155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_0950 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_0950  transport-associated  100 
 
 
171 aa  346  8e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.239728  normal  0.788848 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1094  transport-associated  100 
 
 
171 aa  346  8e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2407  transport-associated protein  61.11 
 
 
104 aa  85.1  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00333473  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1501  transport-associated protein  56.94 
 
 
104 aa  84.3  7e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2047  transport-associated protein  56.94 
 
 
104 aa  83.2  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.186123  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2542  transport-associated protein  50 
 
 
105 aa  80.9  0.000000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000702242 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1671  transport-associated  49.38 
 
 
105 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2170  transport-associated  52.63 
 
 
104 aa  78.2  0.00000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.395466  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1193  transport-associated protein  53.42 
 
 
199 aa  75.1  0.0000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1195  transport-associated protein  52.05 
 
 
192 aa  74.3  0.0000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2673  transport-associated  50 
 
 
104 aa  73.9  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000178392 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0063  transport-associated  50 
 
 
110 aa  73.2  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.37402  normal  0.306207 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2048  transport-associated  50 
 
 
104 aa  72  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1939  phospholipid-binding domain-containing protein  50 
 
 
104 aa  72  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.315443  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2319  phospholipid-binding domain-containing protein  50 
 
 
104 aa  72  0.000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0477  transport-associated  44.87 
 
 
103 aa  71.6  0.000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0454  periplasmic protein  51.95 
 
 
202 aa  70.9  0.000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.390695  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1033  transport-associated  51.39 
 
 
134 aa  70.1  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.232129  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0552  periplasmic protein  53.33 
 
 
202 aa  70.5  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.783524  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3632  periplasmic protein  50 
 
 
204 aa  69.3  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0535  periplasmic protein  53.73 
 
 
205 aa  68.9  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.388761  hitchhiker  0.00819185 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3503  periplasmic protein  50 
 
 
204 aa  69.3  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0836  periplasmic protein  50 
 
 
204 aa  69.3  0.00000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0790  hypothetical protein  50.68 
 
 
103 aa  68.6  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0761  hypothetical protein  50.68 
 
 
103 aa  68.2  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0278  periplasmic or secreted lipoprotein  47.37 
 
 
103 aa  68.6  0.00000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.406104  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0073  transport-associated  48.65 
 
 
196 aa  67.4  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1788  transport-associated  47.37 
 
 
103 aa  67  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0663263  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4923  periplasmic protein  53.73 
 
 
201 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.497608  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5888  periplasmic protein  53.73 
 
 
201 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.223121  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0653  periplasmic protein  55.22 
 
 
204 aa  66.2  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.335563 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04251  periplasmic protein  53.73 
 
 
201 aa  65.9  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.368391  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3623  transport-associated  53.73 
 
 
201 aa  65.9  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2052  transport-associated protein  46.15 
 
 
139 aa  65.9  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4882  periplasmic protein  55.22 
 
 
205 aa  65.5  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0715597  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4969  periplasmic protein  55.22 
 
 
205 aa  65.5  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4917  periplasmic protein  55.22 
 
 
205 aa  65.5  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.292031  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4815  periplasmic protein  55.22 
 
 
205 aa  65.5  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3681  periplasmic protein  53.73 
 
 
201 aa  65.9  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.261916  hitchhiker  0.00179473 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4610  periplasmic protein  53.73 
 
 
201 aa  65.9  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0762495  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4973  periplasmic protein  53.73 
 
 
201 aa  65.9  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00297721  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4976  periplasmic protein  55.22 
 
 
205 aa  65.5  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.163142  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4919  periplasmic protein  53.73 
 
 
201 aa  65.9  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.618733  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04217  hypothetical protein  53.73 
 
 
201 aa  65.9  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.310729  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4039  transport-associated protein  39.29 
 
 
156 aa  65.1  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.130048  normal  0.0885216 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5898  transport-associated  37.5 
 
 
116 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1119  transport-associated  48.72 
 
 
104 aa  63.9  0.0000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.777172 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04303  putative phospholipid-binding domain family  45.78 
 
 
120 aa  63.9  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1642  putative periplasmic protein  43.06 
 
 
144 aa  62.4  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0830703  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5436  transport-associated  47.22 
 
 
113 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.627744 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1805  transport-associated protein  39.24 
 
 
106 aa  61.2  0.000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2549  hypothetical protein  45.45 
 
 
113 aa  60.8  0.000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3465  periplasmic protein  38.75 
 
 
202 aa  60.8  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3585  periplasmic protein  41.43 
 
 
218 aa  59.3  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0258  histidine kinase  39.58 
 
 
222 aa  59.3  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.469068 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1170  phospholipid binding protein  45.83 
 
 
112 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.191898 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0916  transport-associated  43.06 
 
 
104 aa  58.9  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2909  putative lipoprotein  43.84 
 
 
104 aa  58.5  0.00000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.434819  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3514  transport-associated  39.24 
 
 
104 aa  58.2  0.00000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2837  transport-associated  39.24 
 
 
104 aa  58.2  0.00000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.47962  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5303  transport-associated  45.83 
 
 
112 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.320232  normal  0.0505821 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0093  transport-associated protein  34.12 
 
 
119 aa  57.8  0.00000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.419766  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2802  transport-associated  40.58 
 
 
184 aa  57.8  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0874  transport-associated  39.19 
 
 
163 aa  57  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.586964 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3867  transport-associated  37.97 
 
 
104 aa  57  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3603  transport-associated  46.15 
 
 
116 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.335448  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0915  transport-associated  43.48 
 
 
165 aa  55.5  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.629645  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2204  transport-associated  36.23 
 
 
176 aa  55.1  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4004  transport-associated  40.79 
 
 
104 aa  54.7  0.0000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.38345  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43670  Transport-associated protein  41.33 
 
 
120 aa  54.7  0.0000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.226738  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5156  transport-associated protein  36.14 
 
 
115 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.609853 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2682  transport-associated protein  38.82 
 
 
116 aa  53.9  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0875  transport-associated  37.5 
 
 
104 aa  54.3  0.0000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.647487  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2251  transport-associated  39.73 
 
 
103 aa  53.9  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1649  transport-associated protein  41.79 
 
 
130 aa  53.5  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3436  transport-associated  46.77 
 
 
127 aa  53.9  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.865751  normal  0.0604848 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4484  hypothetical protein  50.72 
 
 
117 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2076  transport-associated protein  39.02 
 
 
107 aa  52.8  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.585071  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4706  transport-associated  52.46 
 
 
116 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.275207  normal  0.0404063 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0726  transport-associated  50 
 
 
117 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.724439  normal  0.0177667 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3297  transport-associated  38.27 
 
 
201 aa  52.8  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.173268  normal  0.854509 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62690  hypothetical protein  45.07 
 
 
114 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5456  hypothetical protein  45.07 
 
 
114 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.469146  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1600  transport-associated  42.86 
 
 
150 aa  52  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2343  transport-associated  39.73 
 
 
104 aa  52  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.259537  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2274  transport-associated  42.86 
 
 
150 aa  52  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.431584  normal  0.766565 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2175  osmotically inducible periplasmic protein  40.54 
 
 
166 aa  52  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.17152  normal  0.224433 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4707  transport-associated protein  50 
 
 
116 aa  51.6  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217947 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4572  transport-associated  50 
 
 
116 aa  51.6  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.414411  normal  0.472278 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3027  phospholipid-binding domain-containing protein  38.89 
 
 
184 aa  50.8  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.119447  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1376  osmotically inducible protein Y  38.89 
 
 
174 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.177857  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3156  phospholipid-binding domain-containing protein  38.36 
 
 
246 aa  50.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4818  transport-associated protein  50.82 
 
 
118 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.958315  normal  0.118263 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3022  transport-associated  39.13 
 
 
158 aa  49.7  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.631889  normal  0.200341 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1446  transport-associated  45.31 
 
 
125 aa  48.9  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.609395  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3412  transport-associated  38.03 
 
 
116 aa  48.5  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0368  transport-associated  34.33 
 
 
107 aa  48.5  0.00004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.203179  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4115  transport-associated  43.24 
 
 
166 aa  48.9  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5244  transport-associated  38.03 
 
 
116 aa  48.5  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.797989  normal  0.73518 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0674  transport-associated  42.65 
 
 
115 aa  48.1  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>