151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_4572 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4707  transport-associated protein  100 
 
 		 116 aa  228  3e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00217947 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4572  transport-associated  100 
 
 		 116 aa  228  3e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.414411  normal  0.472278 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0726  transport-associated  89.74 
 
 		 117 aa  176  1e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.724439  normal  0.0177667 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4818  transport-associated protein  72.88 
 
 		 118 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.958315  normal  0.118263 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4706  transport-associated  74.14 
 
 		 116 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.275207  normal  0.0404063 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4484  hypothetical protein  75.21 
 
 		 117 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4175  transport-associated protein  69.23 
 
 		 117 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43670  Transport-associated protein  50.43 
 
 		 120 aa  92.4  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.226738  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62690  hypothetical protein  50.49 
 
 		 114 aa  87.4  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5456  hypothetical protein  50.49 
 
 		 114 aa  87.4  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.469146  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3603  transport-associated  47.41 
 
 		 116 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.335448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04303  putative phospholipid-binding domain family  46.88 
 
 		 120 aa  75.1  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3436  transport-associated  45.28 
 
 		 127 aa  71.6  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.865751  normal  0.0604848 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0278  periplasmic or secreted lipoprotein  47.5 
 
 		 103 aa  63.9  0.0000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.406104  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3412  transport-associated  48 
 
 		 116 aa  62  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5244  transport-associated  40.91 
 
 		 116 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.797989  normal  0.73518 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0333  hypothetical protein  49.3 
 
 		 279 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0262  transport-associated protein  50.7 
 
 		 279 aa  62  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0177  transport-associated  39.47 
 
 		 276 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5156  transport-associated protein  46.67 
 
 		 115 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.609853 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1784  transport-associated  46.27 
 
 		 275 aa  57.4  0.00000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0010501  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2682  transport-associated protein  41.67 
 
 		 116 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1195  transport-associated protein  41.9 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3469  transport-associated  48 
 
 		 116 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4052  transport-associated  48 
 
 		 116 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2048  transport-associated  41.23 
 
 		 104 aa  55.5  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1939  phospholipid-binding domain-containing protein  41.23 
 
 		 104 aa  55.5  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.315443  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2319  phospholipid-binding domain-containing protein  41.23 
 
 		 104 aa  55.5  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2553  hypothetical protein  44.78 
 
 		 278 aa  54.7  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0552  periplasmic protein  42.73 
 
 		 202 aa  53.9  0.0000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.783524  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0454  periplasmic protein  42.73 
 
 		 202 aa  53.9  0.0000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.390695  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0653  periplasmic protein  48.44 
 
 		 204 aa  52.4  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0950  transport-associated  50 
 
 		 171 aa  51.2  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.239728  normal  0.788848 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1094  transport-associated  50 
 
 		 171 aa  51.2  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4998  putative lipoprotein  36.92 
 
 		 192 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.263747  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3632  periplasmic protein  49.25 
 
 		 204 aa  51.2  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3503  periplasmic protein  49.25 
 
 		 204 aa  51.2  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0836  periplasmic protein  49.25 
 
 		 204 aa  50.8  0.000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57510  putative secreted lipoprotein  35.38 
 
 		 192 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3063  hypothetical protein  36 
 
 		 190 aa  48.9  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2920  hypothetical protein  36 
 
 		 190 aa  48.9  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4687  transport-associated protein  38.1 
 
 		 192 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.314355  normal  0.0505791 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1193  transport-associated protein  52.46 
 
 		 199 aa  49.3  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4969  periplasmic protein  46.88 
 
 		 205 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4815  periplasmic protein  46.88 
 
 		 205 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4882  periplasmic protein  46.88 
 
 		 205 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0715597  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0249  transport-associated  43.75 
 
 		 189 aa  48.5  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4917  periplasmic protein  46.88 
 
 		 205 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.292031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4976  periplasmic protein  46.88 
 
 		 205 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.163142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4236  transport-associated protein  32.74 
 
 		 175 aa  48.1  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004504  putative hemolysin  45.45 
 
 		 221 aa  48.1  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000000407403  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3297  transport-associated  38.57 
 
 		 201 aa  47.8  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.173268  normal  0.854509 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1788  transport-associated  41.98 
 
 		 103 aa  47.4  0.00006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0663263  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04251  periplasmic protein  39.81 
 
 		 201 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.368391  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3623  transport-associated  39.81 
 
 		 201 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3681  periplasmic protein  39.81 
 
 		 201 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.261916  hitchhiker  0.00179473 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3156  phospholipid-binding domain-containing protein  45.9 
 
 		 246 aa  47.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3695  transport-associated  44.44 
 
 		 188 aa  47.4  0.00007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.904296  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04217  hypothetical protein  39.81 
 
 		 201 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.310729  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4610  periplasmic protein  39.81 
 
 		 201 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0762495  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4973  periplasmic protein  39.81 
 
 		 201 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00297721  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2673  transport-associated  44.44 
 
 		 104 aa  47.4  0.00007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000178392 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5888  periplasmic protein  39.81 
 
 		 201 aa  47  0.00008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.223121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6387  transport-associated  42.62 
 
 		 134 aa  47  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.508762 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3263  transport-associated protein  40.32 
 
 		 272 aa  47  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.369629  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5639  transport-associated  42.62 
 
 		 134 aa  47  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.149696 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4923  periplasmic protein  39.81 
 
 		 201 aa  47  0.00008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.497608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3027  phospholipid-binding domain-containing protein  45.9 
 
 		 184 aa  47  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.119447  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4919  periplasmic protein  39.81 
 
 		 201 aa  47  0.00008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.618733  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2047  transport-associated protein  42.19 
 
 		 104 aa  47  0.00009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.186123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1376  osmotically inducible protein Y  45.9 
 
 		 174 aa  47  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.177857  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0134  transport-associated protein  38.24 
 
 		 273 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.892998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0010  transport-associated  43.9 
 
 		 101 aa  47  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0151  transport-associated  38.24 
 
 		 273 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4422  lipoprotein, putative  33.85 
 
 		 192 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.303803  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4116  transport-associated protein  33.85 
 
 		 192 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1446  transport-associated  34.45 
 
 		 125 aa  45.4  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.609395  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6049  transport-associated  40.98 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0480722 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5094  transport-associated  38.24 
 
 		 273 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0983587  normal  0.219919 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1322  transport-associated protein  36.92 
 
 		 192 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2549  hypothetical protein  43.75 
 
 		 113 aa  45.4  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5303  transport-associated  40.85 
 
 		 112 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.320232  normal  0.0505821 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0535  periplasmic protein  44.93 
 
 		 205 aa  45.4  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.388761  hitchhiker  0.00819185 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4402  transport-associated  36.92 
 
 		 192 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.148625 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00888  hypothetical protein  43.94 
 
 		 219 aa  45.4  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0930  transport-associated  36.92 
 
 		 192 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0149  transport-associated  38.24 
 
 		 273 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.798997 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4526  transport-associated  36.92 
 
 		 192 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3992  transport-associated  44.44 
 
 		 188 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1372  transport-associated  40.98 
 
 		 136 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.389649  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0536  hypothetical protein  44.26 
 
 		 191 aa  45.1  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.35439  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6457  transport-associated  40.98 
 
 		 136 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.591912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4102  transport-associated  44.44 
 
 		 188 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4072  transport-associated  44.44 
 
 		 188 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0472  hypothetical protein  44.26 
 
 		 191 aa  45.1  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4190  transport-associated  44.44 
 
 		 188 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1123  hypothetical protein  42.62 
 
 		 191 aa  44.7  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03017  hypothetical protein  39.02 
 
 		 191 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3445  hypothetical protein  38.55 
 
 		 191 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0548  hypothetical protein  39.02 
 
 		 191 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.496742  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>