174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6692 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_6692  transport-associated  100 
 
 
543 aa  1081    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7783  putative osmotically-inducible protein Y (precursor)  29.22 
 
 
220 aa  93.2  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.379132  normal  0.155349 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6897  transport-associated  32.02 
 
 
217 aa  87.4  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.35821  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0139  transport-associated protein  32.74 
 
 
223 aa  84  0.000000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2613  transport-associated  29.92 
 
 
214 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.574258  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7765  Smc22-1 ( osmotically inducible sensory protein)  28.05 
 
 
217 aa  79.7  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.705157  normal  0.17558 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5932  transport-associated protein  30.29 
 
 
216 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3604  hypothetical protein  30.99 
 
 
215 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.984998  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3328  transport-associated  32.44 
 
 
217 aa  77  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.686073  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0425  transport-associated  33.01 
 
 
214 aa  76.3  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.379914  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3886  transport-associated  32.04 
 
 
214 aa  74.3  0.000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.121  normal  0.085803 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0189  hypothetical protein  32.04 
 
 
215 aa  73.6  0.000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.193269 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2264  transport-associated  30.32 
 
 
216 aa  72.8  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2622  transport-associated  30.7 
 
 
215 aa  72.4  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0186  hypothetical protein  29.82 
 
 
217 aa  70.9  0.00000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.117611 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0390  transport-associated  28.38 
 
 
217 aa  69.3  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1868  transport-associated  26.34 
 
 
216 aa  68.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.882392  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2300  transport-associated  29.26 
 
 
217 aa  68.9  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.53534  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4234  transport-associated  27.57 
 
 
215 aa  69.3  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.855371  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1784  transport-associated  25.63 
 
 
275 aa  68.6  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0010501  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4429  transport-associated  28.69 
 
 
215 aa  68.2  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2660  putative phospholipid-binding protein  29.2 
 
 
237 aa  68.2  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0140  putative phospholipid-binding protein  29.2 
 
 
237 aa  68.2  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4562  transport-associated  28.69 
 
 
215 aa  68.2  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.266043 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0177  transport-associated  30.67 
 
 
276 aa  67.8  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1226  transport-associated protein  27.43 
 
 
217 aa  67.4  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.528686  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3808  transport-associated  25.93 
 
 
216 aa  67.4  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2077  transport-associated  24.45 
 
 
307 aa  67.4  0.0000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.735501  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0431  transport-associated  29.18 
 
 
215 aa  67  0.0000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.390186  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6209  transport-associated  28.89 
 
 
215 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.716513 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0116  OsmY domain-containing protein  29.71 
 
 
215 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.567152  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1220  transport-associated protein  31.28 
 
 
214 aa  66.2  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1063  OsmY domain-containing protein  29.71 
 
 
215 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0421  transport-associated protein  27.03 
 
 
241 aa  66.6  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4565  transport-associated  26.99 
 
 
217 aa  66.6  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.192769 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4432  transport-associated  26.99 
 
 
217 aa  66.6  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1280  OsmY domain-containing protein  29.71 
 
 
215 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.84893  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2802  putative phospholipid-binding protein  29.71 
 
 
215 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0727  transport-associated protein  27.53 
 
 
240 aa  66.6  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5578  transport-associated  27.31 
 
 
217 aa  65.1  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00026661  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0353  phospholipid binding protein  33.33 
 
 
216 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3022  transport-associated  32.14 
 
 
158 aa  64.7  0.000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.631889  normal  0.200341 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3859  transport-associated protein  25.93 
 
 
216 aa  64.3  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.790334 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3634  transport-associated  30.87 
 
 
228 aa  64.3  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000681524 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4061  transport-associated  38.57 
 
 
213 aa  63.9  0.000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.221026  normal  0.208315 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2606  transport-associated  27.19 
 
 
216 aa  63.5  0.000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0213477  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0262  transport-associated protein  26.29 
 
 
279 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2261  transport-associated  29.25 
 
 
282 aa  63.2  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2456  transport-associated  28.85 
 
 
215 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.262468  normal  0.570841 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1151  transport-associated protein  31.21 
 
 
141 aa  62.4  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2966  periplasmic or secreted lipoprotein OsmY  27.78 
 
 
219 aa  62.8  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000230813  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5879  transport-associated protein  28 
 
 
215 aa  62  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0417  transport-associated  27.19 
 
 
216 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.421605  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0149  transport-associated  26.61 
 
 
273 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.798997 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7784  putative osmotically inducible protein Y precursor  30.96 
 
 
217 aa  62.8  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0602659  normal  0.220051 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0414  OsmY domain-containing protein  31.55 
 
 
215 aa  62  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2881  transport-associated  31.11 
 
 
216 aa  61.6  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1491  transport-associated  24.69 
 
 
216 aa  61.2  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0151  transport-associated  26.92 
 
 
273 aa  60.8  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1108  transport-associated  30.29 
 
 
216 aa  60.1  0.00000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0333  hypothetical protein  23.94 
 
 
279 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1664  hypothetical protein  23.98 
 
 
215 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0800901  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5094  transport-associated  25.75 
 
 
273 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0983587  normal  0.219919 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1111  transport-associated  31.25 
 
 
226 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177622  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0134  transport-associated protein  26.07 
 
 
273 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.892998  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2836  transport-associated  26.22 
 
 
240 aa  59.3  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2553  hypothetical protein  24.89 
 
 
278 aa  57  0.0000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1200  transport-associated  31.74 
 
 
217 aa  56.6  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.649848  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1892  putative phophoslipid binding protein  26.23 
 
 
216 aa  55.5  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.953866 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2956  transport-associated protein  21.9 
 
 
295 aa  55.1  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4370  transport-associated protein  29.06 
 
 
243 aa  55.1  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0535  periplasmic protein  31.65 
 
 
205 aa  54.7  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.388761  hitchhiker  0.00819185 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0986  transport-associated  22.85 
 
 
240 aa  54.3  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6189  transport-associated  28.64 
 
 
216 aa  54.3  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.551844  normal  0.435123 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1774  periplasmic or secreted lipoprotein  27.35 
 
 
255 aa  53.5  0.000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0221772  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1870  periplasmic phospholipid binding protein  29.81 
 
 
216 aa  53.5  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.388852  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0826  transport-associated  30.5 
 
 
245 aa  52.4  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0362569 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3274  transport-associated protein  24.34 
 
 
240 aa  52.4  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0454  periplasmic protein  29.66 
 
 
202 aa  52.8  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.390695  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5888  periplasmic protein  30.94 
 
 
201 aa  52.4  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.223121  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0562  transport-associated  36.13 
 
 
300 aa  52.4  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3465  periplasmic protein  32.41 
 
 
202 aa  51.6  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2185  transport-associated  27.91 
 
 
255 aa  52  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4923  periplasmic protein  30.94 
 
 
201 aa  52  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.497608  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4973  periplasmic protein  30.94 
 
 
201 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00297721  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0653  periplasmic protein  29.37 
 
 
204 aa  52  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.335563 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04251  periplasmic protein  30.94 
 
 
201 aa  51.2  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.368391  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1101  transport-associated  30.32 
 
 
216 aa  51.2  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3623  transport-associated  30.94 
 
 
201 aa  51.2  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5912  transport-associated protein  26.57 
 
 
216 aa  51.6  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.203256  normal  0.355197 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04217  hypothetical protein  30.94 
 
 
201 aa  51.2  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.310729  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0453  OsmY domain-containing protein  33.1 
 
 
197 aa  51.2  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584382  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3681  periplasmic protein  30.94 
 
 
201 aa  51.2  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.261916  hitchhiker  0.00179473 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4610  periplasmic protein  30.94 
 
 
201 aa  51.2  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0762495  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1025  OsmY domain-containing protein  31.69 
 
 
197 aa  51.2  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2203  transport-associated  33.12 
 
 
188 aa  51.2  0.00005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.801164  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3585  periplasmic protein  30.82 
 
 
218 aa  51.2  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1899  periplasmic phospholipid binding protein  29.38 
 
 
233 aa  50.8  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.60597 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3297  transport-associated  28.05 
 
 
201 aa  50.8  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.173268  normal  0.854509 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0155  OsmY domain-containing protein  31.69 
 
 
216 aa  50.8  0.00007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>