144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2175 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2175  osmotically inducible periplasmic protein  100 
 
 		 166 aa  323  7e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.17152  normal  0.224433 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0874  transport-associated  41.22 
 
 		 163 aa  99  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.586964 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0915  transport-associated  37.93 
 
 		 165 aa  84  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.629645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2274  transport-associated  49.09 
 
 		 150 aa  81.6  0.000000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.431584  normal  0.766565 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1600  transport-associated  49.09 
 
 		 150 aa  81.6  0.000000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4039  transport-associated protein  37.5 
 
 		 156 aa  73.2  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.130048  normal  0.0885216 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3022  transport-associated  40.14 
 
 		 158 aa  71.2  0.000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.631889  normal  0.200341 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4115  transport-associated  53.41 
 
 		 166 aa  71.2  0.000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0477  transport-associated  45.95 
 
 		 103 aa  65.5  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1642  putative periplasmic protein  47.22 
 
 		 144 aa  63.9  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0830703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0258  histidine kinase  38.78 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.469068 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1193  transport-associated protein  26.37 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1033  transport-associated  30.38 
 
 		 134 aa  56.6  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.232129  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3503  periplasmic protein  37.61 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0836  periplasmic protein  37.61 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3632  periplasmic protein  37.61 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1195  transport-associated protein  38.3 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0916  transport-associated  41.1 
 
 		 104 aa  54.3  0.0000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1805  transport-associated protein  40.54 
 
 		 106 aa  53.9  0.0000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1372  transport-associated  45.21 
 
 		 136 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.389649  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6457  transport-associated  45.21 
 
 		 136 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.591912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5639  transport-associated  43.84 
 
 		 134 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.149696 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0552  periplasmic protein  37.65 
 
 		 202 aa  52.4  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.783524  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2261  transport-associated  40 
 
 		 282 aa  52.4  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6387  transport-associated  43.84 
 
 		 134 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.508762 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2076  transport-associated protein  46.38 
 
 		 107 aa  52  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.585071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0950  transport-associated  40.54 
 
 		 171 aa  52  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.239728  normal  0.788848 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1094  transport-associated  40.54 
 
 		 171 aa  52  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3867  transport-associated  40.54 
 
 		 104 aa  51.6  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0454  periplasmic protein  37.65 
 
 		 202 aa  51.6  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.390695  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2052  transport-associated protein  34.86 
 
 		 139 aa  51.6  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2837  transport-associated  40.54 
 
 		 104 aa  51.6  0.000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.47962  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3514  transport-associated  40.54 
 
 		 104 aa  51.2  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0875  transport-associated  39.73 
 
 		 104 aa  51.2  0.000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.647487  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0333  hypothetical protein  43.1 
 
 		 279 aa  50.8  0.000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0177  transport-associated  37.84 
 
 		 276 aa  50.8  0.000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2809  transport-associated protein  32.26 
 
 		 273 aa  50.4  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00612028  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6692  transport-associated  36.62 
 
 		 543 aa  50.1  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0063  transport-associated  36.49 
 
 		 110 aa  50.4  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.37402  normal  0.306207 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5453  transport-associated protein  43.84 
 
 		 134 aa  49.7  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.627587  hitchhiker  0.00543554 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2047  transport-associated protein  38.89 
 
 		 104 aa  48.9  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.186123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1376  osmotically inducible protein Y  36.19 
 
 		 174 aa  48.9  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.177857  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4004  transport-associated  35.14 
 
 		 104 aa  48.9  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.38345  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3156  phospholipid-binding domain-containing protein  36.27 
 
 		 246 aa  48.9  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0425  hypothetical protein  39.71 
 
 		 183 aa  48.5  0.00004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0010  transport-associated  44.29 
 
 		 101 aa  48.5  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3027  phospholipid-binding domain-containing protein  36.27 
 
 		 184 aa  48.5  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.119447  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0449  hypothetical protein  39.71 
 
 		 183 aa  48.1  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3244  transport-associated  39.44 
 
 		 118 aa  48.1  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.688311  normal  0.631575 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1939  phospholipid-binding domain-containing protein  37.5 
 
 		 104 aa  47.8  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.315443  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2319  phospholipid-binding domain-containing protein  37.5 
 
 		 104 aa  47.8  0.00007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2048  transport-associated  37.5 
 
 		 104 aa  47.8  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1170  phospholipid binding protein  35.48 
 
 		 112 aa  47.4  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.191898 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0278  periplasmic or secreted lipoprotein  34.72 
 
 		 103 aa  47.4  0.00009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.406104  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0533  peptidoglycan-binding LysM  35.14 
 
 		 162 aa  47  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.235675  normal  0.091629 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5156  transport-associated protein  38.67 
 
 		 115 aa  47.4  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.609853 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0549  Peptidoglycan-binding LysM  33.73 
 
 		 162 aa  46.6  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6049  transport-associated  43.66 
 
 		 134 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0480722 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0262  transport-associated protein  37.93 
 
 		 279 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4133  transport-associated  35.06 
 
 		 188 aa  46.2  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3585  periplasmic protein  35.51 
 
 		 218 aa  45.8  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4882  periplasmic protein  33.94 
 
 		 205 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0715597  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4917  periplasmic protein  33.94 
 
 		 205 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.292031  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34760  Phospholipid-binding domain-containing protein  37.08 
 
 		 114 aa  45.4  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4969  periplasmic protein  33.94 
 
 		 205 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2676  hypothetical protein  39.39 
 
 		 303 aa  45.8  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.462534  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0093  transport-associated protein  33.82 
 
 		 119 aa  45.4  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.419766  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4065  putative phophoslipid binding protein  36.11 
 
 		 319 aa  45.4  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.279437  normal  0.152678 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1333  transport-associated  39.39 
 
 		 303 aa  45.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.286279 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4815  periplasmic protein  33.94 
 
 		 205 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2673  transport-associated  36.11 
 
 		 104 aa  45.8  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000178392 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4976  periplasmic protein  33.94 
 
 		 205 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.163142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1133  transport-associated  33.33 
 
 		 207 aa  44.7  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.125022  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5879  transport-associated  38.33 
 
 		 115 aa  45.1  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3456  hypothetical protein  36.62 
 
 		 191 aa  44.7  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2343  transport-associated  36.49 
 
 		 104 aa  44.7  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.259537  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3562  hypothetical protein  36.62 
 
 		 191 aa  44.7  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0535  periplasmic protein  43.08 
 
 		 205 aa  44.7  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.388761  hitchhiker  0.00819185 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3454  hypothetical protein  36.62 
 
 		 191 aa  44.7  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0653  periplasmic protein  37.68 
 
 		 204 aa  44.7  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3622  hypothetical protein  36.62 
 
 		 191 aa  44.7  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3525  hypothetical protein  36.62 
 
 		 191 aa  44.7  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.950572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5436  transport-associated  38.89 
 
 		 113 aa  44.7  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.627744 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3297  transport-associated  31.96 
 
 		 201 aa  44.3  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.173268  normal  0.854509 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1671  transport-associated  39.13 
 
 		 105 aa  44.3  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1446  transport-associated  36.59 
 
 		 125 aa  43.9  0.0009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.609395  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43670  Transport-associated protein  39.19 
 
 		 120 aa  43.9  0.0009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.226738  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1679  transport-associated protein  44.26 
 
 		 118 aa  43.9  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.3238  normal  0.893681 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2574  transport-associated protein  34.78 
 
 		 179 aa  43.5  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.155982  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3587  hypothetical protein  38.03 
 
 		 191 aa  43.9  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.666559  normal  0.189864 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1784  transport-associated  31.03 
 
 		 275 aa  43.5  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0010501  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0182  Peptidoglycan-binding LysM  42.31 
 
 		 187 aa  43.5  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00888  hypothetical protein  34.09 
 
 		 219 aa  43.9  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0826  transport-associated  39.44 
 
 		 245 aa  43.9  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0362569 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0555  transport-associated  36.62 
 
 		 191 aa  43.1  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2682  transport-associated protein  40.23 
 
 		 116 aa  43.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3436  transport-associated  32.65 
 
 		 127 aa  42.7  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.865751  normal  0.0604848 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0885  transport-associated domain-containing protein  43.48 
 
 		 122 aa  43.1  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3185  transport-associated domain-containing protein  43.48 
 
 		 122 aa  43.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0627443  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0548  hypothetical protein  36.62 
 
 		 191 aa  43.1  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.496742  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>