91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp0449 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp0449  hypothetical protein  100 
 
 
183 aa  365  1e-100  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0425  hypothetical protein  97.8 
 
 
183 aa  357  5e-98  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0836  periplasmic protein  33.54 
 
 
204 aa  79  0.00000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3632  periplasmic protein  33.54 
 
 
204 aa  79.3  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3503  periplasmic protein  33.54 
 
 
204 aa  79.3  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0653  periplasmic protein  31.65 
 
 
204 aa  74.3  0.0000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0454  periplasmic protein  33.11 
 
 
202 aa  69.3  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.390695  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3585  periplasmic protein  33.54 
 
 
218 aa  68.6  0.00000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4919  periplasmic protein  25.64 
 
 
201 aa  67.4  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.618733  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0535  periplasmic protein  29.49 
 
 
205 aa  67  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.388761  hitchhiker  0.00819185 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3623  transport-associated  28.48 
 
 
201 aa  65.9  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04217  hypothetical protein  28.48 
 
 
201 aa  65.9  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.310729  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4923  periplasmic protein  28.48 
 
 
201 aa  66.2  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.497608  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3681  periplasmic protein  28.48 
 
 
201 aa  65.9  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.261916  hitchhiker  0.00179473 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4610  periplasmic protein  28.48 
 
 
201 aa  65.9  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0762495  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4973  periplasmic protein  28.48 
 
 
201 aa  66.2  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00297721  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04251  periplasmic protein  28.48 
 
 
201 aa  65.9  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.368391  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4976  periplasmic protein  29.88 
 
 
205 aa  65.5  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.163142  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4917  periplasmic protein  29.88 
 
 
205 aa  65.5  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.292031  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4969  periplasmic protein  29.88 
 
 
205 aa  65.5  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4815  periplasmic protein  29.88 
 
 
205 aa  65.5  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4882  periplasmic protein  29.88 
 
 
205 aa  65.5  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0715597  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5888  periplasmic protein  28.48 
 
 
201 aa  65.1  0.0000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.223121  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0552  periplasmic protein  31.13 
 
 
202 aa  61.6  0.000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.783524  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3465  periplasmic protein  30 
 
 
202 aa  60.5  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0177  transport-associated  40.79 
 
 
276 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1193  transport-associated protein  29.68 
 
 
199 aa  60.1  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1195  transport-associated protein  30.19 
 
 
192 aa  59.3  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2261  transport-associated  28.48 
 
 
282 aa  58.2  0.00000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0073  transport-associated  33.55 
 
 
196 aa  58.2  0.00000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3297  transport-associated  27.1 
 
 
201 aa  53.5  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.173268  normal  0.854509 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2956  transport-associated protein  27.52 
 
 
295 aa  52.8  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2170  transport-associated  41.18 
 
 
104 aa  52  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.395466  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2682  transport-associated protein  40 
 
 
116 aa  50.8  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0477  transport-associated  39.39 
 
 
103 aa  50.8  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0262  transport-associated protein  38.03 
 
 
279 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0333  hypothetical protein  36.62 
 
 
279 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62690  hypothetical protein  32.29 
 
 
114 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5456  hypothetical protein  32.29 
 
 
114 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.469146  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2076  transport-associated protein  49.21 
 
 
107 aa  49.7  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.585071  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1784  transport-associated  27.04 
 
 
275 aa  48.9  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0010501  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0874  transport-associated  40 
 
 
163 aa  48.9  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.586964 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2837  transport-associated  35.63 
 
 
104 aa  48.1  0.00007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.47962  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3514  transport-associated  35.63 
 
 
104 aa  48.1  0.00008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2175  osmotically inducible periplasmic protein  39.71 
 
 
166 aa  47.8  0.00009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.17152  normal  0.224433 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0010  transport-associated  34.44 
 
 
101 aa  47  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3587  transport-associated  22.84 
 
 
191 aa  46.6  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2622  transport-associated  24.18 
 
 
215 aa  47  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2047  transport-associated protein  34.72 
 
 
104 aa  46.2  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.186123  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3555  putative phophoslipid binding protein  29.17 
 
 
188 aa  46.2  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3022  transport-associated  40.32 
 
 
158 aa  46.2  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.631889  normal  0.200341 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1805  transport-associated protein  30.68 
 
 
106 aa  46.2  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5303  transport-associated  31.87 
 
 
112 aa  45.8  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.320232  normal  0.0505821 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5156  transport-associated protein  36 
 
 
115 aa  46.2  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.609853 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6692  transport-associated  30.11 
 
 
543 aa  45.8  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1123  hypothetical protein  26.83 
 
 
191 aa  45.1  0.0006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1788  transport-associated  29.47 
 
 
103 aa  45.1  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0663263  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0950  transport-associated  33.75 
 
 
171 aa  44.7  0.0007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.239728  normal  0.788848 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1094  transport-associated  33.75 
 
 
171 aa  44.7  0.0007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0916  transport-associated  38.1 
 
 
104 aa  45.1  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3627  hypothetical protein  25.81 
 
 
190 aa  44.7  0.0008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4175  transport-associated protein  37.33 
 
 
117 aa  44.7  0.0008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5244  transport-associated  33.33 
 
 
116 aa  44.7  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.797989  normal  0.73518 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3412  transport-associated  33.33 
 
 
116 aa  44.7  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1446  transport-associated  34.21 
 
 
125 aa  43.9  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.609395  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43670  Transport-associated protein  34.18 
 
 
120 aa  44.3  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.226738  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0258  histidine kinase  38.03 
 
 
222 aa  43.9  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.469068 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1200  transport-associated  23.23 
 
 
217 aa  43.9  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.649848  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0589  phospholipid-binding domain-containing protein  27.75 
 
 
183 aa  44.3  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2553  hypothetical protein  24.84 
 
 
278 aa  43.9  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3604  hypothetical protein  30.83 
 
 
215 aa  43.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.984998  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2274  transport-associated  42.11 
 
 
150 aa  43.1  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.431584  normal  0.766565 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3867  transport-associated  33.33 
 
 
104 aa  43.1  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1642  putative periplasmic protein  37.7 
 
 
144 aa  43.1  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0830703  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1600  transport-associated  42.11 
 
 
150 aa  43.1  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3603  transport-associated  35.71 
 
 
116 aa  42.7  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.335448  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4039  transport-associated protein  40.32 
 
 
156 aa  42.7  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.130048  normal  0.0885216 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5094  transport-associated  23.16 
 
 
273 aa  42.4  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0983587  normal  0.219919 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2251  transport-associated  33.71 
 
 
103 aa  42.4  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0930  transport-associated  27.46 
 
 
192 aa  42.4  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2185  transport-associated  25.95 
 
 
255 aa  42  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1322  transport-associated protein  26.88 
 
 
192 aa  42  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4402  transport-associated  26.88 
 
 
192 aa  42  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.148625 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4526  transport-associated  26.88 
 
 
192 aa  42  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1501  transport-associated protein  30.43 
 
 
104 aa  41.6  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1151  transport-associated protein  29.6 
 
 
141 aa  41.6  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1939  phospholipid-binding domain-containing protein  33.85 
 
 
104 aa  41.6  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.315443  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2048  transport-associated  33.85 
 
 
104 aa  41.6  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2319  phospholipid-binding domain-containing protein  33.85 
 
 
104 aa  41.6  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4115  transport-associated  41.27 
 
 
166 aa  40.8  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1119  transport-associated  35.79 
 
 
104 aa  40.8  0.01  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.777172 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>