140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2204 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2204  transport-associated  100 
 
 		 176 aa  350  5.9999999999999994e-96  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2802  transport-associated  74.38 
 
 		 184 aa  233  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1844  transport-associated  42.24 
 
 		 235 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2000  transport-associated protein  34.27 
 
 		 185 aa  98.2  6e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0471437  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1193  transport-associated protein  32.45 
 
 		 199 aa  77.8  0.00000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1939  phospholipid-binding domain-containing protein  43.37 
 
 		 104 aa  73.6  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.315443  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2319  phospholipid-binding domain-containing protein  43.37 
 
 		 104 aa  73.6  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2048  transport-associated  43.37 
 
 		 104 aa  73.6  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1195  transport-associated protein  34.25 
 
 		 192 aa  71.2  0.000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2673  transport-associated  44.16 
 
 		 104 aa  70.9  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000178392 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0073  transport-associated  33.77 
 
 		 196 aa  68.9  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0589  phospholipid-binding domain-containing protein  24.29 
 
 		 183 aa  64.3  0.0000000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3587  transport-associated  31.55 
 
 		 191 aa  62.8  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0366  transport-associated, putative  28.48 
 
 		 191 aa  61.6  0.000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.140163  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3357  putative lipoprotein  30.73 
 
 		 188 aa  61.2  0.000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0297  putative lipoprotein  31.87 
 
 		 188 aa  59.3  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0335  putative osmotically inducible protein  26.98 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.161455  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3687  transport-associated  31.32 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0258  transport-associated  31.32 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3883  transport-associated  31.32 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.180812 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1788  transport-associated  36.25 
 
 		 103 aa  59.3  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0663263  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3695  transport-associated  31.32 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.904296  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3696  transport-associated  30.87 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.148519  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4254  transport-associated  32.35 
 
 		 189 aa  58.9  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113499 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0249  transport-associated  32.58 
 
 		 189 aa  58.5  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0349  transport-associated protein  31.46 
 
 		 189 aa  58.2  0.00000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.118689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3992  transport-associated  32.79 
 
 		 188 aa  57.8  0.00000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4102  transport-associated  32.79 
 
 		 188 aa  57.8  0.00000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4072  transport-associated  32.79 
 
 		 188 aa  57.8  0.00000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4190  transport-associated  32.79 
 
 		 188 aa  57.8  0.00000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2549  hypothetical protein  35 
 
 		 113 aa  56.2  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0908  transport-associated  29.94 
 
 		 177 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.324141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0386  transport-associated  31.38 
 
 		 189 aa  55.5  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0950  transport-associated  36.23 
 
 		 171 aa  55.1  0.0000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.239728  normal  0.788848 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1094  transport-associated  36.23 
 
 		 171 aa  55.1  0.0000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2203  transport-associated  31.45 
 
 		 188 aa  55.1  0.0000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.801164  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0224  transport-associated  30.99 
 
 		 189 aa  55.1  0.0000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.130883  normal  0.197651 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4998  putative lipoprotein  28.19 
 
 		 192 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.263747  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2199  putative transport-associated  22.88 
 
 		 191 aa  53.5  0.000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03017  hypothetical protein  30.54 
 
 		 191 aa  52.4  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0555  transport-associated  30.54 
 
 		 191 aa  52.4  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4469  hypothetical protein  30.54 
 
 		 191 aa  52.4  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2206  transport-associated protein  27.57 
 
 		 195 aa  52.8  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02968  hypothetical protein  30.54 
 
 		 191 aa  52.4  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3622  hypothetical protein  30.95 
 
 		 191 aa  52.4  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3342  hypothetical protein  30.54 
 
 		 191 aa  52.4  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3632  hypothetical protein  30.54 
 
 		 191 aa  52.4  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0548  hypothetical protein  30.54 
 
 		 191 aa  52.4  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.496742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3445  hypothetical protein  30.95 
 
 		 191 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0270  transport-associated  32.69 
 
 		 191 aa  52  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000691335  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2542  transport-associated protein  34.41 
 
 		 105 aa  51.6  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000702242 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5888  periplasmic protein  30.87 
 
 		 201 aa  51.6  0.000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.223121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0353  periplasmic or secreted lipoprotein  28.95 
 
 		 200 aa  51.2  0.000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4923  periplasmic protein  29.53 
 
 		 201 aa  51.2  0.000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.497608  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04251  periplasmic protein  30.87 
 
 		 201 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.368391  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3623  transport-associated  30.87 
 
 		 201 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0321  hypothetical protein  25.39 
 
 		 198 aa  50.8  0.00001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2077  transport-associated  31.3 
 
 		 307 aa  50.4  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.735501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4919  periplasmic protein  30.87 
 
 		 201 aa  50.8  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.618733  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3456  hypothetical protein  30.36 
 
 		 191 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3622  hypothetical protein  30.36 
 
 		 191 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3454  hypothetical protein  30.36 
 
 		 191 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04217  hypothetical protein  30.87 
 
 		 201 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.310729  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4610  periplasmic protein  30.87 
 
 		 201 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0762495  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4973  periplasmic protein  30.87 
 
 		 201 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00297721  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0454  periplasmic protein  33.03 
 
 		 202 aa  50.4  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.390695  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3681  periplasmic protein  30.87 
 
 		 201 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.261916  hitchhiker  0.00179473 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3525  hypothetical protein  30.36 
 
 		 191 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.950572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3562  hypothetical protein  30.36 
 
 		 191 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2047  transport-associated protein  34.78 
 
 		 104 aa  49.7  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.186123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3849  transport-associated  38.46 
 
 		 115 aa  49.7  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000819027 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3063  hypothetical protein  30.77 
 
 		 190 aa  49.3  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0552  periplasmic protein  29.25 
 
 		 202 aa  49.3  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.783524  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3627  hypothetical protein  27.98 
 
 		 190 aa  48.9  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3146  transporter, putative  29.3 
 
 		 266 aa  49.3  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4969  periplasmic protein  30.87 
 
 		 205 aa  48.9  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4815  periplasmic protein  30.87 
 
 		 205 aa  48.9  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4917  periplasmic protein  30.87 
 
 		 205 aa  48.9  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.292031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4882  periplasmic protein  30.87 
 
 		 205 aa  48.9  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0715597  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1671  transport-associated  33.33 
 
 		 105 aa  49.3  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4976  periplasmic protein  30.87 
 
 		 205 aa  48.9  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.163142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3503  periplasmic protein  36.36 
 
 		 204 aa  49.3  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0836  periplasmic protein  36.36 
 
 		 204 aa  49.3  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3632  periplasmic protein  36.36 
 
 		 204 aa  49.3  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03360  transport-associated  29.8 
 
 		 170 aa  49.3  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2799  transporter, putative  29.3 
 
 		 266 aa  48.9  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00116321  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0039  phospholipid-binding domain-containing protein  29.3 
 
 		 266 aa  48.9  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0022  putative phospholipid-binding protein  29.3 
 
 		 266 aa  48.9  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0386174  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1744  putative phospholipid-binding protein  29.3 
 
 		 256 aa  48.9  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3817  putative phospholipid-binding protein  29.3 
 
 		 266 aa  48.9  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.262069  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3898  putative phospholipid-binding protein  29.3 
 
 		 266 aa  48.9  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3178  putative phospholipid-binding protein  29.3 
 
 		 256 aa  48.9  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2920  hypothetical protein  32.89 
 
 		 190 aa  48.5  0.00005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3691  transport-associated protein  29.27 
 
 		 211 aa  48.5  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.310052  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0535  periplasmic protein  28.48 
 
 		 205 aa  48.1  0.00006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.388761  hitchhiker  0.00819185 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3785  hypothetical protein  28.4 
 
 		 191 aa  47.8  0.00008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00453791  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3587  hypothetical protein  29.52 
 
 		 191 aa  47.8  0.00009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.666559  normal  0.189864 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4339  hypothetical protein  29.56 
 
 		 191 aa  47.4  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.135394 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1123  hypothetical protein  25.97 
 
 		 191 aa  47  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3442  transport-associated  29.89 
 
 		 219 aa  46.6  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.933167  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>