49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1774 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_1774  periplasmic or secreted lipoprotein  100 
 
 
255 aa  520  1e-146  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0221772  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1367  periplasmic or secreted lipoprotein  37.4 
 
 
245 aa  178  7e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.487396  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0421  transport-associated protein  36.9 
 
 
241 aa  170  2e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0727  transport-associated protein  34.52 
 
 
240 aa  158  7e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4370  transport-associated protein  36.22 
 
 
243 aa  155  9e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1978  transport-associated protein  36 
 
 
241 aa  152  5e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2836  transport-associated  33.6 
 
 
240 aa  150  1e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4872  hypothetical protein  36.25 
 
 
271 aa  149  5e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0986  transport-associated  34.66 
 
 
240 aa  146  3e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3274  transport-associated protein  34.26 
 
 
240 aa  138  7.999999999999999e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2966  periplasmic or secreted lipoprotein OsmY  25.6 
 
 
219 aa  81.6  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000230813  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0333  hypothetical protein  25.62 
 
 
279 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6692  transport-associated  27.35 
 
 
543 aa  53.5  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4562  transport-associated  27.27 
 
 
215 aa  50.4  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.266043 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0262  transport-associated protein  24.38 
 
 
279 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4429  transport-associated  27.27 
 
 
215 aa  50.4  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2185  transport-associated  28.89 
 
 
255 aa  49.7  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3015  transport-associated  28.23 
 
 
230 aa  49.7  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2456  transport-associated  24.44 
 
 
215 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.262468  normal  0.570841 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0189  hypothetical protein  27.27 
 
 
215 aa  48.1  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.193269 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4234  transport-associated  23.51 
 
 
215 aa  48.1  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.855371  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2616  putative phospholipid-binding protein  26.89 
 
 
216 aa  47  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0155  OsmY domain-containing protein  26.89 
 
 
216 aa  47  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0180  OsmY domain-containing protein  26.89 
 
 
216 aa  47  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2759  putative phospholipid-binding protein  26.89 
 
 
216 aa  47  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1324  OsmY domain-containing protein  26.89 
 
 
216 aa  47  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1025  OsmY domain-containing protein  26.89 
 
 
197 aa  47  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6056  transport-associated  30.77 
 
 
226 aa  46.6  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.822447  hitchhiker  0.00012166 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3587  transport-associated  26.83 
 
 
191 aa  46.6  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3328  transport-associated  25.52 
 
 
217 aa  45.8  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.686073  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7783  putative osmotically-inducible protein Y (precursor)  28.21 
 
 
220 aa  44.7  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.379132  normal  0.155349 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3465  periplasmic protein  27.78 
 
 
202 aa  45.4  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1108  transport-associated  26.83 
 
 
216 aa  45.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0453  OsmY domain-containing protein  27.5 
 
 
197 aa  44.3  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584382  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3634  transport-associated  28.33 
 
 
228 aa  44.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000681524 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0414  OsmY domain-containing protein  30.25 
 
 
215 aa  44.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0826  transport-associated  29.51 
 
 
245 aa  44.7  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0362569 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1415  transport-associated  30.33 
 
 
184 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1220  transport-associated protein  27.64 
 
 
214 aa  44.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0353  phospholipid binding protein  25.21 
 
 
216 aa  43.5  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2613  transport-associated  24.55 
 
 
214 aa  43.1  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.574258  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1405  transport-associated protein  32.32 
 
 
184 aa  43.1  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4432  transport-associated  20.9 
 
 
217 aa  42.7  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4565  transport-associated  20.9 
 
 
217 aa  42.7  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.192769 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1441  transport-associated  32.32 
 
 
184 aa  42.7  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2837  transport-associated  31.76 
 
 
104 aa  42.4  0.007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.47962  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1317  transport-associated  28.69 
 
 
181 aa  42.4  0.008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7765  Smc22-1 ( osmotically inducible sensory protein)  30 
 
 
217 aa  42.4  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.705157  normal  0.17558 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3514  transport-associated  31.76 
 
 
104 aa  42  0.009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>