34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4872 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4872  hypothetical protein  100 
 
 		 271 aa  542  1e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4370  transport-associated protein  80.66 
 
 		 243 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2836  transport-associated  42.19 
 
 		 240 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0421  transport-associated protein  39.75 
 
 		 241 aa  157  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0727  transport-associated protein  40.93 
 
 		 240 aa  156  3e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3274  transport-associated protein  41.32 
 
 		 240 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0986  transport-associated  38.84 
 
 		 240 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1774  periplasmic or secreted lipoprotein  36.25 
 
 		 255 aa  149  5e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0221772  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1367  periplasmic or secreted lipoprotein  39.84 
 
 		 245 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.487396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1978  transport-associated protein  34.85 
 
 		 241 aa  123  4e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2966  periplasmic or secreted lipoprotein OsmY  33.49 
 
 		 219 aa  93.2  5e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000230813  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1664  hypothetical protein  25.11 
 
 		 215 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0800901  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6692  transport-associated  28.57 
 
 		 543 aa  48.1  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0262  transport-associated protein  26.41 
 
 		 279 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0333  hypothetical protein  26.84 
 
 		 279 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7765  Smc22-1 ( osmotically inducible sensory protein)  28.97 
 
 		 217 aa  47.4  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.705157  normal  0.17558 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0826  transport-associated  25.65 
 
 		 245 aa  48.1  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0362569 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3634  transport-associated  28.02 
 
 		 228 aa  47  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000681524 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0186  hypothetical protein  30.15 
 
 		 217 aa  46.6  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.117611 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2553  hypothetical protein  31.34 
 
 		 278 aa  45.8  0.0007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1784  transport-associated  31.34 
 
 		 275 aa  45.8  0.0008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0010501  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1220  transport-associated protein  31.3 
 
 		 214 aa  45.4  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7783  putative osmotically-inducible protein Y (precursor)  31.36 
 
 		 220 aa  45.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.379132  normal  0.155349 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6897  transport-associated  28.04 
 
 		 217 aa  45.4  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.35821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2622  transport-associated  26.22 
 
 		 215 aa  45.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0258  histidine kinase  28.57 
 
 		 222 aa  44.3  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.469068 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3328  transport-associated  31.93 
 
 		 217 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.686073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2613  transport-associated  28.81 
 
 		 214 aa  43.9  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.574258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5932  transport-associated protein  24.89 
 
 		 216 aa  43.9  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4432  transport-associated  26.39 
 
 		 217 aa  43.5  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4565  transport-associated  26.39 
 
 		 217 aa  43.5  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.192769 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0189  hypothetical protein  24.77 
 
 		 215 aa  42.7  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.193269 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2077  transport-associated  28.69 
 
 		 307 aa  42.7  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.735501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1909  transport-associated  31.62 
 
 		 215 aa  42  0.009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.966808  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>