65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3274 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3274  transport-associated protein  100 
 
 		 240 aa  476  1e-134  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0986  transport-associated  95 
 
 		 240 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0421  transport-associated protein  57.71 
 
 		 241 aa  263  2e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0727  transport-associated protein  56.78 
 
 		 240 aa  256  3e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2836  transport-associated  52.12 
 
 		 240 aa  231  1e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1978  transport-associated protein  44.35 
 
 		 241 aa  178  8e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1367  periplasmic or secreted lipoprotein  43.03 
 
 		 245 aa  176  3e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.487396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4370  transport-associated protein  39.83 
 
 		 243 aa  163  3e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4872  hypothetical protein  41.32 
 
 		 271 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1774  periplasmic or secreted lipoprotein  34.26 
 
 		 255 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0221772  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2966  periplasmic or secreted lipoprotein OsmY  34.07 
 
 		 219 aa  119  3e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000230813  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6692  transport-associated  24.34 
 
 		 543 aa  60.8  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0414  OsmY domain-containing protein  28.44 
 
 		 215 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2660  putative phospholipid-binding protein  27.91 
 
 		 237 aa  53.5  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2956  transport-associated protein  32.58 
 
 		 295 aa  53.1  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1063  OsmY domain-containing protein  27.91 
 
 		 215 aa  53.1  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2613  transport-associated  28.93 
 
 		 214 aa  52.8  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.574258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3634  transport-associated  38.26 
 
 		 228 aa  52.4  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000681524 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2622  transport-associated  28.99 
 
 		 215 aa  52.4  0.000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0140  putative phospholipid-binding protein  27.44 
 
 		 237 aa  52  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3886  transport-associated  36.28 
 
 		 214 aa  52  0.000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.121  normal  0.085803 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1280  OsmY domain-containing protein  27.44 
 
 		 215 aa  51.6  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.84893  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0116  OsmY domain-containing protein  27.44 
 
 		 215 aa  51.6  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.567152  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2802  putative phospholipid-binding protein  27.44 
 
 		 215 aa  51.6  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2185  transport-associated  28.33 
 
 		 255 aa  50.8  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7765  Smc22-1 ( osmotically inducible sensory protein)  25.42 
 
 		 217 aa  50.8  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.705157  normal  0.17558 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4565  transport-associated  26.01 
 
 		 217 aa  49.3  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.192769 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4432  transport-associated  26.01 
 
 		 217 aa  49.3  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3328  transport-associated  25 
 
 		 217 aa  48.5  0.00008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.686073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5879  transport-associated protein  28.5 
 
 		 215 aa  47.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0826  transport-associated  29.68 
 
 		 245 aa  47.8  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0362569 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1220  transport-associated protein  28.29 
 
 		 214 aa  47  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0425  transport-associated  31.86 
 
 		 214 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.379914  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0189  hypothetical protein  33.04 
 
 		 215 aa  45.4  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.193269 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0186  hypothetical protein  34.65 
 
 		 217 aa  45.4  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.117611 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0453  OsmY domain-containing protein  38.03 
 
 		 197 aa  45.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584382  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6209  transport-associated  27.01 
 
 		 215 aa  45.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.716513 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0194  transport-associated protein  26.09 
 
 		 173 aa  44.7  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0264  transport-associated  32.26 
 
 		 187 aa  45.1  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.47721  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7783  putative osmotically-inducible protein Y (precursor)  23.66 
 
 		 220 aa  44.3  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.379132  normal  0.155349 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1868  transport-associated  25.61 
 
 		 216 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.882392  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3808  transport-associated  27.16 
 
 		 216 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3555  putative phophoslipid binding protein  27.78 
 
 		 188 aa  44.3  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4234  transport-associated  26.99 
 
 		 215 aa  43.5  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.855371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0177  transport-associated  24.89 
 
 		 276 aa  43.5  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4815  periplasmic protein  28.48 
 
 		 205 aa  43.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4969  periplasmic protein  28.48 
 
 		 205 aa  43.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4882  periplasmic protein  28.48 
 
 		 205 aa  43.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0715597  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4976  periplasmic protein  28.48 
 
 		 205 aa  43.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.163142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4917  periplasmic protein  28.48 
 
 		 205 aa  43.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.292031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1025  OsmY domain-containing protein  36.62 
 
 		 197 aa  43.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0155  OsmY domain-containing protein  36.62 
 
 		 216 aa  43.1  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1111  transport-associated  25.47 
 
 		 226 aa  43.1  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1324  OsmY domain-containing protein  36.62 
 
 		 216 aa  43.1  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5932  transport-associated protein  27.34 
 
 		 216 aa  42.7  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2759  putative phospholipid-binding protein  36.62 
 
 		 216 aa  43.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2616  putative phospholipid-binding protein  36.62 
 
 		 216 aa  43.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0180  OsmY domain-containing protein  36.62 
 
 		 216 aa  43.1  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2052  transport-associated protein  35.82 
 
 		 139 aa  42.7  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0353  phospholipid binding protein  27.35 
 
 		 216 aa  42.4  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3632  periplasmic protein  27.27 
 
 		 204 aa  42.4  0.007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0836  periplasmic protein  27.27 
 
 		 204 aa  42.4  0.007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3503  periplasmic protein  27.27 
 
 		 204 aa  42.4  0.007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0262  transport-associated protein  27.67 
 
 		 279 aa  42  0.008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2437  CBS domain containing protein  32.09 
 
 		 628 aa  41.6  0.01  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000875184  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>