transport-associated protein  56.1 
 
 
120 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.899169 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3244  transport-associated  53.45 
 
 
118 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.688311  normal  0.631575 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4971  transport-associated  52.63 
 
 
115 aa  102  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.314311  normal  0.115696 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4015  transport-associated  50 
 
 
118 aa  99.4  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1679  transport-associated protein  56.14 
 
 
118 aa  99  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.3238  normal  0.893681 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0356  transport-associated  54.03 
 
 
121 aa  95.1  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.29049  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0718  transport-associated  55.65 
 
 
121 aa  95.9  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.523753  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0839  transport-associated  54.03 
 
 
121 aa  95.1  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0811  transport-associated  54.03 
 
 
121 aa  95.1  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.293116  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0735  transport-associated  55.65 
 
 
121 aa  95.9  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.106493 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3201  phospholipid-binding domain-containing protein  60 
 
 
221 aa  89.4  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.883979  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3931  transport-associated protein  51.61 
 
 
121 aa  87.4  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0118237 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2029  transport-associated domain-containing protein  58.67 
 
 
221 aa  87.4  6e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.168793  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2719  transport-associated domain-containing protein  58.67 
 
 
221 aa  87.4  6e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3148  putative phospholipid-binding protein  58.67 
 
 
294 aa  87.4  6e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1419  transport-associated domain-containing protein  60 
 
 
222 aa  87  7e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0885  transport-associated domain-containing protein  58.67 
 
 
122 aa  87  7e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3185  transport-associated domain-containing protein  58.67 
 
 
122 aa  87  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0627443  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1891  putative phospholipid-binding protein  58.67 
 
 
122 aa  87  7e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.944608  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5640  transport-associated  46.61 
 
 
117 aa  85.9  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.527618 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5879  transport-associated  47.37 
 
 
115 aa  85.1  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2719  putative phospholipid-binding protein  46.67 
 
 
116 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4984  transport-associated  42.24 
 
 
113 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0812534  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0383  phospholipid binding protein  38.18 
 
 
115 aa  67  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5938  transport-associated  41.94 
 
 
124 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.483865  normal  0.018454 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2480  transport-associated protein  47.83 
 
 
129 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.567161  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3885  transport-associated  47.83 
 
 
135 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.225437 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6356  transport-associated  40 
 
 
125 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.802203  normal  0.334542 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2456  transport-associated protein  42.31 
 
 
84 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.148047  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5211  transport-associated  41.76 
 
 
123 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0618952  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5648  transport-associated  41.76 
 
 
123 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0978596  normal  0.176508 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3026  transport-associated protein  40 
 
 
124 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.311021  normal  0.461623 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5303  transport-associated  35.34 
 
 
112 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.320232  normal  0.0505821 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1170  phospholipid binding protein  35.29 
 
 
112 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.191898 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3177  transport-associated  43.02 
 
 
123 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.944582  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5191  transport-associated  43.02 
 
 
123 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00696153 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5086  transport-associated  43.02 
 
 
123 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1716  periplasmic phospholipid binding protein  33.03 
 
 
121 aa  53.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.547226  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6692  transport-associated  37 
 
 
543 aa  51.2  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4917  periplasmic protein  46.97 
 
 
205 aa  51.2  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.292031  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4969  periplasmic protein  46.97 
 
 
205 aa  51.2  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4815  periplasmic protein  46.97 
 
 
205 aa  51.2  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4882  periplasmic protein  46.97 
 
 
205 aa  51.2  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0715597  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4976  periplasmic protein  46.97 
 
 
205 aa  51.2  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.163142  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4919  periplasmic protein  45.45 
 
 
201 aa  50.8  0.000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.618733  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4923  periplasmic protein  45.45 
 
 
201 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.497608  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0535  periplasmic protein  45.45 
 
 
205 aa  50.4  0.000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.388761  hitchhiker  0.00819185 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04251  periplasmic protein  45.45 
 
 
201 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.368391  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3623  transport-associated  45.45 
 
 
201 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4610  periplasmic protein  45.45 
 
 
201 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0762495  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4973  periplasmic protein  45.45 
 
 
201 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00297721  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0836  periplasmic protein  32.54 
 
 
204 aa  49.7  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3681  periplasmic protein  45.45 
 
 
201 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.261916  hitchhiker  0.00179473 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5888  periplasmic protein  45.45 
 
 
201 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.223121  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04217  hypothetical protein  45.45 
 
 
201 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.310729  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3503  periplasmic protein  35.78 
 
 
204 aa  48.9  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3632  periplasmic protein  35.78 
 
 
204 aa  48.9  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3270  transport-associated  35.71 
 
 
139 aa  48.9  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.21303  normal  0.821762 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0915  transport-associated  39.08 
 
 
165 aa  48.5  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.629645  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0874  transport-associated  47.46 
 
 
163 aa  47.8  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.586964 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5436  transport-associated  32.46 
 
 
113 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.627744 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4238  transport-associated protein  32 
 
 
244 aa  47.4  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.248738  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0141  transport-associated  33.33 
 
 
309 aa  47  0.00008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0073  transport-associated  45 
 
 
196 aa  46.6  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0653  periplasmic protein  46.03 
 
 
204 aa  46.6  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4039  transport-associated protein  43.33 
 
 
156 aa  46.2  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.130048  normal  0.0885216 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1193  transport-associated protein  42.86 
 
 
199 aa  45.8  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7765  Smc22-1 ( osmotically inducible sensory protein)  36.92 
 
 
217 aa  46.2  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.705157  normal  0.17558 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5453  transport-associated protein  34.04 
 
 
134 aa  46.2  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.627587  hitchhiker  0.00543554 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5083  transport-associated protein  33.72 
 
 
151 aa  45.4  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3429  transport-associated protein  41.56 
 
 
412 aa  45.1  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.389194  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4236  transport-associated protein  31.78 
 
 
175 aa  45.1  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1372  transport-associated  43.33 
 
 
136 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.389649  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6457  transport-associated  43.33 
 
 
136 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.591912  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5977  transport-associated  34.31 
 
 
136 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.663122  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3989  transport-associated  34.31 
 
 
136 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.279726  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4378  transport-associated  34.31 
 
 
136 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.294226  normal  0.933336 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3027  phospholipid-binding domain-containing protein  43.33 
 
 
184 aa  44.3  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.119447  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1376  osmotically inducible protein Y  43.33 
 
 
174 aa  43.9  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.177857  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3156  phospholipid-binding domain-containing protein  43.33 
 
 
246 aa  43.9  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0950  transport-associated  40 
 
 
171 aa  43.5  0.0009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.239728  normal  0.788848 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1094  transport-associated  40 
 
 
171 aa  43.5  0.0009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1195  transport-associated protein  41.79 
 
 
192 aa  43.5  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0293  MscS mechanosensitive ion channel  32.53 
 
 
447 aa  43.5  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5639  transport-associated  32.98 
 
 
134 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.149696 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2274  transport-associated  43.33 
 
 
150 aa  43.5  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.431584  normal  0.766565 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6387  transport-associated  32.98 
 
 
134 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.508762 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1600  transport-associated  43.33 
 
 
150 aa  43.5  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2077  transport-associated  33.33 
 
 
307 aa  41.6  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.735501  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3042  hypothetical protein  44.26 
 
 
142 aa  41.6  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.224721  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5023  hypothetical protein  40 
 
 
125 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.226696  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5837  hypothetical protein  40 
 
 
125 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4342  hypothetical protein  40 
 
 
131 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3585  periplasmic protein  37.88 
 
 
218 aa  41.2  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3423  transport-associated  40.91 
 
 
119 aa  40.8  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>