37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3555 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_3555  putative phophoslipid binding protein  100 
 
 		 188 aa  370  1e-102  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7765  Smc22-1 ( osmotically inducible sensory protein)  34.43 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.705157  normal  0.17558 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0562  transport-associated  33.33 
 
 		 300 aa  51.2  0.000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0425  hypothetical protein  28.35 
 
 		 183 aa  49.7  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0449  hypothetical protein  27.32 
 
 		 183 aa  48.1  0.00007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7784  putative osmotically inducible protein Y precursor  31.71 
 
 		 217 aa  48.1  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0602659  normal  0.220051 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2264  transport-associated  26.36 
 
 		 216 aa  46.6  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1151  transport-associated protein  26.45 
 
 		 141 aa  45.8  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6692  transport-associated  30.23 
 
 		 543 aa  45.4  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1220  transport-associated protein  26.23 
 
 		 214 aa  45.4  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2185  transport-associated  31.3 
 
 		 255 aa  45.4  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3328  transport-associated  28.69 
 
 		 217 aa  45.1  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.686073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4973  periplasmic protein  26.26 
 
 		 201 aa  44.7  0.0008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00297721  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4923  periplasmic protein  26.26 
 
 		 201 aa  44.7  0.0008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.497608  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3585  periplasmic protein  30.08 
 
 		 218 aa  43.9  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1868  transport-associated  29.27 
 
 		 216 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.882392  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0189  hypothetical protein  28.23 
 
 		 215 aa  43.5  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.193269 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0875  transport-associated  35.71 
 
 		 104 aa  43.5  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.647487  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0454  periplasmic protein  30.23 
 
 		 202 aa  43.5  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.390695  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4562  transport-associated  25.6 
 
 		 215 aa  43.1  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.266043 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4429  transport-associated  25.6 
 
 		 215 aa  43.1  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3681  periplasmic protein  25.76 
 
 		 201 aa  43.1  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.261916  hitchhiker  0.00179473 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3623  transport-associated  25.76 
 
 		 201 aa  43.1  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04217  hypothetical protein  25.76 
 
 		 201 aa  43.1  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.310729  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4133  transport-associated  30.94 
 
 		 188 aa  42.7  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1805  transport-associated protein  34.33 
 
 		 106 aa  42.7  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4610  periplasmic protein  25.76 
 
 		 201 aa  43.1  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0762495  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04251  periplasmic protein  25.76 
 
 		 201 aa  43.1  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.368391  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1415  transport-associated  30.71 
 
 		 184 aa  42.7  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4370  transport-associated protein  27.82 
 
 		 243 aa  42  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0916  transport-associated  35.71 
 
 		 104 aa  42.4  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3808  transport-associated  27.27 
 
 		 216 aa  41.6  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0986  transport-associated  26.39 
 
 		 240 aa  41.6  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5888  periplasmic protein  25.76 
 
 		 201 aa  41.6  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.223121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5932  transport-associated protein  23.53 
 
 		 216 aa  41.2  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4039  transport-associated protein  38.57 
 
 		 156 aa  41.2  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.130048  normal  0.0885216 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7783  putative osmotically-inducible protein Y (precursor)  26.27 
 
 		 220 aa  41.2  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.379132  normal  0.155349 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>