54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0986 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0986  transport-associated  100 
 
 		 240 aa  478  1e-134  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3274  transport-associated protein  95 
 
 		 240 aa  433  1e-121  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0421  transport-associated protein  56.83 
 
 		 241 aa  261  6e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0727  transport-associated protein  55.93 
 
 		 240 aa  252  3e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2836  transport-associated  50.85 
 
 		 240 aa  229  4e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1978  transport-associated protein  43.1 
 
 		 241 aa  174  8e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1367  periplasmic or secreted lipoprotein  41.8 
 
 		 245 aa  169  3e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.487396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4370  transport-associated protein  38.17 
 
 		 243 aa  157  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4872  hypothetical protein  38.84 
 
 		 271 aa  155  4e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1774  periplasmic or secreted lipoprotein  34.66 
 
 		 255 aa  146  2.0000000000000003e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0221772  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2966  periplasmic or secreted lipoprotein OsmY  33.05 
 
 		 219 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000230813  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0414  OsmY domain-containing protein  27.98 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2660  putative phospholipid-binding protein  27.91 
 
 		 237 aa  54.7  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6692  transport-associated  22.85 
 
 		 543 aa  54.3  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1063  OsmY domain-containing protein  27.91 
 
 		 215 aa  54.3  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0140  putative phospholipid-binding protein  27.44 
 
 		 237 aa  53.1  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0116  OsmY domain-containing protein  27.44 
 
 		 215 aa  52.8  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.567152  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1280  OsmY domain-containing protein  27.44 
 
 		 215 aa  52.8  0.000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.84893  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2802  putative phospholipid-binding protein  27.44 
 
 		 215 aa  52.8  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2622  transport-associated  28.39 
 
 		 215 aa  52.8  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7765  Smc22-1 ( osmotically inducible sensory protein)  25.42 
 
 		 217 aa  50.8  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.705157  normal  0.17558 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4565  transport-associated  27.8 
 
 		 217 aa  50.4  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.192769 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4432  transport-associated  27.8 
 
 		 217 aa  50.4  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3886  transport-associated  34.51 
 
 		 214 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.121  normal  0.085803 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2956  transport-associated protein  33.03 
 
 		 295 aa  49.3  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2185  transport-associated  26.61 
 
 		 255 aa  48.9  0.00007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2613  transport-associated  27.04 
 
 		 214 aa  48.9  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.574258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3328  transport-associated  24.17 
 
 		 217 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.686073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0826  transport-associated  33.33 
 
 		 245 aa  47.4  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0362569 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0425  transport-associated  30.97 
 
 		 214 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.379914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1220  transport-associated protein  28.29 
 
 		 214 aa  47  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2077  transport-associated  22.64 
 
 		 307 aa  43.9  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.735501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6209  transport-associated  25.24 
 
 		 215 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.716513 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0453  OsmY domain-containing protein  39.44 
 
 		 197 aa  43.9  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584382  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0189  hypothetical protein  31.3 
 
 		 215 aa  43.9  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.193269 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3808  transport-associated  25.93 
 
 		 216 aa  43.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5879  transport-associated protein  25.82 
 
 		 215 aa  43.1  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0264  transport-associated  31.45 
 
 		 187 aa  43.1  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.47721  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0186  hypothetical protein  33.61 
 
 		 217 aa  43.1  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.117611 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7783  putative osmotically-inducible protein Y (precursor)  22.32 
 
 		 220 aa  42.7  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.379132  normal  0.155349 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1111  transport-associated  25.93 
 
 		 226 aa  42.7  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0353  phospholipid binding protein  28.25 
 
 		 216 aa  42.4  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4234  transport-associated  26.11 
 
 		 215 aa  42.7  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.855371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2616  putative phospholipid-binding protein  38.03 
 
 		 216 aa  42.4  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1324  OsmY domain-containing protein  38.03 
 
 		 216 aa  42.4  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2759  putative phospholipid-binding protein  38.03 
 
 		 216 aa  42.4  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0155  OsmY domain-containing protein  38.03 
 
 		 216 aa  42.4  0.007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1025  OsmY domain-containing protein  38.03 
 
 		 197 aa  42.4  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0180  OsmY domain-containing protein  38.03 
 
 		 216 aa  42.4  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2052  transport-associated protein  34.33 
 
 		 139 aa  42.4  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1868  transport-associated  24.8 
 
 		 216 aa  42  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.882392  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3555  putative phophoslipid binding protein  26.39 
 
 		 188 aa  42  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5932  transport-associated protein  26.62 
 
 		 216 aa  42  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0454  periplasmic protein  25.62 
 
 		 202 aa  42  0.009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.390695  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>