178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2673 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_2673  transport-associated  100 
 
 		 104 aa  205  2e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000178392 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2048  transport-associated  79.81 
 
 		 104 aa  167  5e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1939  phospholipid-binding domain-containing protein  79.81 
 
 		 104 aa  167  5e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.315443  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2319  phospholipid-binding domain-containing protein  79.81 
 
 		 104 aa  167  5e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2047  transport-associated protein  57 
 
 		 104 aa  105  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.186123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1788  transport-associated  52.88 
 
 		 103 aa  101  3e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0663263  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1501  transport-associated protein  51.49 
 
 		 104 aa  95.1  3e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2549  hypothetical protein  50.5 
 
 		 113 aa  90.9  6e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2407  transport-associated protein  44.23 
 
 		 104 aa  88.6  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00333473  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2170  transport-associated  46.88 
 
 		 104 aa  88.2  4e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.395466  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0477  transport-associated  45 
 
 		 103 aa  87.4  6e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1119  transport-associated  56.99 
 
 		 104 aa  86.7  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.777172 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0063  transport-associated  46.43 
 
 		 110 aa  85.1  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.37402  normal  0.306207 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2542  transport-associated protein  42 
 
 		 105 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000702242 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1671  transport-associated  42 
 
 		 105 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1193  transport-associated protein  45.05 
 
 		 199 aa  82.4  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0073  transport-associated  51.81 
 
 		 196 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1195  transport-associated protein  52.44 
 
 		 192 aa  81.3  0.000000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0278  periplasmic or secreted lipoprotein  44.58 
 
 		 103 aa  80.5  0.000000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.406104  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5303  transport-associated  45.45 
 
 		 112 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.320232  normal  0.0505821 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0653  periplasmic protein  56.34 
 
 		 204 aa  75.9  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0552  periplasmic protein  53.52 
 
 		 202 aa  74.7  0.0000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.783524  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0454  periplasmic protein  54.93 
 
 		 202 aa  74.3  0.0000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.390695  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0950  transport-associated  50 
 
 		 171 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.239728  normal  0.788848 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1094  transport-associated  50 
 
 		 171 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0916  transport-associated  40.4 
 
 		 104 aa  74.3  0.0000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4917  periplasmic protein  41.8 
 
 		 205 aa  72  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.292031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4969  periplasmic protein  41.8 
 
 		 205 aa  72  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4882  periplasmic protein  41.8 
 
 		 205 aa  72  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0715597  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4976  periplasmic protein  41.8 
 
 		 205 aa  72  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.163142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0535  periplasmic protein  51.39 
 
 		 205 aa  71.6  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.388761  hitchhiker  0.00819185 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4919  periplasmic protein  38.46 
 
 		 201 aa  71.6  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.618733  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4815  periplasmic protein  41.8 
 
 		 205 aa  72  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0875  transport-associated  48.1 
 
 		 104 aa  71.2  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.647487  normal  0.347898 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04251  periplasmic protein  40.17 
 
 		 201 aa  70.9  0.000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.368391  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3623  transport-associated  40.17 
 
 		 201 aa  70.9  0.000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4923  periplasmic protein  40.17 
 
 		 201 aa  70.9  0.000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.497608  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04217  hypothetical protein  40.17 
 
 		 201 aa  70.9  0.000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.310729  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0836  periplasmic protein  52.11 
 
 		 204 aa  71.2  0.000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5888  periplasmic protein  40.17 
 
 		 201 aa  70.9  0.000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.223121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2204  transport-associated  42.17 
 
 		 176 aa  71.2  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3681  periplasmic protein  40.17 
 
 		 201 aa  70.9  0.000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.261916  hitchhiker  0.00179473 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3632  periplasmic protein  52.11 
 
 		 204 aa  71.2  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3503  periplasmic protein  52.11 
 
 		 204 aa  71.2  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4610  periplasmic protein  40.17 
 
 		 201 aa  70.9  0.000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0762495  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2909  putative lipoprotein  39.6 
 
 		 104 aa  70.5  0.000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.434819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1170  phospholipid binding protein  42.2 
 
 		 112 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.191898 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3465  periplasmic protein  37.07 
 
 		 202 aa  68.9  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4973  periplasmic protein  39.32 
 
 		 201 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00297721  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5898  transport-associated  42.5 
 
 		 116 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1805  transport-associated protein  32.69 
 
 		 106 aa  68.2  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1033  transport-associated  34.85 
 
 		 134 aa  66.2  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.232129  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2837  transport-associated  37.63 
 
 		 104 aa  65.5  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.47962  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3514  transport-associated  37.63 
 
 		 104 aa  65.5  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2802  transport-associated  45.83 
 
 		 184 aa  66.2  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3867  transport-associated  40.51 
 
 		 104 aa  65.5  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4004  transport-associated  41.77 
 
 		 104 aa  64.7  0.0000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.38345  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3585  periplasmic protein  47.14 
 
 		 218 aa  64.7  0.0000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0790  hypothetical protein  38.95 
 
 		 103 aa  64.3  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0761  hypothetical protein  38.95 
 
 		 103 aa  64.3  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2343  transport-associated  42.17 
 
 		 104 aa  64.7  0.0000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.259537  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5436  transport-associated  43.64 
 
 		 113 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.627744 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1642  putative periplasmic protein  45.83 
 
 		 144 aa  60.5  0.000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0830703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2052  transport-associated protein  43.59 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62690  hypothetical protein  38.89 
 
 		 114 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5456  hypothetical protein  38.89 
 
 		 114 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.469146  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3156  phospholipid-binding domain-containing protein  41.77 
 
 		 246 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3027  phospholipid-binding domain-containing protein  41.98 
 
 		 184 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.119447  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43670  Transport-associated protein  45.59 
 
 		 120 aa  57.4  0.00000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.226738  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1376  osmotically inducible protein Y  41.98 
 
 		 174 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.177857  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3849  transport-associated  39.47 
 
 		 115 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000819027 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0674  transport-associated  44 
 
 		 115 aa  56.6  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3436  transport-associated  36.27 
 
 		 127 aa  55.8  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.865751  normal  0.0604848 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04303  putative phospholipid-binding domain family  46.03 
 
 		 120 aa  55.8  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2251  transport-associated  34.15 
 
 		 103 aa  55.1  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0010  transport-associated  49.21 
 
 		 101 aa  55.1  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1649  transport-associated protein  33.98 
 
 		 130 aa  53.5  0.0000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5244  transport-associated  47.62 
 
 		 116 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.797989  normal  0.73518 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3412  transport-associated  47.62 
 
 		 116 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5083  transport-associated protein  40.91 
 
 		 151 aa  53.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0093  transport-associated protein  34.78 
 
 		 119 aa  52.4  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.419766  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13110  hypothetical protein  42.62 
 
 		 161 aa  49.7  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3587  transport-associated  34.67 
 
 		 191 aa  49.7  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3603  transport-associated  36.76 
 
 		 116 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.335448  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4707  transport-associated protein  44.44 
 
 		 116 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00217947 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4039  transport-associated protein  36.11 
 
 		 156 aa  48.5  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.130048  normal  0.0885216 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4572  transport-associated  44.44 
 
 		 116 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.414411  normal  0.472278 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0177  transport-associated  39.68 
 
 		 276 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3244  transport-associated  32.35 
 
 		 118 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.688311  normal  0.631575 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4818  transport-associated protein  49.18 
 
 		 118 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.958315  normal  0.118263 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0368  transport-associated  31.71 
 
 		 107 aa  47.8  0.00006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.203179  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3627  hypothetical protein  30.56 
 
 		 190 aa  47  0.00008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5156  transport-associated protein  41.27 
 
 		 115 aa  47  0.00009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.609853 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0908  transport-associated  42.62 
 
 		 177 aa  47  0.00009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.324141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1123  hypothetical protein  40.28 
 
 		 191 aa  47  0.00009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3297  transport-associated  23.08 
 
 		 201 aa  46.6  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.173268  normal  0.854509 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2078  transport-associated  34.78 
 
 		 113 aa  46.6  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.278114  normal  0.920711 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0194  transport-associated protein  35.71 
 
 		 173 aa  46.2  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004504  putative hemolysin  40.98 
 
 		 221 aa  45.8  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000000407403  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2175  osmotically inducible periplasmic protein  36.11 
 
 		 166 aa  45.8  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.17152  normal  0.224433 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>