122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A1025 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A1025  OsmY domain-containing protein  100 
 
 
197 aa  383  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0155  OsmY domain-containing protein  100 
 
 
216 aa  334  3.9999999999999995e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1324  OsmY domain-containing protein  100 
 
 
216 aa  334  3.9999999999999995e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2759  putative phospholipid-binding protein  100 
 
 
216 aa  334  3.9999999999999995e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2616  putative phospholipid-binding protein  100 
 
 
216 aa  334  3.9999999999999995e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0180  OsmY domain-containing protein  100 
 
 
216 aa  334  3.9999999999999995e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0453  OsmY domain-containing protein  95.43 
 
 
197 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584382  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5912  transport-associated protein  71.43 
 
 
216 aa  274  7e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.203256  normal  0.355197 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6189  transport-associated  70.92 
 
 
216 aa  271  4.0000000000000004e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.551844  normal  0.435123 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1108  transport-associated  69.79 
 
 
216 aa  235  3e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1870  periplasmic phospholipid binding protein  63.59 
 
 
216 aa  216  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.388852  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0353  phospholipid binding protein  61.54 
 
 
216 aa  211  4.9999999999999996e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5562  transport-associated  64.1 
 
 
216 aa  202  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.221455  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1220  transport-associated protein  54.92 
 
 
214 aa  184  6e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1111  transport-associated  55.9 
 
 
226 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177622  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0189  hypothetical protein  51.3 
 
 
215 aa  179  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.193269 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1101  transport-associated  51.28 
 
 
216 aa  178  4.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4429  transport-associated  51.79 
 
 
215 aa  177  7e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4562  transport-associated  51.79 
 
 
215 aa  177  7e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.266043 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1892  putative phophoslipid binding protein  51.28 
 
 
216 aa  175  5e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.953866 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5932  transport-associated protein  50.26 
 
 
216 aa  171  5e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5544  transport-associated  47.57 
 
 
216 aa  164  8e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.078197  normal  0.764141 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2622  transport-associated  47.69 
 
 
215 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0431  transport-associated  49.23 
 
 
215 aa  153  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.390186  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1226  transport-associated protein  41.54 
 
 
217 aa  142  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.528686  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4234  transport-associated  43.88 
 
 
215 aa  141  8e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.855371  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1200  transport-associated  46.15 
 
 
217 aa  140  9.999999999999999e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.649848  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2300  transport-associated  44.62 
 
 
217 aa  140  9.999999999999999e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.53534  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0414  OsmY domain-containing protein  46.67 
 
 
215 aa  139  3e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0140  putative phospholipid-binding protein  47.18 
 
 
237 aa  139  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0116  OsmY domain-containing protein  47.18 
 
 
215 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.567152  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1280  OsmY domain-containing protein  47.18 
 
 
215 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.84893  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2802  putative phospholipid-binding protein  47.18 
 
 
215 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4432  transport-associated  41.97 
 
 
217 aa  137  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4565  transport-associated  41.97 
 
 
217 aa  137  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.192769 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2660  putative phospholipid-binding protein  46.67 
 
 
237 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1063  OsmY domain-containing protein  46.67 
 
 
215 aa  136  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0204  hypothetical protein  42.05 
 
 
219 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0390  transport-associated  39.59 
 
 
217 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3328  transport-associated  43.09 
 
 
217 aa  135  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.686073  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2264  transport-associated  40.82 
 
 
216 aa  134  8e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6209  transport-associated  43.59 
 
 
215 aa  132  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.716513 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3808  transport-associated  43.3 
 
 
216 aa  132  5e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5578  transport-associated  44.57 
 
 
217 aa  130  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00026661  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1899  periplasmic phospholipid binding protein  46.51 
 
 
233 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.60597 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5879  transport-associated protein  42.56 
 
 
215 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3886  transport-associated  43.37 
 
 
214 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.121  normal  0.085803 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2613  transport-associated  42.86 
 
 
214 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.574258  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0186  hypothetical protein  40.41 
 
 
217 aa  129  3e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.117611 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3604  hypothetical protein  41.03 
 
 
215 aa  129  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.984998  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1491  transport-associated  43.08 
 
 
216 aa  127  8.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3859  transport-associated protein  43.88 
 
 
216 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.790334 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7765  Smc22-1 ( osmotically inducible sensory protein)  40.51 
 
 
217 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.705157  normal  0.17558 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2881  transport-associated  42.78 
 
 
216 aa  124  8.000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0139  transport-associated protein  41.36 
 
 
223 aa  124  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1868  transport-associated  41.9 
 
 
216 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.882392  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7783  putative osmotically-inducible protein Y (precursor)  38.66 
 
 
220 aa  122  5e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.379132  normal  0.155349 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2456  transport-associated  38.46 
 
 
215 aa  121  7e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.262468  normal  0.570841 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1909  transport-associated  42.86 
 
 
215 aa  121  8e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.966808  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1664  hypothetical protein  36.92 
 
 
215 aa  120  9e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0800901  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1151  transport-associated protein  49.28 
 
 
141 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0425  transport-associated  39.29 
 
 
214 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.379914  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0417  transport-associated  43.3 
 
 
216 aa  114  7.999999999999999e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.421605  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3634  transport-associated  42.63 
 
 
228 aa  114  8.999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000681524 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2606  transport-associated  43.81 
 
 
216 aa  114  8.999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0213477  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7784  putative osmotically inducible protein Y precursor  42.94 
 
 
217 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0602659  normal  0.220051 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6897  transport-associated  36.56 
 
 
217 aa  107  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.35821  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6056  transport-associated  39.57 
 
 
226 aa  102  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.822447  hitchhiker  0.00012166 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6133  transport-associated  42.86 
 
 
178 aa  99.8  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4061  transport-associated  41.99 
 
 
213 aa  99.4  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.221026  normal  0.208315 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7774  hypothetical protein  32.35 
 
 
203 aa  82  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.194796  normal  0.37862 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1784  transport-associated  28 
 
 
275 aa  67  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0010501  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2553  hypothetical protein  29.33 
 
 
278 aa  60.5  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6692  transport-associated  31.58 
 
 
543 aa  58.9  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001941  putative hyperosmotically inducible periplasmic protein  29.08 
 
 
183 aa  55.8  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0177  transport-associated  28.97 
 
 
276 aa  54.7  0.0000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4133  transport-associated  28.78 
 
 
188 aa  53.9  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3707  transport-associated  30.4 
 
 
181 aa  52.8  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.101636  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1415  transport-associated  30.58 
 
 
184 aa  51.6  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2185  transport-associated  27 
 
 
255 aa  51.2  0.000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1317  transport-associated  29.75 
 
 
181 aa  51.2  0.000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2676  transport-associated  32.08 
 
 
182 aa  50.8  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2744  transport-associated  31.13 
 
 
182 aa  50.8  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2851  transport-associated  32.08 
 
 
182 aa  50.8  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.884447 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0826  transport-associated  32 
 
 
245 aa  50.8  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0362569 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01237  putative hyperosmotically inducible periplasmic protein  28.38 
 
 
175 aa  49.3  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.315155  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2956  transport-associated protein  26.6 
 
 
295 aa  49.3  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2261  transport-associated  30.2 
 
 
282 aa  49.3  0.00004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3502  transport-associated  46.38 
 
 
108 aa  49.3  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.260556  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1978  transport-associated protein  40.32 
 
 
241 aa  48.9  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2077  transport-associated  26.43 
 
 
307 aa  48.5  0.00006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.735501  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3809  transport-associated  52.83 
 
 
108 aa  48.5  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.810583  normal  0.967769 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3995  transport-associated  29.03 
 
 
182 aa  48.1  0.00008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000543546  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1774  periplasmic or secreted lipoprotein  26.89 
 
 
255 aa  46.6  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0221772  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3600  transport-associated  29.2 
 
 
175 aa  47  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1310  transport-associated  28.36 
 
 
179 aa  47  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0905482  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1637  transport-associated  32.85 
 
 
229 aa  46.6  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0588013 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0727  transport-associated protein  26.77 
 
 
240 aa  45.8  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5938  transport-associated  34.31 
 
 
124 aa  45.1  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.483865  normal  0.018454 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0653  periplasmic protein  29.45 
 
 
204 aa  45.1  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.335563 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>