56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1978 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1978  transport-associated protein  100 
 
 		 241 aa  479  1e-134  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0421  transport-associated protein  50.62 
 
 		 241 aa  227  1e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0727  transport-associated protein  45.99 
 
 		 240 aa  201  7e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2836  transport-associated  45.61 
 
 		 240 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0986  transport-associated  43.1 
 
 		 240 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3274  transport-associated protein  44.35 
 
 		 240 aa  169  5e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1367  periplasmic or secreted lipoprotein  42.04 
 
 		 245 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.487396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1774  periplasmic or secreted lipoprotein  36 
 
 		 255 aa  159  5e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0221772  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4370  transport-associated protein  38.78 
 
 		 243 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4872  hypothetical protein  35.15 
 
 		 271 aa  123  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2966  periplasmic or secreted lipoprotein OsmY  30.96 
 
 		 219 aa  105  5e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000230813  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7765  Smc22-1 ( osmotically inducible sensory protein)  28.69 
 
 		 217 aa  57  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.705157  normal  0.17558 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2613  transport-associated  35.83 
 
 		 214 aa  53.1  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.574258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3886  transport-associated  35 
 
 		 214 aa  52.4  0.000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.121  normal  0.085803 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3634  transport-associated  35.71 
 
 		 228 aa  52  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000681524 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0453  OsmY domain-containing protein  27.11 
 
 		 197 aa  51.2  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584382  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0552  periplasmic protein  32 
 
 		 202 aa  51.6  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.783524  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6692  transport-associated  25.19 
 
 		 543 aa  50.4  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2622  transport-associated  25.31 
 
 		 215 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0177  transport-associated  27.67 
 
 		 276 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2185  transport-associated  25 
 
 		 255 aa  50.8  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1868  transport-associated  28.68 
 
 		 216 aa  48.9  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.882392  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2616  putative phospholipid-binding protein  40.32 
 
 		 216 aa  48.9  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0180  OsmY domain-containing protein  40.32 
 
 		 216 aa  48.9  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2759  putative phospholipid-binding protein  40.32 
 
 		 216 aa  48.9  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0155  OsmY domain-containing protein  40.32 
 
 		 216 aa  48.9  0.00008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1324  OsmY domain-containing protein  40.32 
 
 		 216 aa  48.9  0.00008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0353  phospholipid binding protein  28.51 
 
 		 216 aa  48.1  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1025  OsmY domain-containing protein  40.32 
 
 		 197 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3859  transport-associated protein  30.16 
 
 		 216 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.790334 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0826  transport-associated  33.9 
 
 		 245 aa  47  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0362569 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3808  transport-associated  27.27 
 
 		 216 aa  47  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0425  transport-associated  31.67 
 
 		 214 aa  45.8  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.379914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1491  transport-associated  29.37 
 
 		 216 aa  45.8  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01237  putative hyperosmotically inducible periplasmic protein  30.71 
 
 		 175 aa  45.4  0.0008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.315155  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0454  periplasmic protein  30 
 
 		 202 aa  45.4  0.0008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.390695  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0204  hypothetical protein  26.52 
 
 		 219 aa  45.4  0.0009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0149  transport-associated  27.69 
 
 		 273 aa  45.4  0.0009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.798997 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5912  transport-associated protein  26.61 
 
 		 216 aa  45.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.203256  normal  0.355197 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0258  histidine kinase  30.07 
 
 		 222 aa  44.7  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.469068 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0431  transport-associated  26.02 
 
 		 215 aa  45.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.390186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3328  transport-associated  25 
 
 		 217 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.686073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0264  transport-associated  29.49 
 
 		 187 aa  45.1  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.47721  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2456  transport-associated  30.56 
 
 		 215 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.262468  normal  0.570841 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6189  transport-associated  28.28 
 
 		 216 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.551844  normal  0.435123 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3585  periplasmic protein  29.92 
 
 		 218 aa  42.7  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5094  transport-associated  29.26 
 
 		 273 aa  42.7  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0983587  normal  0.219919 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0262  transport-associated protein  26.75 
 
 		 279 aa  42.7  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1226  transport-associated protein  28 
 
 		 217 aa  42.7  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.528686  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0189  hypothetical protein  29.91 
 
 		 215 aa  42.7  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.193269 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3995  transport-associated  29.93 
 
 		 182 aa  42.7  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000543546  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1784  transport-associated  24.29 
 
 		 275 aa  42.4  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0010501  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1909  transport-associated  28.33 
 
 		 215 aa  42.4  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.966808  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4133  transport-associated  32.48 
 
 		 188 aa  42  0.009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1892  putative phophoslipid binding protein  25.74 
 
 		 216 aa  41.6  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.953866 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2437  CBS domain containing protein  30.43 
 
 		 628 aa  42  0.01  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000875184  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>