151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_4254 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_4254  transport-associated  100 
 
 		 189 aa  379  1e-104  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113499 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0349  transport-associated protein  88.89 
 
 		 189 aa  345  2e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.118689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0224  transport-associated  88.57 
 
 		 189 aa  320  9.999999999999999e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.130883  normal  0.197651 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0249  transport-associated  76.19 
 
 		 189 aa  299  1e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3687  transport-associated  78.21 
 
 		 188 aa  291  5e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0258  transport-associated  78.21 
 
 		 188 aa  291  5e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3883  transport-associated  78.21 
 
 		 188 aa  291  5e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.180812 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0297  putative lipoprotein  77.65 
 
 		 188 aa  288  4e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4102  transport-associated  78.21 
 
 		 188 aa  288  4e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4190  transport-associated  78.21 
 
 		 188 aa  288  4e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4072  transport-associated  78.21 
 
 		 188 aa  288  4e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3992  transport-associated  78.21 
 
 		 188 aa  288  4e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3695  transport-associated  78.21 
 
 		 188 aa  287  7e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.904296  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3357  putative lipoprotein  75.68 
 
 		 188 aa  286  2e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0386  transport-associated  73.54 
 
 		 189 aa  285  2.9999999999999996e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0270  transport-associated  79.53 
 
 		 191 aa  280  1e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000691335  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4435  putative transport protein  45.36 
 
 		 202 aa  155  4e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3696  transport-associated  43.93 
 
 		 192 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.148519  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3627  hypothetical protein  36.02 
 
 		 190 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0110  putative lipoprotein  39.13 
 
 		 189 aa  133  1.9999999999999998e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.319547  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00888  hypothetical protein  38.92 
 
 		 219 aa  133  1.9999999999999998e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3525  hypothetical protein  41.14 
 
 		 191 aa  131  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.950572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3454  hypothetical protein  41.14 
 
 		 191 aa  131  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3622  hypothetical protein  41.14 
 
 		 191 aa  131  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3562  hypothetical protein  41.14 
 
 		 191 aa  131  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3456  hypothetical protein  41.14 
 
 		 191 aa  131  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4339  hypothetical protein  38.29 
 
 		 191 aa  131  6.999999999999999e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.135394 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004504  putative hemolysin  39.68 
 
 		 221 aa  129  3e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000000407403  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2657  putative lipoprotein  39.57 
 
 		 195 aa  128  4.0000000000000003e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3785  hypothetical protein  36.9 
 
 		 191 aa  128  6e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00453791  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03017  hypothetical protein  40 
 
 		 191 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0555  transport-associated  40 
 
 		 191 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02968  hypothetical protein  40 
 
 		 191 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4469  hypothetical protein  40 
 
 		 191 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0305  hypothetical protein  37.78 
 
 		 190 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0106896  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0548  hypothetical protein  40 
 
 		 191 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.496742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3342  hypothetical protein  40 
 
 		 191 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3632  hypothetical protein  40 
 
 		 191 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03360  transport-associated  39.87 
 
 		 170 aa  125  5e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3622  hypothetical protein  39.43 
 
 		 191 aa  124  6e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3445  hypothetical protein  39.43 
 
 		 191 aa  124  7e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3442  transport-associated  39.57 
 
 		 219 aa  122  4e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.933167  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1936  putative phospholipid-binding liporotein  41.29 
 
 		 191 aa  121  7e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00720124  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0257  lipoprotein  41.29 
 
 		 191 aa  121  7e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0737  hypothetical protein  37.14 
 
 		 195 aa  120  9e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.131598  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0311  hypothetical protein  36.67 
 
 		 190 aa  119  3e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.716428  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0536  hypothetical protein  37.71 
 
 		 191 aa  119  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.35439  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0472  hypothetical protein  37.71 
 
 		 191 aa  119  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3587  hypothetical protein  40.57 
 
 		 191 aa  117  7.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.666559  normal  0.189864 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1174  transport-associated  37.93 
 
 		 189 aa  115  3e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.382619  normal  0.116131 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1123  hypothetical protein  37.36 
 
 		 191 aa  115  3e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3575  transport-associated protein  34.71 
 
 		 220 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.913691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4687  transport-associated protein  34.29 
 
 		 192 aa  112  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.314355  normal  0.0505791 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4402  transport-associated  33.7 
 
 		 192 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.148625 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4998  putative lipoprotein  38.96 
 
 		 192 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.263747  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57510  putative secreted lipoprotein  38.31 
 
 		 192 aa  109  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4116  transport-associated protein  37.01 
 
 		 192 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4526  transport-associated  33.15 
 
 		 192 aa  107  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1322  transport-associated protein  33.15 
 
 		 192 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4422  lipoprotein, putative  36.36 
 
 		 192 aa  107  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.303803  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0930  transport-associated  32.61 
 
 		 192 aa  106  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3428  transport-associated  35.68 
 
 		 284 aa  105  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.179471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2285  transport-associated  36.27 
 
 		 194 aa  105  4e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.590876 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3063  hypothetical protein  36.93 
 
 		 190 aa  103  2e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2920  hypothetical protein  36.93 
 
 		 190 aa  103  2e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3875  transport-associated  31.02 
 
 		 214 aa  102  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.835805  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0908  transport-associated  33.33 
 
 		 177 aa  102  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.324141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0353  periplasmic or secreted lipoprotein  35.52 
 
 		 200 aa  102  4e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0273  transport-associated  32.46 
 
 		 221 aa  100  9e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2203  transport-associated  31.28 
 
 		 188 aa  99.8  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.801164  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2206  transport-associated protein  32.8 
 
 		 195 aa  99  3e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13110  hypothetical protein  35.53 
 
 		 161 aa  99  3e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3263  transport-associated protein  35.26 
 
 		 272 aa  98.2  6e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.369629  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0500  transport-associated protein  34.1 
 
 		 222 aa  97.4  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.476678 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0632  transport-associated  32.6 
 
 		 218 aa  97.1  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0036  transport-associated  31.38 
 
 		 216 aa  96.3  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0240953  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3148  putative lipoprotein  31.21 
 
 		 192 aa  95.9  4e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3462  transport-associated  35.08 
 
 		 272 aa  90.5  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0125  transport-associated  31.28 
 
 		 267 aa  89  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0416  transport-associated  32.35 
 
 		 224 aa  87.8  9e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3764  hypothetical protein  33.86 
 
 		 227 aa  86.7  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.831681  normal  0.0879223 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0408  transport-associated  31.76 
 
 		 224 aa  85.9  3e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3264  putative signal peptide protein  34.5 
 
 		 271 aa  84.7  7e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1637  transport-associated  30.41 
 
 		 229 aa  82.8  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0588013 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0218  transport-associated  30.29 
 
 		 265 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.011843 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3062  hypothetical protein  29.83 
 
 		 195 aa  82  0.000000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3146  transporter, putative  32.78 
 
 		 266 aa  81.3  0.000000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2919  hypothetical protein  29.83 
 
 		 195 aa  80.9  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0032  transport-associated  30.26 
 
 		 216 aa  80.5  0.00000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000573132  hitchhiker  0.000000102595 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1744  putative phospholipid-binding protein  32.78 
 
 		 256 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3178  putative phospholipid-binding protein  32.22 
 
 		 256 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2799  transporter, putative  32.78 
 
 		 266 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00116321  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0039  phospholipid-binding domain-containing protein  32.78 
 
 		 266 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0022  putative phospholipid-binding protein  32.78 
 
 		 266 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0386174  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3817  putative phospholipid-binding protein  32.78 
 
 		 266 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.262069  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3898  putative phospholipid-binding protein  32.78 
 
 		 266 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0106  hypothetical protein  33.87 
 
 		 190 aa  79.3  0.00000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.277757  normal  0.0163837 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0204  transport-associated  29.71 
 
 		 265 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1064  transport-associated protein  31.18 
 
 		 243 aa  79  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.21469 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0273  transport-associated  27.63 
 
 		 266 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0122562 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>