96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0421 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0421  transport-associated protein  100 
 
 		 241 aa  483  1e-135  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0727  transport-associated protein  63.07 
 
 		 240 aa  311  7.999999999999999e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2836  transport-associated  60.67 
 
 		 240 aa  279  2e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0986  transport-associated  56.83 
 
 		 240 aa  261  6e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3274  transport-associated protein  57.71 
 
 		 240 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1367  periplasmic or secreted lipoprotein  49.79 
 
 		 245 aa  214  9e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.487396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1978  transport-associated protein  50.62 
 
 		 241 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1774  periplasmic or secreted lipoprotein  36.9 
 
 		 255 aa  170  2e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0221772  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4370  transport-associated protein  40.08 
 
 		 243 aa  166  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4872  hypothetical protein  39.75 
 
 		 271 aa  157  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2966  periplasmic or secreted lipoprotein OsmY  36.4 
 
 		 219 aa  135  5e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000230813  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6692  transport-associated  27.03 
 
 		 543 aa  66.6  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2185  transport-associated  28.89 
 
 		 255 aa  63.2  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0826  transport-associated  37.82 
 
 		 245 aa  62  0.000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0362569 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2622  transport-associated  28.51 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3328  transport-associated  28.94 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.686073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0262  transport-associated protein  26.96 
 
 		 279 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6209  transport-associated  31.03 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.716513 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2613  transport-associated  28.57 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.574258  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0333  hypothetical protein  26.52 
 
 		 279 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2956  transport-associated protein  25.7 
 
 		 295 aa  54.7  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0189  hypothetical protein  25.94 
 
 		 215 aa  54.7  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.193269 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0177  transport-associated  28.8 
 
 		 276 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2802  putative phospholipid-binding protein  30.82 
 
 		 215 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1280  OsmY domain-containing protein  30.82 
 
 		 215 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.84893  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2660  putative phospholipid-binding protein  31.03 
 
 		 237 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0140  putative phospholipid-binding protein  30.82 
 
 		 237 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0414  OsmY domain-containing protein  30.14 
 
 		 215 aa  54.3  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0116  OsmY domain-containing protein  30.82 
 
 		 215 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.567152  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5879  transport-associated protein  29.66 
 
 		 215 aa  53.9  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1063  OsmY domain-containing protein  31.03 
 
 		 215 aa  53.5  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3808  transport-associated  29.34 
 
 		 216 aa  53.1  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0353  phospholipid binding protein  27.68 
 
 		 216 aa  52.8  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7783  putative osmotically-inducible protein Y (precursor)  26.47 
 
 		 220 aa  52.4  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.379132  normal  0.155349 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2077  transport-associated  26.19 
 
 		 307 aa  52  0.000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.735501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4234  transport-associated  29.13 
 
 		 215 aa  51.6  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.855371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3886  transport-associated  26.98 
 
 		 214 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.121  normal  0.085803 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1868  transport-associated  26.32 
 
 		 216 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.882392  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2456  transport-associated  27.68 
 
 		 215 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.262468  normal  0.570841 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6897  transport-associated  26.34 
 
 		 217 aa  49.7  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.35821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0431  transport-associated  27.43 
 
 		 215 aa  49.3  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.390186  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4562  transport-associated  26.23 
 
 		 215 aa  49.3  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.266043 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4429  transport-associated  26.23 
 
 		 215 aa  49.3  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1220  transport-associated protein  26.64 
 
 		 214 aa  49.3  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1664  hypothetical protein  25.97 
 
 		 215 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0800901  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6056  transport-associated  28.93 
 
 		 226 aa  48.1  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.822447  hitchhiker  0.00012166 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5932  transport-associated protein  51.79 
 
 		 216 aa  48.5  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7765  Smc22-1 ( osmotically inducible sensory protein)  35.54 
 
 		 217 aa  47.8  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.705157  normal  0.17558 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1909  transport-associated  26.78 
 
 		 215 aa  47.8  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.966808  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1784  transport-associated  27.76 
 
 		 275 aa  47.4  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0010501  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0535  periplasmic protein  25.68 
 
 		 205 aa  47.8  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.388761  hitchhiker  0.00819185 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5094  transport-associated  25.51 
 
 		 273 aa  47  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0983587  normal  0.219919 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0836  periplasmic protein  31.45 
 
 		 204 aa  46.6  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0932  transport-associated  32.23 
 
 		 131 aa  46.6  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0149  transport-associated  26.03 
 
 		 273 aa  47  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.798997 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3503  periplasmic protein  31.45 
 
 		 204 aa  46.6  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0425  transport-associated  25.58 
 
 		 214 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.379914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3632  periplasmic protein  31.45 
 
 		 204 aa  46.6  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3707  transport-associated  32 
 
 		 181 aa  46.2  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.101636  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1317  transport-associated  33.06 
 
 		 181 aa  45.8  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3033  putative phophoslipid binding protein  25.15 
 
 		 249 aa  45.4  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.435467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0552  periplasmic protein  30.94 
 
 		 202 aa  45.4  0.0009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.783524  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2437  CBS domain containing protein  35.04 
 
 		 628 aa  44.7  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000875184  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1111  transport-associated  37.29 
 
 		 226 aa  44.7  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3634  transport-associated  36.22 
 
 		 228 aa  44.7  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000681524 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2264  transport-associated  25.56 
 
 		 216 aa  44.7  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4923  periplasmic protein  24.83 
 
 		 201 aa  44.3  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.497608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3995  transport-associated  31.25 
 
 		 182 aa  44.3  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000543546  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2881  transport-associated  27.68 
 
 		 216 aa  43.9  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1226  transport-associated protein  31.36 
 
 		 217 aa  43.9  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.528686  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0134  transport-associated protein  22.92 
 
 		 273 aa  43.5  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.892998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2676  transport-associated  28.35 
 
 		 182 aa  43.5  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3465  periplasmic protein  31.52 
 
 		 202 aa  43.9  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2851  transport-associated  28.35 
 
 		 182 aa  43.5  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.884447 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1101  transport-associated  30.4 
 
 		 216 aa  43.5  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2744  transport-associated  28.35 
 
 		 182 aa  43.1  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04251  periplasmic protein  24.83 
 
 		 201 aa  43.1  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.368391  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0453  OsmY domain-containing protein  30.77 
 
 		 197 aa  43.1  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584382  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1025  OsmY domain-containing protein  29.85 
 
 		 197 aa  43.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04217  hypothetical protein  24.83 
 
 		 201 aa  43.1  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.310729  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0155  OsmY domain-containing protein  29.85 
 
 		 216 aa  42.7  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3623  transport-associated  24.83 
 
 		 201 aa  43.1  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1324  OsmY domain-containing protein  29.85 
 
 		 216 aa  42.7  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2759  putative phospholipid-binding protein  29.85 
 
 		 216 aa  42.7  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2616  putative phospholipid-binding protein  29.85 
 
 		 216 aa  42.7  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0180  OsmY domain-containing protein  29.85 
 
 		 216 aa  42.7  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4610  periplasmic protein  24.83 
 
 		 201 aa  43.1  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0762495  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3681  periplasmic protein  24.83 
 
 		 201 aa  43.1  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.261916  hitchhiker  0.00179473 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7774  hypothetical protein  31.06 
 
 		 203 aa  42.7  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.194796  normal  0.37862 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5912  transport-associated protein  26.03 
 
 		 216 aa  42.7  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.203256  normal  0.355197 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5544  transport-associated  31.01 
 
 		 216 aa  42.7  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.078197  normal  0.764141 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1405  transport-associated protein  34.29 
 
 		 184 aa  42.4  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4432  transport-associated  24.07 
 
 		 217 aa  42  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4565  transport-associated  24.07 
 
 		 217 aa  42  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.192769 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3604  hypothetical protein  24.12 
 
 		 215 aa  41.6  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.984998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1151  transport-associated protein  30.25 
 
 		 141 aa  41.6  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>