193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_4402 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_4402  transport-associated  100 
 
 		 192 aa  390  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.148625 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4526  transport-associated  99.48 
 
 		 192 aa  388  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1322  transport-associated protein  98.96 
 
 		 192 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0930  transport-associated  97.92 
 
 		 192 aa  381  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4116  transport-associated protein  81.77 
 
 		 192 aa  305  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4422  lipoprotein, putative  81.25 
 
 		 192 aa  303  9.000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.303803  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4687  transport-associated protein  77.6 
 
 		 192 aa  295  3e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.314355  normal  0.0505791 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57510  putative secreted lipoprotein  78.16 
 
 		 192 aa  282  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4998  putative lipoprotein  77.59 
 
 		 192 aa  280  8.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.263747  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13110  hypothetical protein  65.16 
 
 		 161 aa  209  2e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0908  transport-associated  59.14 
 
 		 177 aa  209  2e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.324141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2203  transport-associated  38.95 
 
 		 188 aa  142  3e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.801164  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3148  putative lipoprotein  42.16 
 
 		 192 aa  139  3e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0353  periplasmic or secreted lipoprotein  40.21 
 
 		 200 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1123  hypothetical protein  44 
 
 		 191 aa  130  9e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4339  hypothetical protein  38.89 
 
 		 191 aa  130  1.0000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.135394 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3627  hypothetical protein  38.1 
 
 		 190 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0536  hypothetical protein  43.33 
 
 		 191 aa  129  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.35439  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0472  hypothetical protein  43.33 
 
 		 191 aa  129  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3785  hypothetical protein  37.37 
 
 		 191 aa  127  9.000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00453791  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3562  hypothetical protein  40.52 
 
 		 191 aa  125  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3456  hypothetical protein  40.52 
 
 		 191 aa  125  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3525  hypothetical protein  40.52 
 
 		 191 aa  125  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.950572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3454  hypothetical protein  40.52 
 
 		 191 aa  125  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3622  hypothetical protein  40.52 
 
 		 191 aa  125  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0297  putative lipoprotein  35.45 
 
 		 188 aa  125  5e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0270  transport-associated  36.93 
 
 		 191 aa  125  5e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000691335  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03017  hypothetical protein  40.52 
 
 		 191 aa  124  8.000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0555  transport-associated  40.52 
 
 		 191 aa  124  8.000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02968  hypothetical protein  40.52 
 
 		 191 aa  124  8.000000000000001e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4469  hypothetical protein  40.52 
 
 		 191 aa  124  8.000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3632  hypothetical protein  40.52 
 
 		 191 aa  124  8.000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3342  hypothetical protein  40.52 
 
 		 191 aa  124  8.000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0548  hypothetical protein  40.52 
 
 		 191 aa  124  8.000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.496742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3445  hypothetical protein  40.52 
 
 		 191 aa  124  8.000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3622  hypothetical protein  40.52 
 
 		 191 aa  124  8.000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3695  transport-associated  35.08 
 
 		 188 aa  124  9e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.904296  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3687  transport-associated  34.92 
 
 		 188 aa  124  1e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0258  transport-associated  34.92 
 
 		 188 aa  124  1e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3883  transport-associated  34.92 
 
 		 188 aa  124  1e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.180812 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2285  transport-associated  38.92 
 
 		 194 aa  123  2e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.590876 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00888  hypothetical protein  37.77 
 
 		 219 aa  122  3e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0305  hypothetical protein  35.26 
 
 		 190 aa  122  4e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0106896  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3992  transport-associated  35.05 
 
 		 188 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4102  transport-associated  35.05 
 
 		 188 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4190  transport-associated  35.05 
 
 		 188 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4072  transport-associated  35.05 
 
 		 188 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3063  hypothetical protein  44 
 
 		 190 aa  119  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2920  hypothetical protein  44 
 
 		 190 aa  119  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0311  hypothetical protein  35.79 
 
 		 190 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.716428  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3357  putative lipoprotein  35.05 
 
 		 188 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004504  putative hemolysin  36.36 
 
 		 221 aa  118  3.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000000407403  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1936  putative phospholipid-binding liporotein  43.41 
 
 		 191 aa  117  9.999999999999999e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00720124  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0257  lipoprotein  43.41 
 
 		 191 aa  117  9.999999999999999e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3875  transport-associated  37.89 
 
 		 214 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.835805  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3587  hypothetical protein  39.87 
 
 		 191 aa  115  3.9999999999999997e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.666559  normal  0.189864 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2206  transport-associated protein  33.5 
 
 		 195 aa  115  6e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0249  transport-associated  34.02 
 
 		 189 aa  114  6.9999999999999995e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0224  transport-associated  37.09 
 
 		 189 aa  114  7.999999999999999e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.130883  normal  0.197651 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0737  hypothetical protein  39.61 
 
 		 195 aa  114  8.999999999999998e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.131598  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0349  transport-associated protein  37.66 
 
 		 189 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.118689  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4435  putative transport protein  38.56 
 
 		 202 aa  112  3e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3696  transport-associated  32.07 
 
 		 192 aa  112  3e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.148519  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0386  transport-associated  32.79 
 
 		 189 aa  112  3e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3428  transport-associated  48.28 
 
 		 284 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.179471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3146  transporter, putative  38.56 
 
 		 266 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3442  transport-associated  35.64 
 
 		 219 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.933167  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4254  transport-associated  37.09 
 
 		 189 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113499 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2799  transporter, putative  37.91 
 
 		 266 aa  108  5e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00116321  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0039  phospholipid-binding domain-containing protein  37.91 
 
 		 266 aa  108  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0022  putative phospholipid-binding protein  37.91 
 
 		 266 aa  108  5e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0386174  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1744  putative phospholipid-binding protein  37.91 
 
 		 256 aa  108  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3817  putative phospholipid-binding protein  37.91 
 
 		 266 aa  108  5e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.262069  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3898  putative phospholipid-binding protein  37.91 
 
 		 266 aa  108  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3178  putative phospholipid-binding protein  37.91 
 
 		 256 aa  108  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0273  transport-associated  40.74 
 
 		 221 aa  108  6e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0408  transport-associated  37.91 
 
 		 224 aa  106  3e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0628  transport-associated  39.22 
 
 		 215 aa  106  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0204  transport-associated  36.6 
 
 		 265 aa  104  9e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0416  transport-associated  36.6 
 
 		 224 aa  103  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0106  hypothetical protein  41.56 
 
 		 190 aa  103  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.277757  normal  0.0163837 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3393  periplasmic or secreted lipoprotein  35.29 
 
 		 265 aa  102  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0218  transport-associated  35.95 
 
 		 265 aa  102  5e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.011843 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0632  transport-associated  35.29 
 
 		 218 aa  101  5e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03360  transport-associated  32.03 
 
 		 170 aa  101  7e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0199  transport-associated protein  34.64 
 
 		 265 aa  101  7e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.89233  unclonable  0.00000000000748386 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0273  transport-associated  34.64 
 
 		 266 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0122562 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2814  transport-associated  34.64 
 
 		 266 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0292  transport-associated  34.64 
 
 		 266 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3575  transport-associated protein  30.9 
 
 		 220 aa  99.8  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.913691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3263  transport-associated protein  31.58 
 
 		 272 aa  99  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.369629  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0110  putative lipoprotein  33.51 
 
 		 189 aa  99  4e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.319547  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0125  transport-associated  32.63 
 
 		 267 aa  97.4  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0393  transport-associated  40.52 
 
 		 222 aa  97.1  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0231244 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0500  transport-associated protein  32.03 
 
 		 222 aa  94  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.476678 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0498  transport-associated  31.38 
 
 		 290 aa  93.2  2e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1637  transport-associated  36.6 
 
 		 229 aa  92.8  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0588013 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3462  transport-associated  40.62 
 
 		 272 aa  92.4  4e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0036  transport-associated  32.26 
 
 		 216 aa  90.5  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0240953  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4816  transport-associated  34.97 
 
 		 258 aa  90.5  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>