238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0333 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0333  hypothetical protein  100 
 
 		 279 aa  553  1e-156  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0262  transport-associated protein  94.98 
 
 		 279 aa  510  1e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0177  transport-associated  59.35 
 
 		 276 aa  273  3e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5094  transport-associated  47.06 
 
 		 273 aa  235  7e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0983587  normal  0.219919 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0149  transport-associated  46.04 
 
 		 273 aa  230  3e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.798997 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0151  transport-associated  44.6 
 
 		 273 aa  223  3e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0134  transport-associated protein  44.96 
 
 		 273 aa  221  9e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.892998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2261  transport-associated  38.97 
 
 		 282 aa  166  5e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1784  transport-associated  40.08 
 
 		 275 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0010501  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2553  hypothetical protein  39.66 
 
 		 278 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2185  transport-associated  34.02 
 
 		 255 aa  109  5e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0258  histidine kinase  34.78 
 
 		 222 aa  92.4  7e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.469068 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0826  transport-associated  30.86 
 
 		 245 aa  90.5  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0362569 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5456  hypothetical protein  47.96 
 
 		 114 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.469146  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62690  hypothetical protein  47.96 
 
 		 114 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01237  putative hyperosmotically inducible periplasmic protein  32.18 
 
 		 175 aa  80.1  0.00000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.315155  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4133  transport-associated  33.79 
 
 		 188 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43670  Transport-associated protein  55.07 
 
 		 120 aa  77.8  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.226738  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3603  transport-associated  54.29 
 
 		 116 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.335448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1317  transport-associated  36.36 
 
 		 181 aa  75.5  0.0000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3995  transport-associated  36.43 
 
 		 182 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000543546  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3585  periplasmic protein  33.49 
 
 		 218 aa  73.9  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3707  transport-associated  36.59 
 
 		 181 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.101636  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0836  periplasmic protein  38.31 
 
 		 204 aa  70.9  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3503  periplasmic protein  38.31 
 
 		 204 aa  70.9  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3632  periplasmic protein  38.31 
 
 		 204 aa  70.9  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001941  putative hyperosmotically inducible periplasmic protein  30 
 
 		 183 aa  69.3  0.00000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1415  transport-associated  34.96 
 
 		 184 aa  69.3  0.00000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3436  transport-associated  46.51 
 
 		 127 aa  67.4  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.865751  normal  0.0604848 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04303  putative phospholipid-binding domain family  47.89 
 
 		 120 aa  68.2  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2676  transport-associated  35 
 
 		 182 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2744  transport-associated  35 
 
 		 182 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1405  transport-associated protein  34.17 
 
 		 184 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2851  transport-associated  35 
 
 		 182 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.884447 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0726  transport-associated  52.11 
 
 		 117 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.724439  normal  0.0177667 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2939  transport-associated  34.17 
 
 		 184 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.537293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4706  transport-associated  52.11 
 
 		 116 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.275207  normal  0.0404063 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1441  transport-associated  34.17 
 
 		 184 aa  66.2  0.0000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4484  hypothetical protein  47.62 
 
 		 117 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4818  transport-associated protein  49.3 
 
 		 118 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.958315  normal  0.118263 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2203  transport-associated  31.5 
 
 		 188 aa  63.2  0.000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.801164  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0264  transport-associated  29.1 
 
 		 187 aa  63.2  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.47721  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0552  periplasmic protein  34.42 
 
 		 202 aa  62  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.783524  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1193  transport-associated protein  28.66 
 
 		 199 aa  61.6  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4707  transport-associated protein  49.3 
 
 		 116 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00217947 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4572  transport-associated  49.3 
 
 		 116 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.414411  normal  0.472278 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3328  transport-associated  28.97 
 
 		 217 aa  60.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.686073  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3465  periplasmic protein  32.45 
 
 		 202 aa  60.5  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0454  periplasmic protein  33.33 
 
 		 202 aa  60.1  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.390695  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6692  transport-associated  23.94 
 
 		 543 aa  60.1  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2613  transport-associated  27.1 
 
 		 214 aa  59.3  0.00000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.574258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1195  transport-associated protein  28.03 
 
 		 192 aa  58.9  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4175  transport-associated protein  45.24 
 
 		 117 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2047  transport-associated protein  38.2 
 
 		 104 aa  57.8  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.186123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2206  transport-associated protein  32.81 
 
 		 195 aa  57.4  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2657  putative lipoprotein  33.83 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0278  periplasmic or secreted lipoprotein  50 
 
 		 103 aa  56.2  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.406104  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0421  transport-associated protein  26.52 
 
 		 241 aa  56.6  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004504  putative hemolysin  34.43 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000000407403  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3063  hypothetical protein  29.53 
 
 		 190 aa  55.1  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2920  hypothetical protein  29.53 
 
 		 190 aa  55.1  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4061  transport-associated  25.56 
 
 		 213 aa  55.1  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.221026  normal  0.208315 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4236  transport-associated protein  40.91 
 
 		 175 aa  54.3  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0139  transport-associated protein  32.31 
 
 		 223 aa  54.3  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1774  periplasmic or secreted lipoprotein  25.62 
 
 		 255 aa  54.7  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0221772  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0073  transport-associated  29.52 
 
 		 196 aa  54.7  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3696  transport-associated  30.83 
 
 		 192 aa  54.3  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.148519  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5888  periplasmic protein  29.41 
 
 		 201 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.223121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00888  hypothetical protein  35.25 
 
 		 219 aa  54.3  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0535  periplasmic protein  31.37 
 
 		 205 aa  54.7  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.388761  hitchhiker  0.00819185 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0477  transport-associated  35.35 
 
 		 103 aa  53.9  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5083  transport-associated protein  37.84 
 
 		 151 aa  53.9  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1642  putative periplasmic protein  36.71 
 
 		 144 aa  53.9  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0830703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0653  periplasmic protein  32.48 
 
 		 204 aa  53.9  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0110  putative lipoprotein  33.61 
 
 		 189 aa  53.5  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.319547  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3022  transport-associated  49.23 
 
 		 158 aa  53.5  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.631889  normal  0.200341 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4919  periplasmic protein  29.41 
 
 		 201 aa  53.9  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.618733  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4973  periplasmic protein  29.41 
 
 		 201 aa  53.1  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00297721  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1664  hypothetical protein  23.87 
 
 		 215 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0800901  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4923  periplasmic protein  29.41 
 
 		 201 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.497608  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04251  periplasmic protein  29.41 
 
 		 201 aa  53.1  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.368391  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3623  transport-associated  29.41 
 
 		 201 aa  53.1  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3681  periplasmic protein  29.41 
 
 		 201 aa  53.1  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.261916  hitchhiker  0.00179473 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04217  hypothetical protein  29.41 
 
 		 201 aa  53.1  0.000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.310729  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1123  hypothetical protein  32.12 
 
 		 191 aa  53.1  0.000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4610  periplasmic protein  29.41 
 
 		 201 aa  53.1  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0762495  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2437  CBS domain containing protein  29.29 
 
 		 628 aa  52.8  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000875184  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3785  hypothetical protein  32.73 
 
 		 191 aa  52.8  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00453791  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3015  transport-associated  24.58 
 
 		 230 aa  52.8  0.000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0414  OsmY domain-containing protein  27.52 
 
 		 215 aa  52.4  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4422  lipoprotein, putative  27.22 
 
 		 192 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.303803  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3575  transport-associated protein  30.77 
 
 		 220 aa  51.6  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.913691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0874  transport-associated  40.28 
 
 		 163 aa  51.6  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.586964 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3622  hypothetical protein  30.49 
 
 		 191 aa  50.8  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4116  transport-associated protein  27.11 
 
 		 192 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4039  transport-associated protein  46.03 
 
 		 156 aa  50.8  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.130048  normal  0.0885216 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5156  transport-associated protein  36.99 
 
 		 115 aa  51.2  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.609853 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0536  hypothetical protein  31.52 
 
 		 191 aa  51.2  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.35439  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3357  putative lipoprotein  44.62 
 
 		 188 aa  51.2  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2660  putative phospholipid-binding protein  25.5 
 
 		 237 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>