191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2802 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_2802  transport-associated  100 
 
 
184 aa  364  1e-100  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2204  transport-associated  74.19 
 
 
176 aa  223  1e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1844  transport-associated  46.63 
 
 
235 aa  133  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2000  transport-associated protein  38.86 
 
 
185 aa  111  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0471437  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1193  transport-associated protein  38.36 
 
 
199 aa  87  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1195  transport-associated protein  39.04 
 
 
192 aa  83.2  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0073  transport-associated  34.23 
 
 
196 aa  72.8  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3587  transport-associated  34 
 
 
191 aa  72.4  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3695  transport-associated  32.78 
 
 
188 aa  71.6  0.000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.904296  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3696  transport-associated  31.28 
 
 
192 aa  70.9  0.000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.148519  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3992  transport-associated  31.67 
 
 
188 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4190  transport-associated  31.67 
 
 
188 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4102  transport-associated  31.67 
 
 
188 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4072  transport-associated  31.67 
 
 
188 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0366  transport-associated, putative  29.11 
 
 
191 aa  68.9  0.00000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.140163  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0297  putative lipoprotein  31.07 
 
 
188 aa  68.2  0.00000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3687  transport-associated  30.51 
 
 
188 aa  67.8  0.00000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0258  transport-associated  30.51 
 
 
188 aa  67.8  0.00000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3883  transport-associated  30.51 
 
 
188 aa  67.8  0.00000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.180812 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4919  periplasmic protein  34.9 
 
 
201 aa  66.2  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.618733  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2048  transport-associated  45.83 
 
 
104 aa  66.2  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2319  phospholipid-binding domain-containing protein  45.83 
 
 
104 aa  66.2  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0737  hypothetical protein  34.16 
 
 
195 aa  67  0.0000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.131598  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3357  putative lipoprotein  30.43 
 
 
188 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2673  transport-associated  45.83 
 
 
104 aa  66.6  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000178392 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5888  periplasmic protein  34.9 
 
 
201 aa  66.2  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.223121  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1939  phospholipid-binding domain-containing protein  45.83 
 
 
104 aa  66.2  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.315443  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4973  periplasmic protein  34.9 
 
 
201 aa  65.9  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00297721  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04251  periplasmic protein  34.9 
 
 
201 aa  65.9  0.0000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.368391  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3623  transport-associated  34.9 
 
 
201 aa  65.9  0.0000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4976  periplasmic protein  34.9 
 
 
205 aa  65.5  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.163142  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4969  periplasmic protein  34.9 
 
 
205 aa  65.5  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4610  periplasmic protein  34.9 
 
 
201 aa  65.9  0.0000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0762495  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3681  periplasmic protein  34.9 
 
 
201 aa  65.9  0.0000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.261916  hitchhiker  0.00179473 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4882  periplasmic protein  34.9 
 
 
205 aa  65.5  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0715597  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4917  periplasmic protein  34.9 
 
 
205 aa  65.5  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.292031  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04217  hypothetical protein  34.9 
 
 
201 aa  65.9  0.0000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.310729  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4815  periplasmic protein  34.9 
 
 
205 aa  65.5  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3585  periplasmic protein  33.56 
 
 
218 aa  64.7  0.0000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3627  hypothetical protein  30 
 
 
190 aa  63.9  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03017  hypothetical protein  28.72 
 
 
191 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0555  transport-associated  28.72 
 
 
191 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4469  hypothetical protein  28.72 
 
 
191 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0548  hypothetical protein  28.72 
 
 
191 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.496742  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3342  hypothetical protein  28.72 
 
 
191 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1123  hypothetical protein  31.79 
 
 
191 aa  63.2  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4923  periplasmic protein  34.23 
 
 
201 aa  63.2  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.497608  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3632  hypothetical protein  28.72 
 
 
191 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02968  hypothetical protein  28.72 
 
 
191 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0535  periplasmic protein  32.89 
 
 
205 aa  63.5  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.388761  hitchhiker  0.00819185 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0589  phospholipid-binding domain-containing protein  22.88 
 
 
183 aa  63.2  0.000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3785  hypothetical protein  30.69 
 
 
191 aa  62.8  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00453791  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0653  periplasmic protein  32.24 
 
 
204 aa  62  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3622  hypothetical protein  28.19 
 
 
191 aa  61.6  0.000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3445  hypothetical protein  28.19 
 
 
191 aa  61.6  0.000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3622  hypothetical protein  32.43 
 
 
191 aa  61.2  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0536  hypothetical protein  31.13 
 
 
191 aa  61.6  0.000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.35439  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3454  hypothetical protein  32.43 
 
 
191 aa  61.2  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3456  hypothetical protein  32.43 
 
 
191 aa  61.2  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3562  hypothetical protein  32.43 
 
 
191 aa  61.2  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3525  hypothetical protein  32.43 
 
 
191 aa  61.2  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.950572  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0472  hypothetical protein  31.13 
 
 
191 aa  61.6  0.000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2206  transport-associated protein  28.65 
 
 
195 aa  61.2  0.000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0836  periplasmic protein  29.53 
 
 
204 aa  61.2  0.000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3632  periplasmic protein  29.53 
 
 
204 aa  60.8  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0224  transport-associated  32.24 
 
 
189 aa  60.8  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.130883  normal  0.197651 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03360  transport-associated  32.47 
 
 
170 aa  60.5  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4339  hypothetical protein  31.52 
 
 
191 aa  60.5  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.135394 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3503  periplasmic protein  29.53 
 
 
204 aa  60.8  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0454  periplasmic protein  33.57 
 
 
202 aa  60.1  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.390695  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0249  transport-associated  30.17 
 
 
189 aa  60.1  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0349  transport-associated protein  30.17 
 
 
189 aa  59.7  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.118689  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3587  hypothetical protein  29.41 
 
 
191 aa  60.1  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.666559  normal  0.189864 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1788  transport-associated  38.75 
 
 
103 aa  60.1  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0663263  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0552  periplasmic protein  32.41 
 
 
202 aa  58.5  0.00000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.783524  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2199  putative transport-associated  22.28 
 
 
191 aa  58.5  0.00000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0386  transport-associated  31.11 
 
 
189 aa  58.5  0.00000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0270  transport-associated  30.63 
 
 
191 aa  58.2  0.00000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000691335  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4254  transport-associated  32.89 
 
 
189 aa  58.5  0.00000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000113499 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0305  hypothetical protein  30.92 
 
 
190 aa  57.8  0.00000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0106896  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0950  transport-associated  40.58 
 
 
171 aa  57.8  0.00000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.239728  normal  0.788848 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1094  transport-associated  40.58 
 
 
171 aa  57.8  0.00000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2047  transport-associated protein  42.86 
 
 
104 aa  57  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.186123  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4422  lipoprotein, putative  27.89 
 
 
192 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.303803  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4526  transport-associated  29.25 
 
 
192 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0632  transport-associated  33.89 
 
 
218 aa  56.2  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0930  transport-associated  29.25 
 
 
192 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0408  transport-associated  35.37 
 
 
224 aa  55.8  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3015  transport-associated  27.89 
 
 
230 aa  55.8  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0416  transport-associated  35.37 
 
 
224 aa  55.8  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0908  transport-associated  28.9 
 
 
177 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.324141  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4402  transport-associated  28.09 
 
 
192 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.148625 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57510  putative secreted lipoprotein  27.81 
 
 
192 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13110  hypothetical protein  27.33 
 
 
161 aa  55.5  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4998  putative lipoprotein  28.07 
 
 
192 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.263747  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3146  transporter, putative  31.29 
 
 
266 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0335  putative osmotically inducible protein  26.88 
 
 
202 aa  55.1  0.0000005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.161455  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4116  transport-associated protein  27.21 
 
 
192 aa  55.1  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1322  transport-associated protein  27.53 
 
 
192 aa  54.7  0.0000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3442  transport-associated  30.56 
 
 
219 aa  54.3  0.0000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.933167  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>