115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2251 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2251  transport-associated  100 
 
 		 103 aa  203  7e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0477  transport-associated  66.67 
 
 		 103 aa  121  4e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0916  transport-associated  59.22 
 
 		 104 aa  116  7.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4004  transport-associated  64.29 
 
 		 104 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.38345  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0875  transport-associated  63.53 
 
 		 104 aa  112  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.647487  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1805  transport-associated protein  60.44 
 
 		 106 aa  111  4.0000000000000004e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3867  transport-associated  58.43 
 
 		 104 aa  108  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3514  transport-associated  55.1 
 
 		 104 aa  108  3e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2837  transport-associated  56.12 
 
 		 104 aa  108  3e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.47962  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2343  transport-associated  61.9 
 
 		 104 aa  107  5e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.259537  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2909  putative lipoprotein  56.7 
 
 		 104 aa  105  3e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.434819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2407  transport-associated protein  48.19 
 
 		 104 aa  81.3  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00333473  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0063  transport-associated  44.33 
 
 		 110 aa  75.5  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.37402  normal  0.306207 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0278  periplasmic or secreted lipoprotein  44.71 
 
 		 103 aa  73.6  0.0000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.406104  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2542  transport-associated protein  44.58 
 
 		 105 aa  72  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000702242 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1671  transport-associated  44.58 
 
 		 105 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1501  transport-associated protein  40.2 
 
 		 104 aa  70.9  0.000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2170  transport-associated  46.39 
 
 		 104 aa  70.9  0.000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.395466  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2047  transport-associated protein  37.37 
 
 		 104 aa  66.6  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.186123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3503  periplasmic protein  41.98 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0836  periplasmic protein  41.98 
 
 		 204 aa  65.9  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3632  periplasmic protein  41.98 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0653  periplasmic protein  42.25 
 
 		 204 aa  63.9  0.0000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1119  transport-associated  39.39 
 
 		 104 aa  62.8  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.777172 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1033  transport-associated  38.1 
 
 		 134 aa  62  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.232129  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1193  transport-associated protein  31.25 
 
 		 199 aa  60.5  0.000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0552  periplasmic protein  39.19 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.783524  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0454  periplasmic protein  39.19 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.390695  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4917  periplasmic protein  40 
 
 		 205 aa  57.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.292031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4969  periplasmic protein  40 
 
 		 205 aa  57.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4815  periplasmic protein  40 
 
 		 205 aa  57.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4882  periplasmic protein  40 
 
 		 205 aa  57.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0715597  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4976  periplasmic protein  40 
 
 		 205 aa  57.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.163142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0535  periplasmic protein  40 
 
 		 205 aa  57.8  0.00000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.388761  hitchhiker  0.00819185 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5303  transport-associated  41.1 
 
 		 112 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.320232  normal  0.0505821 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4923  periplasmic protein  38.36 
 
 		 201 aa  57  0.00000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.497608  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0761  hypothetical protein  36.59 
 
 		 103 aa  57  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1788  transport-associated  34 
 
 		 103 aa  56.6  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0663263  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1939  phospholipid-binding domain-containing protein  33 
 
 		 104 aa  56.2  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.315443  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2319  phospholipid-binding domain-containing protein  33 
 
 		 104 aa  56.2  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2048  transport-associated  33 
 
 		 104 aa  56.2  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0790  hypothetical protein  36.59 
 
 		 103 aa  55.8  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2185  transport-associated  43.21 
 
 		 255 aa  55.8  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5888  periplasmic protein  36.99 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.223121  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04251  periplasmic protein  36.99 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.368391  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3623  transport-associated  36.99 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0010  transport-associated  50.75 
 
 		 101 aa  55.1  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4610  periplasmic protein  36.99 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0762495  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4973  periplasmic protein  36.99 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00297721  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3681  periplasmic protein  36.99 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.261916  hitchhiker  0.00179473 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04217  hypothetical protein  36.99 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.310729  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4919  periplasmic protein  36.99 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.618733  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0950  transport-associated  39.73 
 
 		 171 aa  53.9  0.0000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.239728  normal  0.788848 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1094  transport-associated  39.73 
 
 		 171 aa  53.9  0.0000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1195  transport-associated protein  37.33 
 
 		 192 aa  53.5  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2549  hypothetical protein  36.78 
 
 		 113 aa  52.8  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3022  transport-associated  43.06 
 
 		 158 aa  52.8  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.631889  normal  0.200341 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1796  transport-associated  40.26 
 
 		 108 aa  52  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1170  phospholipid binding protein  38.03 
 
 		 112 aa  52  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.191898 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2673  transport-associated  37.31 
 
 		 104 aa  51.6  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000178392 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0073  transport-associated  38.89 
 
 		 196 aa  50.4  0.000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3156  phospholipid-binding domain-containing protein  39.47 
 
 		 246 aa  50.4  0.000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1376  osmotically inducible protein Y  39.47 
 
 		 174 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.177857  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3585  periplasmic protein  35.06 
 
 		 218 aa  49.7  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3027  phospholipid-binding domain-containing protein  39.47 
 
 		 184 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.119447  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5898  transport-associated  29.13 
 
 		 116 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5436  transport-associated  38.03 
 
 		 113 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.627744 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2052  transport-associated protein  32.22 
 
 		 139 aa  48.9  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3465  periplasmic protein  31.65 
 
 		 202 aa  49.3  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1642  putative periplasmic protein  34.72 
 
 		 144 aa  48.9  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0830703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0874  transport-associated  37.5 
 
 		 163 aa  48.9  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.586964 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5639  transport-associated  30.85 
 
 		 134 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.149696 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6049  transport-associated  37.14 
 
 		 134 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0480722 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6387  transport-associated  30.85 
 
 		 134 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.508762 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2076  transport-associated protein  38 
 
 		 107 aa  47.4  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.585071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2802  transport-associated  39.02 
 
 		 184 aa  47.8  0.00006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0335  putative osmotically inducible protein  43.33 
 
 		 202 aa  47  0.00008  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.161455  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1372  transport-associated  35.62 
 
 		 136 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.389649  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6457  transport-associated  35.62 
 
 		 136 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.591912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4039  transport-associated protein  38.16 
 
 		 156 aa  47  0.00008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.130048  normal  0.0885216 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0093  transport-associated protein  36.23 
 
 		 119 aa  47  0.00009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.419766  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43670  Transport-associated protein  38.03 
 
 		 120 aa  46.6  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.226738  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3442  transport-associated  33.7 
 
 		 219 aa  46.6  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.933167  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3148  putative lipoprotein  33.91 
 
 		 192 aa  45.8  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2261  transport-associated  36.11 
 
 		 282 aa  45.8  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3603  transport-associated  38.57 
 
 		 116 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.335448  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0333  hypothetical protein  37.97 
 
 		 279 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0258  histidine kinase  33.77 
 
 		 222 aa  45.1  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.469068 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2285  transport-associated  36.71 
 
 		 194 aa  43.5  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.590876 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3903  transport-associated  35.29 
 
 		 231 aa  43.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0263909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01237  putative hyperosmotically inducible periplasmic protein  36.36 
 
 		 175 aa  43.1  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.315155  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0449  hypothetical protein  33.71 
 
 		 183 aa  42.4  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0425  hypothetical protein  33.71 
 
 		 183 aa  42.4  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0262  transport-associated protein  39.68 
 
 		 279 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0915  transport-associated  34.78 
 
 		 165 aa  42.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.629645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1214  transport-associated  35.82 
 
 		 315 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0393886  normal  0.108337 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4115  transport-associated  43.48 
 
 		 166 aa  42.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2077  transport-associated  32.86 
 
 		 307 aa  42.4  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.735501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3436  transport-associated  38.81 
 
 		 127 aa  42.4  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.865751  normal  0.0604848 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2274  transport-associated  39.68 
 
 		 150 aa  42  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.431584  normal  0.766565 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>